More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1347 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1347  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
638 aa  1293    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.679676  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2642  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 
510 aa  295  2e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.848189  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2837  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 
716 aa  270  5.9999999999999995e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1043  sensory box histidine kinase  42.62 
 
 
767 aa  252  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.382651  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 
652 aa  250  5e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.03 
 
 
1044 aa  243  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1244  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38 
 
 
813 aa  231  4e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 
862 aa  229  1e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.67 
 
 
1166 aa  227  6e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 
651 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1140  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 
563 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0136  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.98 
 
 
665 aa  219  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0475  sensory box histidine kinase  29.78 
 
 
622 aa  219  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0713  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 
639 aa  218  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2554  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.24 
 
 
844 aa  216  7e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 
653 aa  216  9.999999999999999e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 
873 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.02 
 
 
644 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1242  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 
472 aa  214  2.9999999999999995e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41521  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0058  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 
581 aa  213  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1739  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 
841 aa  213  1e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.165697  normal  0.509542 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.99 
 
 
947 aa  213  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 
753 aa  212  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 
1032 aa  209  9e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0875  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 
628 aa  208  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 
931 aa  208  3e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.339388  normal  0.130033 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2693  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 
727 aa  207  6e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0252521 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 
472 aa  206  1e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.974547  normal  0.0144544 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1755  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.02 
 
 
781 aa  205  2e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 
608 aa  204  4e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1199  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.89 
 
 
962 aa  204  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 
813 aa  203  6e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 
603 aa  203  8e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 
500 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1055  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.1 
 
 
639 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.98 
 
 
544 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.230477  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.37 
 
 
1039 aa  201  3e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.2 
 
 
1301 aa  201  3e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1417  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.34 
 
 
1055 aa  201  3e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0587691  normal  0.569805 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0157  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.98 
 
 
478 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.260977 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1250  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.64 
 
 
559 aa  200  6e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1208  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.15 
 
 
619 aa  200  6e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0242207  normal  0.0474084 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 
1426 aa  200  7.999999999999999e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2061  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  38.48 
 
 
600 aa  199  9e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.658977 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0877  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 
1050 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.948624  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1199  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45 
 
 
968 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0569956 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.23 
 
 
472 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.836728  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1112  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.78 
 
 
493 aa  197  4.0000000000000005e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.607083 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1933  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.25 
 
 
589 aa  196  8.000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1687  signal-transducing histidine kinase  35.56 
 
 
565 aa  196  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10306  normal  0.175724 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.57 
 
 
931 aa  196  1e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.74 
 
 
1439 aa  196  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0266  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.34 
 
 
736 aa  194  3e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 
783 aa  194  3e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0445794 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0015  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  48.61 
 
 
347 aa  194  6e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.84393  normal  0.0442191 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 
1121 aa  192  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0295  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.01 
 
 
655 aa  192  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 
765 aa  192  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2672  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.03 
 
 
619 aa  192  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0493  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.53 
 
 
440 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.274957  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0545  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 
896 aa  191  5e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91043  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.54 
 
 
890 aa  191  5e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0271774 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0053  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.3 
 
 
968 aa  191  5e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 
1111 aa  190  5.999999999999999e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1433  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.43 
 
 
974 aa  190  5.999999999999999e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.717996  normal  0.840517 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2719  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 
586 aa  190  5.999999999999999e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000435656  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1352  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.6 
 
 
732 aa  190  7e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.161755  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 
1078 aa  190  8e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1307  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.37 
 
 
1225 aa  189  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.551936  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2676  histidine kinase  43.66 
 
 
213 aa  189  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.364042  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1481  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.61 
 
 
1425 aa  188  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 
771 aa  189  2e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.11 
 
 
901 aa  187  6e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.180969  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.73 
 
 
439 aa  187  7e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.622382  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1231  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.61 
 
 
366 aa  186  8e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0108298  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.04 
 
 
1325 aa  186  8e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.42 
 
 
763 aa  186  9e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.926751  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1687  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 
404 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0708821  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1287  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.74 
 
 
935 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0339259  normal  0.305866 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1846  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.66 
 
 
737 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.43 
 
 
1253 aa  184  3e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841858  normal  0.0475592 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1354  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.01 
 
 
1276 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.530457  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1104  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.97 
 
 
569 aa  184  5.0000000000000004e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.53532  normal  0.324425 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 
656 aa  183  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.548294  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2038  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  33.75 
 
 
524 aa  182  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.032498  normal  0.0495143 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 
2072 aa  182  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2259  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 
593 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.72 
 
 
789 aa  180  8e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.47 
 
 
481 aa  179  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0656222  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 
657 aa  179  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 
886 aa  179  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.257142  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2107  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.74 
 
 
660 aa  179  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1962  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.02 
 
 
603 aa  177  4e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 
842 aa  177  6e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.469652 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2213  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 
1069 aa  177  7e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.273979 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1647  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 
638 aa  177  8e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211834  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2385  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 
720 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0467  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 
431 aa  174  3.9999999999999995e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.466167  hitchhiker  0.00940458 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2965  histidine kinase  44.7 
 
 
350 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.17 
 
 
768 aa  174  3.9999999999999995e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.103172  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>