More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0161 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
1039 aa  2121    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.62 
 
 
1301 aa  377  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.06 
 
 
766 aa  343  8e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.371468  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  58.1 
 
 
1439 aa  340  9.999999999999999e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.54 
 
 
862 aa  304  4.0000000000000003e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2026  putative PAS/PAC sensor protein  55.47 
 
 
511 aa  298  2e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0685118  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1739  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 
841 aa  295  3e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.165697  normal  0.509542 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.02 
 
 
1253 aa  293  1e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841858  normal  0.0475592 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 
768 aa  291  4e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.103172  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.25 
 
 
644 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.91 
 
 
1078 aa  280  8e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2554  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 
844 aa  277  8e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1244  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.4 
 
 
813 aa  276  2.0000000000000002e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1417  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 
1055 aa  269  2e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0587691  normal  0.569805 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 
901 aa  268  4e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.180969  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1335  putative PAS/PAC sensor protein  50.56 
 
 
1113 aa  264  6.999999999999999e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 
873 aa  260  9e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2967  putative PAS/PAC sensor protein  47.6 
 
 
376 aa  255  3e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.6 
 
 
931 aa  252  2e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.39 
 
 
472 aa  250  1e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.974547  normal  0.0144544 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.42 
 
 
813 aa  250  1e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0295  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 
655 aa  249  2e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 
931 aa  247  8e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.339388  normal  0.130033 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 
1032 aa  242  2e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 
1121 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0053  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 
968 aa  235  3e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.16 
 
 
1111 aa  235  4.0000000000000004e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 
1325 aa  234  6e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 
783 aa  233  1e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0445794 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.27 
 
 
651 aa  233  1e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0877  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 
1050 aa  232  2e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.948624  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0266  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 
736 aa  232  3e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.2 
 
 
472 aa  232  3e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.836728  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 
771 aa  231  4e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1293  putative PAS/PAC sensor protein  36.14 
 
 
1265 aa  231  5e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2676  histidine kinase  53.33 
 
 
213 aa  229  2e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.364042  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1481  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 
1425 aa  228  3e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1242  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 
472 aa  228  4e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41521  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1208  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 
619 aa  227  1e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0242207  normal  0.0474084 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2213  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.66 
 
 
1069 aa  224  4.9999999999999996e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.273979 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 
608 aa  223  9.999999999999999e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1199  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 
968 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0569956 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1962  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 
603 aa  222  3e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.23 
 
 
603 aa  217  9.999999999999999e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1755  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.75 
 
 
781 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1792  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 
984 aa  216  2.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.47 
 
 
653 aa  216  2.9999999999999995e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1647  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 
638 aa  214  7.999999999999999e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211834  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0157  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.74 
 
 
478 aa  213  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.260977 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0545  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.01 
 
 
896 aa  211  8e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91043  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1846  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 
737 aa  210  1e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1933  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 
589 aa  210  1e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  65.22 
 
 
1426 aa  210  1e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2107  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.03 
 
 
660 aa  208  5e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0058  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.83 
 
 
581 aa  206  1e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.52 
 
 
656 aa  205  3e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.548294  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1943  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 
596 aa  206  3e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 
2072 aa  205  4e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1250  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.1 
 
 
559 aa  204  6e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 
765 aa  204  9e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.6 
 
 
753 aa  204  9.999999999999999e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2719  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  48.21 
 
 
586 aa  202  3e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000435656  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1307  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 
1225 aa  202  3.9999999999999996e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.551936  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1347  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.37 
 
 
638 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.679676  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2061  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  45.05 
 
 
600 aa  200  9e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.658977 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2038  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.24 
 
 
524 aa  201  9e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.032498  normal  0.0495143 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 
439 aa  200  9e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.622382  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1112  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 
493 aa  200  1.0000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.607083 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0015  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.09 
 
 
347 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.84393  normal  0.0442191 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2693  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 
727 aa  198  4.0000000000000005e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0252521 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.64 
 
 
500 aa  198  5.000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1140  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 
563 aa  197  6e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2965  histidine kinase  45.21 
 
 
350 aa  197  7e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.02 
 
 
769 aa  196  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 
886 aa  195  4e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.257142  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 
789 aa  193  1e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1267  putative PAS/PAC sensor protein  26.52 
 
 
849 aa  194  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0446298  normal  0.4297 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2385  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 
720 aa  193  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 
1039 aa  192  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.763661  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0795  putative PAS/PAC sensor protein  39.16 
 
 
458 aa  193  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0670898  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 
657 aa  192  2.9999999999999997e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0467  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.06 
 
 
431 aa  192  2.9999999999999997e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.466167  hitchhiker  0.00940458 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1234  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 
552 aa  191  4e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.397898  normal  0.016153 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1055  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 
639 aa  189  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2672  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 
619 aa  188  4e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2281  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.37 
 
 
891 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00177504  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 
890 aa  186  3e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0271774 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1121  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.13 
 
 
1513 aa  186  3e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1949  putative PAS/PAC sensor protein  37.5 
 
 
461 aa  185  4.0000000000000006e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2215  putative PAS/PAC sensor protein  28.72 
 
 
637 aa  184  6e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.245996 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.85 
 
 
1758 aa  184  7e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.669381 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1172  histidine kinase  45.13 
 
 
288 aa  183  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.83 
 
 
763 aa  180  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.926751  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1287  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 
935 aa  179  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0339259  normal  0.305866 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1433  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 
974 aa  179  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.717996  normal  0.840517 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0141  putative PAS/PAC sensor protein  43.65 
 
 
837 aa  179  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00355903 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 
678 aa  179  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0986  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
433 aa  179  3e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0645349  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1231  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.04 
 
 
366 aa  178  4e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0108298  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 
481 aa  177  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0656222  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>