More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0840 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0840  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 
196 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.351248  normal  0.247104 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1267  putative PAS/PAC sensor protein  60.16 
 
 
849 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0446298  normal  0.4297 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.32 
 
 
769 aa  157  9e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2107  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.21 
 
 
660 aa  156  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  56.72 
 
 
768 aa  154  8e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.103172  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.36 
 
 
886 aa  150  8e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.257142  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0545  multi-sensor signal transduction histidine kinase  56.35 
 
 
896 aa  149  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91043  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0622  putative PAS/PAC sensor protein  53.17 
 
 
440 aa  148  5e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1607  response regulator receiver domain-containing protein  43.01 
 
 
186 aa  147  9e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.32 
 
 
771 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.12 
 
 
1253 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841858  normal  0.0475592 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.65 
 
 
931 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  55.12 
 
 
789 aa  145  4.0000000000000006e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.78 
 
 
1301 aa  145  5e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.09 
 
 
653 aa  144  8.000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1335  putative PAS/PAC sensor protein  43.2 
 
 
1113 aa  143  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1962  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.88 
 
 
603 aa  144  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.09 
 
 
766 aa  142  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.371468  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.41 
 
 
544 aa  142  4e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.230477  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.58 
 
 
530 aa  141  7e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.34 
 
 
593 aa  141  7e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1293  putative PAS/PAC sensor protein  46.81 
 
 
1265 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0141  putative PAS/PAC sensor protein  50.77 
 
 
837 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00355903 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0642  putative PAS/PAC sensor protein  42.68 
 
 
401 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201186  normal  0.0191068 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.8 
 
 
1078 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.54 
 
 
1439 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.17 
 
 
1426 aa  139  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2464  putative PAS/PAC sensor protein  45.62 
 
 
812 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2026  putative PAS/PAC sensor protein  53.54 
 
 
511 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0685118  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.17 
 
 
1032 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2215  putative PAS/PAC sensor protein  52.34 
 
 
637 aa  138  6e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.245996 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.53 
 
 
500 aa  137  7.999999999999999e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1245  putative PAS/PAC sensor protein  54.4 
 
 
400 aa  137  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.54 
 
 
603 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 
753 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.92 
 
 
608 aa  135  3.0000000000000003e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  47.52 
 
 
524 aa  135  3.0000000000000003e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  54.87 
 
 
873 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1026  putative PAS/PAC sensor protein  48.78 
 
 
559 aa  134  7.000000000000001e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.91 
 
 
656 aa  133  9.999999999999999e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.548294  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.62 
 
 
862 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1792  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.24 
 
 
984 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1755  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.42 
 
 
781 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.12 
 
 
644 aa  131  5e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  46.53 
 
 
878 aa  132  5e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.46 
 
 
765 aa  130  9e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.94 
 
 
1039 aa  130  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.69 
 
 
763 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.926751  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.78 
 
 
657 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 
1111 aa  128  6e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  50 
 
 
909 aa  128  6e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1354  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.86 
 
 
1276 aa  128  7.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.530457  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.22 
 
 
2072 aa  127  8.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1709  putative PAS/PAC sensor protein  41.61 
 
 
669 aa  127  9.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0628445  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1643  response regulator receiver domain-containing protein  48.36 
 
 
200 aa  125  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.831648  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2385  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.44 
 
 
720 aa  125  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2967  putative PAS/PAC sensor protein  39.64 
 
 
376 aa  125  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.96 
 
 
813 aa  125  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2756  putative PAS/PAC sensor protein  47.54 
 
 
402 aa  124  7e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.482766 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48 
 
 
783 aa  122  4e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0445794 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1121  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.69 
 
 
1513 aa  122  4e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  46.27 
 
 
980 aa  122  5e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2986  putative PAS/PAC sensor protein  39.62 
 
 
474 aa  120  9e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0795  putative PAS/PAC sensor protein  47.54 
 
 
458 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0670898  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.77 
 
 
1325 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.6 
 
 
1039 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.763661  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1470  response regulator receiver protein  50.85 
 
 
268 aa  119  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00118197  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.97 
 
 
901 aa  119  3e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.180969  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3166  putative PAS/PAC sensor protein  51.3 
 
 
483 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.75 
 
 
1121 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2671  response regulator receiver domain-containing protein  46.4 
 
 
287 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1208  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 
619 aa  116  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0242207  normal  0.0474084 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 
1045 aa  115  6e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.628916  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.09 
 
 
472 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.974547  normal  0.0144544 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1649  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 
550 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.181327  normal  0.670777 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0264  response regulator receiver domain-containing protein  41.73 
 
 
178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.28 
 
 
991 aa  109  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1846  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 
737 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1481  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.85 
 
 
1425 aa  107  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  43.75 
 
 
764 aa  107  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0015  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.91 
 
 
347 aa  105  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.84393  normal  0.0442191 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1943  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.8 
 
 
596 aa  104  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1949  putative PAS/PAC sensor protein  44.26 
 
 
461 aa  104  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1892  putative PAS/PAC sensor protein  40.67 
 
 
632 aa  102  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.487702  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1440  putative PAS/PAC sensor protein  48.96 
 
 
477 aa  102  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2388  response regulator receiver  40.83 
 
 
127 aa  101  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0389923  normal  0.541574 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  40.8 
 
 
657 aa  101  9e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2266  putative PAS/PAC sensor protein  38.22 
 
 
906 aa  100  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1923  response regulator receiver domain-containing protein  41.8 
 
 
149 aa  100  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0330  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.75 
 
 
758 aa  100  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2409  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 
759 aa  99  4e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.456195  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2968  putative PAS/PAC sensor protein  35.66 
 
 
479 aa  97.4  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2673  response regulator receiver domain-containing protein  41.86 
 
 
133 aa  96.3  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0496  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.87 
 
 
896 aa  95.9  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.3 
 
 
921 aa  89.7  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.627886  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2267  putative PAS/PAC sensor protein  38.3 
 
 
576 aa  88.2  7e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0262742  normal  0.128517 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2042  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 
477 aa  86.3  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.562637  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0510  putative PAS/PAC sensor protein  38.93 
 
 
455 aa  83.6  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0170  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.3 
 
 
232 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39 
 
 
473 aa  81.3  0.000000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.753978 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>