More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1231 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1231  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 366 aa  743    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0108298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.52 
 
 		 783 aa  239  5e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0445794 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0053  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50.65 
 
 		 968 aa  231  1e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.36 
 
 		 651 aa  229  6e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.85 
 
 		 657 aa  224  2e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.77 
 
 		 656 aa  218  1e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.548294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.08 
 
 		 931 aa  218  1e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.339388  normal  0.130033 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1140  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.01 
 
 		 563 aa  216  4e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.78 
 
 		 1301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.7 
 
 		 753 aa  212  7e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1307  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.32 
 
 		 1225 aa  208  1e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.551936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0015  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  49.57 
 
 		 347 aa  206  6e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.84393  normal  0.0442191 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1481  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.32 
 
 		 1425 aa  206  8e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.66 
 
 		 901 aa  205  1e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.180969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0295  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.61 
 
 		 655 aa  204  1e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2061  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  47.51 
 
 		 600 aa  205  1e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.658977 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 500 aa  204  2e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1250  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.25 
 
 		 559 aa  203  4e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2554  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.08 
 
 		 844 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2213  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.74 
 
 		 1069 aa  200  3e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.273979 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1112  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.92 
 
 		 493 aa  199  5e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.607083 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0935  histidine kinase  44.77 
 
 		 379 aa  199  7.999999999999999e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.957792  normal  0.0100677 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.81 
 
 		 472 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.974547  normal  0.0144544 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.59 
 
 		 644 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1244  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.8 
 
 		 813 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1755  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.45 
 
 		 781 aa  197  3e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1943  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.22 
 
 		 596 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0877  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.96 
 
 		 1050 aa  196  7e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.948624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0266  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.65 
 
 		 736 aa  195  9e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1933  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.13 
 
 		 589 aa  195  9e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.49 
 
 		 1325 aa  195  1e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0157  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.8 
 
 		 478 aa  194  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.260977 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0058  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.48 
 
 		 581 aa  192  7e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.32 
 
 		 771 aa  192  8e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1121  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.64 
 
 		 1513 aa  192  9e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2693  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.66 
 
 		 727 aa  191  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0252521 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1234  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.17 
 
 		 552 aa  189  7e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.397898  normal  0.016153 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1687  signal-transducing histidine kinase  44.55 
 
 		 565 aa  188  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10306  normal  0.175724 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.86 
 
 		 931 aa  188  1e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.23 
 
 		 472 aa  189  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.836728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.58 
 
 		 1426 aa  188  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0986  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.56 
 
 		 433 aa  188  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0645349  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0467  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.5 
 
 		 431 aa  188  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.466167  hitchhiker  0.00940458 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.1 
 
 		 608 aa  186  4e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2965  histidine kinase  42.62 
 
 		 350 aa  186  4e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1242  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.02 
 
 		 472 aa  186  4e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.25 
 
 		 873 aa  186  5e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1347  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.61 
 
 		 638 aa  186  6e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.679676  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1647  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.2 
 
 		 638 aa  186  6e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.88 
 
 		 1111 aa  186  7e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 		 603 aa  186  8e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2683  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.5 
 
 		 372 aa  186  8e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.200357  normal  0.398114 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1055  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.09 
 
 		 639 aa  185  8e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.83 
 
 		 765 aa  185  9e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.99 
 
 		 1121 aa  185  9e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2676  histidine kinase  44.6 
 
 		 213 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.364042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.48 
 
 		 653 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.95 
 
 		 862 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1417  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.23 
 
 		 1055 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0587691  normal  0.569805 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.95 
 
 		 439 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.622382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.21 
 
 		 1439 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.83 
 
 		 789 aa  183  4.0000000000000006e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.23 
 
 		 1758 aa  182  6e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.669381 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1199  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.35 
 
 		 968 aa  182  7e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0569956 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.37 
 
 		 1253 aa  181  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841858  normal  0.0475592 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2200  histidine kinase  41.1 
 
 		 299 aa  181  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0325  histidine kinase  48.35 
 
 		 185 aa  181  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.28293 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0493  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.24 
 
 		 440 aa  181  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.274957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44 
 
 		 1078 aa  181  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1172  histidine kinase  45.54 
 
 		 288 aa  181  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1739  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.75 
 
 		 841 aa  181  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.165697  normal  0.509542 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1687  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.29 
 
 		 404 aa  180  4e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0708821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.3 
 
 		 768 aa  179  4.999999999999999e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.103172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1208  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.33 
 
 		 619 aa  179  7e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0242207  normal  0.0474084 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.79 
 
 		 763 aa  179  7e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.926751  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1104  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 		 569 aa  179  7e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.53532  normal  0.324425 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1352  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.04 
 
 		 732 aa  178  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.161755  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.79 
 
 		 813 aa  179  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.04 
 
 		 1039 aa  178  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2259  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 593 aa  178  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.19 
 
 		 566 aa  178  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.866363 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1846  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.4 
 
 		 737 aa  178  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.5 
 
 		 544 aa  177  3e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.230477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1287  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.3 
 
 		 935 aa  176  4e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0339259  normal  0.305866 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.19 
 
 		 1032 aa  175  9e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2038  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  40.72 
 
 		 524 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.032498  normal  0.0495143 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2775  ATP-binding region, ATPase-like  36.29 
 
 		 310 aa  173  5e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1649  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.18 
 
 		 550 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.181327  normal  0.670777 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.73 
 
 		 2072 aa  172  9e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0782  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.21 
 
 		 729 aa  172  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.15545  normal  0.515162 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0545  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.52 
 
 		 896 aa  171  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.79 
 
 		 481 aa  170  3e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0656222  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1963  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 642 aa  169  5e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.743491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.1 
 
 		 569 aa  169  6e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.176462  normal  0.11002 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1962  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.01 
 
 		 603 aa  169  7e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.41 
 
 		 769 aa  169  8e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.23 
 
 		 1039 aa  169  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.763661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2719  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.37 
 
 		 586 aa  169  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000435656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1433  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.48 
 
 		 974 aa  167  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.717996  normal  0.840517 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0237  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.4 
 
 		 440 aa  167  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>