More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0999 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0999  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
455 aa  939    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0658985  normal  0.43266 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1687  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.47 
 
 
404 aa  234  3e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0708821  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.59 
 
 
890 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0271774 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0782  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.44 
 
 
729 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.15545  normal  0.515162 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.36 
 
 
651 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1846  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 
737 aa  187  3e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1293  putative PAS/PAC sensor protein  32.94 
 
 
1265 aa  183  7e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1244  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 
813 aa  181  2e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 
842 aa  180  4e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.469652 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2672  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 
619 aa  181  4e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 
783 aa  176  5e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0445794 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 
753 aa  176  9e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
657 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2693  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 
727 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0252521 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0266  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 
736 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0053  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 
968 aa  173  5e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 
862 aa  173  5e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 
931 aa  172  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.339388  normal  0.130033 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0170  ATP-binding region, ATPase-like  37.88 
 
 
277 aa  171  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.49 
 
 
472 aa  168  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.836728  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 
765 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 
1111 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0877  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 
1050 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.948624  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.51 
 
 
931 aa  167  4e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1287  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 
935 aa  167  5e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0339259  normal  0.305866 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
766 aa  166  9e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.371468  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 
1253 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841858  normal  0.0475592 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2775  ATP-binding region, ATPase-like  40 
 
 
310 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 
901 aa  162  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.180969  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2107  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 
660 aa  162  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1979  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 
348 aa  162  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.927247  normal  0.526243 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1140  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.11 
 
 
563 aa  162  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.53 
 
 
603 aa  162  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 
608 aa  161  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 
886 aa  160  3e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.257142  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1199  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 
968 aa  160  4e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0569956 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0058  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 
581 aa  160  4e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 
653 aa  160  4e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 
771 aa  160  4e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1933  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 
589 aa  160  5e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.81 
 
 
768 aa  159  9e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.103172  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1433  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 
974 aa  159  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.717996  normal  0.840517 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 
439 aa  159  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.622382  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0295  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 
655 aa  158  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 
656 aa  155  9e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.548294  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1231  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 
366 aa  155  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0108298  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1242  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 
472 aa  155  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41521  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 
644 aa  155  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2038  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.41 
 
 
524 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.032498  normal  0.0495143 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2061  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.49 
 
 
600 aa  154  4e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.658977 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1055  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 
639 aa  153  5e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1347  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.23 
 
 
638 aa  152  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.679676  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2213  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 
1069 aa  151  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.273979 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1307  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 
1225 aa  150  4e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.551936  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 
789 aa  150  5e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1104  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 
569 aa  150  5e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.53532  normal  0.324425 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1121  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 
1513 aa  150  6e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1755  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 
781 aa  150  6e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 
1032 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0237  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 
440 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1208  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.29 
 
 
619 aa  147  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0242207  normal  0.0474084 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 
1121 aa  147  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1647  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.45 
 
 
638 aa  147  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211834  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2683  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.43 
 
 
372 aa  147  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.200357  normal  0.398114 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0935  histidine kinase  35.37 
 
 
379 aa  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.957792  normal  0.0100677 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1943  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 
596 aa  146  9e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1481  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 
1425 aa  145  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 
763 aa  145  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.926751  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 
1301 aa  145  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2385  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 
720 aa  144  4e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 
678 aa  144  5e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0157  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 
478 aa  143  8e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.260977 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0467  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 
431 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.466167  hitchhiker  0.00940458 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1354  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 
1276 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.530457  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1234  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.65 
 
 
552 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.397898  normal  0.016153 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.73 
 
 
1039 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 
873 aa  141  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1352  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 
732 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.161755  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1112  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 
493 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.607083 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 
1039 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.763661  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 
1439 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0015  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 
347 aa  139  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.84393  normal  0.0442191 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2642  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.37 
 
 
510 aa  139  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.848189  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0545  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 
896 aa  138  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91043  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 
1078 aa  138  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.61 
 
 
769 aa  139  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1687  signal-transducing histidine kinase  28.95 
 
 
565 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10306  normal  0.175724 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1250  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 
559 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 
472 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.974547  normal  0.0144544 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2433  Osmosensitive K+ channel histidine kinase-like protein  31.14 
 
 
359 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0358  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.43 
 
 
571 aa  137  4e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.213349  normal  0.100259 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
1325 aa  136  6.0000000000000005e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2554  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 
844 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2259  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 
593 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 
1426 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 
544 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.230477  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.35 
 
 
566 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.866363 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1563  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 
574 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.115149  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1635  putative PAS/PAC sensor protein  35.37 
 
 
374 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.143018  hitchhiker  0.00206871 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0574  putative PAS/PAC sensor protein  28.66 
 
 
375 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.194056 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>