More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1629 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_1629  multi-component transcriptional regulator  100 
 
 		 613 aa  1238    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.703021  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1723  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  47.39 
 
 		 597 aa  554  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000776738 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4548  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  42.76 
 
 		 614 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2752  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  42.67 
 
 		 799 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3668  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.79 
 
 		 635 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3722  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.64 
 
 		 635 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.940611  normal  0.125775 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2421  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.9 
 
 		 684 aa  291  3e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243595 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  39.23 
 
 		 1629 aa  288  2.9999999999999996e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2941  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  34.04 
 
 		 652 aa  282  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1445  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.31 
 
 		 225 aa  253  7e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1416  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.31 
 
 		 225 aa  253  7e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4222  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.95 
 
 		 224 aa  249  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0163  multi-component transcriptional regulator  37.57 
 
 		 725 aa  248  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.892768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.61 
 
 		 224 aa  247  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4261  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.5 
 
 		 224 aa  246  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.906422  normal  0.0109867 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4228  winged helix family two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 509 aa  236  9e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.290807  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5018  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.66 
 
 		 226 aa  233  6e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4085  two component transcriptional regulator  52.47 
 
 		 225 aa  224  4.9999999999999996e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0151  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.66 
 
 		 796 aa  222  1.9999999999999999e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0705209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2927  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.43 
 
 		 224 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3139  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.9 
 
 		 676 aa  202  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.990746 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.28 
 
 		 234 aa  200  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0298  winged helix family two component transcriptional regulator  51.57 
 
 		 230 aa  200  7.999999999999999e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.88518  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3505  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 665 aa  190  5e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  40.76 
 
 		 283 aa  184  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.04 
 
 		 231 aa  182  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  41.89 
 
 		 222 aa  182  1e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  43.91 
 
 		 236 aa  179  9e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1291  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.81 
 
 		 222 aa  179  1e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4347  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 		 236 aa  179  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.78 
 
 		 224 aa  178  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  41.23 
 
 		 240 aa  177  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.14 
 
 		 224 aa  177  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  44.25 
 
 		 228 aa  177  7e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0994  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.11 
 
 		 227 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.337893  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1247  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.34 
 
 		 235 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.464606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0440  two component transcriptional regulator  40.62 
 
 		 225 aa  174  3.9999999999999995e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.747409  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11471  two-component response regulator, phosphate  38.96 
 
 		 245 aa  174  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0202491 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  41.56 
 
 		 231 aa  174  5.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  42.41 
 
 		 235 aa  173  6.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.24 
 
 		 225 aa  173  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0990  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.01 
 
 		 222 aa  173  7.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000957791  decreased coverage  0.0000715536 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.26 
 
 		 225 aa  172  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1447  two component transcriptional regulator  42.04 
 
 		 224 aa  172  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0595481 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.44 
 
 		 225 aa  172  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0485  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  40.17 
 
 		 244 aa  171  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773776  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 230 aa  171  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 230 aa  171  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 230 aa  171  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1341  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.78 
 
 		 226 aa  171  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4783  two component transcriptional regulator  41.26 
 
 		 225 aa  171  5e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000784885  unclonable  0.00000000984925 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  42.99 
 
 		 224 aa  170  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1012  two component transcriptional regulator  39.22 
 
 		 257 aa  170  6e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.658807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  41.13 
 
 		 231 aa  170  6e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4055  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  42.29 
 
 		 226 aa  169  9e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  43.05 
 
 		 224 aa  169  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1205  two component transcriptional regulator  39.46 
 
 		 222 aa  169  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 228 aa  169  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  38.57 
 
 		 219 aa  169  2e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0436  two component transcriptional regulator  38.1 
 
 		 245 aa  168  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.18923  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  42.53 
 
 		 224 aa  168  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1212  two component transcriptional regulator  40.44 
 
 		 232 aa  168  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0899901  normal  0.616229 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  39.46 
 
 		 224 aa  169  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1441  two component transcriptional regulator  39.74 
 
 		 247 aa  168  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167327  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  39.38 
 
 		 227 aa  169  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1480  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.01 
 
 		 219 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  39.01 
 
 		 223 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  37.19 
 
 		 246 aa  168  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  39.39 
 
 		 237 aa  168  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0669  two component transcriptional regulator  41.15 
 
 		 253 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.193178 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2177  response regulator receiver protein  37.95 
 
 		 223 aa  168  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00323539  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4392  two component transcriptional regulator  40.36 
 
 		 225 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0025821  decreased coverage  0.00000564878 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1618  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 254 aa  167  4e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1598  response regulator receiver  40 
 
 		 226 aa  167  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3985  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  42.29 
 
 		 226 aa  167  5e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0293  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 225 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.973428  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0298  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.91 
 
 		 225 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.77813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0286  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 225 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4793  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 225 aa  167  6.9999999999999995e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0604  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 227 aa  167  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00704602  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0632  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 227 aa  167  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1345  response regulator receiver  41.85 
 
 		 227 aa  166  9e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.71904 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4110  two component transcriptional regulator  40.36 
 
 		 225 aa  166  9e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  40.35 
 
 		 230 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0397  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 225 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0294  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 225 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.89 
 
 		 220 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3423  response regulator receiver protein  40.81 
 
 		 224 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3278  two component transcriptional regulator  40.71 
 
 		 253 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0104368 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0097  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 225 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00144432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1620  two component transcriptional regulator  40.89 
 
 		 227 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000174219  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.5 
 
 		 232 aa  166  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.701823  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.46 
 
 		 224 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  40.99 
 
 		 220 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2522  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.36 
 
 		 226 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3105  two component transcriptional regulator  42.27 
 
 		 219 aa  165  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  35.96 
 
 		 238 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3265  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.84 
 
 		 245 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.45002  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.46 
 
 		 224 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.27 
 
 		 234 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>