More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0782 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0782  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
729 aa  1493    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.15545  normal  0.515162 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1958  putative PAS/PAC sensor protein  35.15 
 
 
598 aa  266  1e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293409  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1687  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.23 
 
 
404 aa  258  3e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0708821  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0170  ATP-binding region, ATPase-like  46.77 
 
 
277 aa  220  8.999999999999998e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 
890 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0271774 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1136  extracellular solute-binding protein  36.63 
 
 
342 aa  213  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2775  ATP-binding region, ATPase-like  41.34 
 
 
310 aa  213  1e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2444  sensor histidine kinase  33.24 
 
 
610 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.119384  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1244  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.25 
 
 
813 aa  199  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0999  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.44 
 
 
455 aa  198  3e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0658985  normal  0.43266 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1991  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.58 
 
 
1255 aa  196  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0266  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
736 aa  194  7e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1293  putative PAS/PAC sensor protein  31.6 
 
 
1265 aa  188  3e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0058  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 
581 aa  187  5e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1307  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.15 
 
 
1225 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.551936  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 
842 aa  183  9.000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.469652 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.42 
 
 
931 aa  182  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0417  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.41 
 
 
1247 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1481  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 
1425 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0877  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 
1050 aa  181  4.999999999999999e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.948624  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1242  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
472 aa  179  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41521  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.78 
 
 
813 aa  180  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 
651 aa  178  4e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0053  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 
968 aa  177  6e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1112  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 
493 aa  177  9e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.607083 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2554  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.88 
 
 
844 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1739  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 
841 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.165697  normal  0.509542 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.64 
 
 
753 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4816  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.07 
 
 
1247 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.201907  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0295  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 
655 aa  174  3.9999999999999995e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 
1032 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0420  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  26.97 
 
 
1247 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.285216  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0386  sensory box protein  26.75 
 
 
1247 aa  174  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.298787  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1250  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
559 aa  173  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 
657 aa  172  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1231  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.21 
 
 
366 aa  172  3e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0108298  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 
783 aa  172  3e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0445794 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1920  diguanylate cyclase  28.15 
 
 
893 aa  171  5e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5150  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.43 
 
 
1248 aa  170  7e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0157  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 
478 aa  170  7e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.260977 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1140  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 
563 aa  170  7e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
2072 aa  170  9e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 
603 aa  169  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 
765 aa  168  4e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 
1301 aa  167  5.9999999999999996e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 
1039 aa  167  5.9999999999999996e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.75 
 
 
1078 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2213  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.54 
 
 
1069 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.273979 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.68 
 
 
1165 aa  167  9e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2324  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 
1089 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 
500 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 
481 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0656222  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 
886 aa  166  2.0000000000000002e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.257142  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 
472 aa  163  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.836728  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 
653 aa  163  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 
1253 aa  162  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841858  normal  0.0475592 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1199  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 
968 aa  161  4e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0569956 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.08 
 
 
768 aa  161  5e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.103172  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.36 
 
 
901 aa  159  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.180969  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 
931 aa  159  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.339388  normal  0.130033 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1933  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 
589 aa  159  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.91 
 
 
656 aa  159  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.548294  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2634  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.11 
 
 
768 aa  158  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0717  hypothetical protein  25.85 
 
 
1245 aa  158  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0358  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 
571 aa  157  6e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.213349  normal  0.100259 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2200  histidine kinase  35.8 
 
 
299 aa  157  7e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07500  hypothetical protein  25.35 
 
 
1245 aa  156  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.411522  normal  0.391796 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4029  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  25.89 
 
 
1244 aa  155  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1010  signal transduction histidine kinase  25.61 
 
 
626 aa  155  2e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1208  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
619 aa  156  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0242207  normal  0.0474084 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 
763 aa  155  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.926751  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 
608 aa  155  2.9999999999999998e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 
1325 aa  155  2.9999999999999998e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 
771 aa  155  2.9999999999999998e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0015  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 
347 aa  154  5e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.84393  normal  0.0442191 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2676  histidine kinase  39.17 
 
 
213 aa  154  5e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.364042  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  34.84 
 
 
778 aa  153  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1755  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.72 
 
 
781 aa  153  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0935  histidine kinase  33.71 
 
 
379 aa  151  5e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.957792  normal  0.0100677 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  27.55 
 
 
2035 aa  150  7e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 
1039 aa  150  8e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.763661  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2107  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 
660 aa  150  1.0000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2719  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 
586 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000435656  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.9 
 
 
1439 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1347  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.21 
 
 
638 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.679676  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2259  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 
593 aa  148  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 
862 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.53 
 
 
439 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.622382  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 
1111 aa  147  6e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1433  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.98 
 
 
974 aa  147  6e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.717996  normal  0.840517 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 
873 aa  147  6e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1354  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.3 
 
 
1276 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.530457  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 
566 aa  147  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.866363 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1937  diguanylate cyclase  25.78 
 
 
775 aa  146  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.25 
 
 
1410 aa  146  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 
644 aa  146  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1352  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.37 
 
 
732 aa  146  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.161755  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 
544 aa  146  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.230477  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2061  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  35.56 
 
 
600 aa  145  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.658977 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0545  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.34 
 
 
896 aa  145  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91043  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>