More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0331 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
608 aa  1248    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.32 
 
 
653 aa  437  1e-121  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1962  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 
603 aa  367  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1208  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.13 
 
 
619 aa  353  4e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0242207  normal  0.0474084 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.73 
 
 
603 aa  345  2e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.13 
 
 
644 aa  326  9e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2107  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 
660 aa  325  2e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.47 
 
 
768 aa  316  7e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.103172  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 
656 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.548294  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.7 
 
 
789 aa  308  2.0000000000000002e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1943  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 
596 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.38 
 
 
862 aa  298  1e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2693  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.88 
 
 
727 aa  296  6e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0252521 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 
1032 aa  293  5e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 
651 aa  293  6e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.76 
 
 
1325 aa  292  1e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0877  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 
1050 aa  282  2e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.948624  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.3 
 
 
1439 aa  281  3e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.11 
 
 
2072 aa  278  3e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.98 
 
 
1426 aa  270  4e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1244  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 
813 aa  267  5e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2554  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 
844 aa  263  1e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 
873 aa  262  1e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.6 
 
 
1301 aa  257  5e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 
931 aa  256  7e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.339388  normal  0.130033 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0266  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.74 
 
 
736 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1739  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 
841 aa  252  1e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.165697  normal  0.509542 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 
769 aa  251  4e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0053  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 
968 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2672  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.95 
 
 
619 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0295  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 
655 aa  244  3e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1352  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.54 
 
 
732 aa  242  1e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.161755  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2213  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.62 
 
 
1069 aa  242  2e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.273979 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1140  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.86 
 
 
563 aa  233  1e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 
765 aa  231  2e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0467  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.67 
 
 
431 aa  231  3e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.466167  hitchhiker  0.00940458 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 
1121 aa  229  8e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1307  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.57 
 
 
1225 aa  229  2e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.551936  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 
771 aa  228  2e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.33 
 
 
931 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 
657 aa  227  5.0000000000000005e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0328  putative PAS/PAC sensor protein  41.97 
 
 
365 aa  226  1e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1755  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.01 
 
 
781 aa  225  2e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.36 
 
 
763 aa  225  2e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.926751  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2385  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.61 
 
 
720 aa  225  2e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 
783 aa  224  3e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0445794 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 
1039 aa  223  7e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 
1111 aa  223  8e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2215  putative PAS/PAC sensor protein  38.77 
 
 
637 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.245996 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 
1039 aa  221  3e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.763661  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 
813 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1846  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 
737 aa  219  1e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 
901 aa  218  2e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.180969  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 
1078 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1354  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 
1276 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.530457  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0237  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  47.49 
 
 
440 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1242  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.82 
 
 
472 aa  214  2.9999999999999995e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41521  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 
472 aa  214  2.9999999999999995e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.836728  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 
886 aa  214  4.9999999999999996e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.257142  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.58 
 
 
566 aa  211  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.866363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.9 
 
 
753 aa  211  3e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1112  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 
493 aa  209  9e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.607083 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 
500 aa  208  2e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1481  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 
1425 aa  207  4e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2026  putative PAS/PAC sensor protein  34.49 
 
 
511 aa  207  6e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0685118  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2259  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 
593 aa  207  6e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0545  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.06 
 
 
896 aa  204  3e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91043  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1055  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 
639 aa  204  3e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1347  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 
638 aa  204  4e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.679676  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0015  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.28 
 
 
347 aa  204  4e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.84393  normal  0.0442191 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0157  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 
478 aa  204  4e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.260977 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0005  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 
1399 aa  203  9e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.7049  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1287  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 
935 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0339259  normal  0.305866 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 
909 aa  201  3e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2038  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  38.41 
 
 
524 aa  201  3e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.032498  normal  0.0495143 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0058  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.76 
 
 
581 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0493  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.39 
 
 
440 aa  201  5e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.274957  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1417  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 
1055 aa  201  5e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0587691  normal  0.569805 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1199  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.39 
 
 
968 aa  200  6e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0569956 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.04 
 
 
1758 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.669381 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1335  putative PAS/PAC sensor protein  41.7 
 
 
1113 aa  197  3e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 
1253 aa  196  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841858  normal  0.0475592 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1104  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.16 
 
 
569 aa  195  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.53532  normal  0.324425 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.43 
 
 
766 aa  195  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.371468  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 
842 aa  193  6e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.469652 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2061  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  44.74 
 
 
600 aa  193  7e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.658977 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2642  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 
510 aa  193  7e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.848189  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1933  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 
589 aa  193  8e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1647  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 
638 aa  191  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211834  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2683  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.75 
 
 
372 aa  190  8e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.200357  normal  0.398114 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1293  putative PAS/PAC sensor protein  28.69 
 
 
1265 aa  189  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1250  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.31 
 
 
559 aa  189  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.42 
 
 
1559 aa  188  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0935  histidine kinase  43.42 
 
 
379 aa  188  3e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.957792  normal  0.0100677 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1172  histidine kinase  45.73 
 
 
288 aa  188  3e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1231  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.1 
 
 
366 aa  186  7e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0108298  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0986  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 
433 aa  186  8e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0645349  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 
481 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0656222  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2676  histidine kinase  45.07 
 
 
213 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.364042  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1687  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 
404 aa  184  3e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0708821  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>