More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0130 on replicon NC_011885
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011885  Cyan7425_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 234 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  48.72 
 
 		 1629 aa  219  3e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4261  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.19 
 
 		 224 aa  211  7e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.906422  normal  0.0109867 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2752  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  46.32 
 
 		 799 aa  210  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4222  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.19 
 
 		 224 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2941  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  46.15 
 
 		 652 aa  206  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5018  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.75 
 
 		 226 aa  205  6e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4085  two component transcriptional regulator  47.84 
 
 		 225 aa  204  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1445  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.49 
 
 		 225 aa  200  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1416  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.49 
 
 		 225 aa  200  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1723  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  46.55 
 
 		 597 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000776738 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2421  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  48.09 
 
 		 684 aa  198  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243595 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.89 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3668  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.35 
 
 		 635 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0163  multi-component transcriptional regulator  44.07 
 
 		 725 aa  186  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.892768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3722  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.91 
 
 		 635 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.940611  normal  0.125775 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1629  multi-component transcriptional regulator  48.28 
 
 		 613 aa  186  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.703021  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2927  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.16 
 
 		 224 aa  185  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2625  two component transcriptional regulator  42.17 
 
 		 231 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.983258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4548  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  43.72 
 
 		 614 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4228  winged helix family two component transcriptional regulator  42.31 
 
 		 509 aa  174  9.999999999999999e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.290807  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0298  winged helix family two component transcriptional regulator  45.89 
 
 		 230 aa  170  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.88518  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.17 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  39.06 
 
 		 236 aa  169  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.41 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.2 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  40.53 
 
 		 218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  40.43 
 
 		 240 aa  165  5.9999999999999996e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 220 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4549  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.61 
 
 		 221 aa  164  9e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.703481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0950  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.4 
 
 		 238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.79 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3105  two component transcriptional regulator  40.77 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  41.23 
 
 		 228 aa  162  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 222 aa  162  4.0000000000000004e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3674  two component transcriptional regulator  40.34 
 
 		 219 aa  161  7e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3626  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.83 
 
 		 231 aa  161  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2487  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.83 
 
 		 231 aa  161  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  38.63 
 
 		 227 aa  161  9e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2384  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23421  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  39.39 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03590  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  39.66 
 
 		 226 aa  159  2e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0594239 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  39.39 
 
 		 224 aa  159  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.77 
 
 		 225 aa  159  4e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1620  two component transcriptional regulator  39.66 
 
 		 227 aa  159  4e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000174219  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0293  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.83 
 
 		 226 aa  158  7e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591061  normal  0.658536 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1142  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.2 
 
 		 227 aa  158  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 237 aa  157  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1447  two component transcriptional regulator  41.81 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0595481 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.6 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3923  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.26 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  37.83 
 
 		 223 aa  156  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2647  response regulator receiver domain-containing protein  39.45 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.629356 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.34 
 
 		 233 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3019  two component transcriptional regulator  39.65 
 
 		 220 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933394  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2713  DNA-binding response regulator  39.21 
 
 		 220 aa  155  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.20215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2076  OmpR family two-component transcriptional regulator  37.34 
 
 		 224 aa  155  3e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000231542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5326  two component transcriptional regulator  37.55 
 
 		 235 aa  156  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1544  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.97 
 
 		 237 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1132  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  39.22 
 
 		 227 aa  156  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.12057  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3039  two component transcriptional regulator  38.77 
 
 		 220 aa  155  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1291  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.52 
 
 		 222 aa  155  4e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5130  OmpR/winged helix family two component transcriptional regulator  39.48 
 
 		 223 aa  155  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.76336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1940  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.53 
 
 		 219 aa  155  4e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0994  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.48 
 
 		 227 aa  155  4e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.337893  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1212  two component transcriptional regulator  38.03 
 
 		 232 aa  155  6e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0899901  normal  0.616229 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0919  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.93 
 
 		 223 aa  155  6e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2177  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 223 aa  155  6e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00323539  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 220 aa  154  9e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  36.68 
 
 		 225 aa  154  9e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  35.62 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.79 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3309  two component transcriptional regulator  38.77 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0692  two component transcriptional regulator  37.83 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.478389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0057  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.86 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  37.77 
 
 		 230 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0440  two component transcriptional regulator  36.8 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.747409  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  36.17 
 
 		 283 aa  153  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  37.77 
 
 		 230 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  37.77 
 
 		 230 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  36.96 
 
 		 235 aa  152  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  35.62 
 
 		 224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.62 
 
 		 226 aa  152  5e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000154116  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1476  two component transcriptional regulator  37.99 
 
 		 219 aa  152  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1505  response regulator receiver  37.99 
 
 		 219 aa  152  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.404603  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3120  two component transcriptional regulator  40.34 
 
 		 239 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3820  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 221 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1997  winged helix family two component transcriptional regulator  40.26 
 
 		 224 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.981118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.79 
 
 		 234 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3144  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.98 
 
 		 226 aa  151  7e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.549897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0282  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  36.8 
 
 		 230 aa  151  7e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0932199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  35.5 
 
 		 223 aa  151  8e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.48 
 
 		 228 aa  151  8.999999999999999e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  40.61 
 
 		 224 aa  151  8.999999999999999e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02110  two-component response regulator transcription regulator protein  38.27 
 
 		 246 aa  151  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3246  two component transcriptional regulator  38.1 
 
 		 231 aa  150  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000050319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2126  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.26 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.245988  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2190  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.26 
 
 		 219 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10613  two component system DNA binding transcriptional regulatory protein tcrA  38.53 
 
 		 253 aa  150  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000499525  normal  0.750249 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4863  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.18 
 
 		 244 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.494797 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>