More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2462 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  69.87 
 
 		 657 aa  655    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2464  putative PAS/PAC sensor protein  64.02 
 
 		 812 aa  926    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  68.17 
 
 		 656 aa  646    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.548294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  70.75 
 
 		 783 aa  854    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0445794 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 1032 aa  2120    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.21 
 
 		 653 aa  396  1e-108  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 		 771 aa  380  1e-104  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2266  putative PAS/PAC sensor protein  31.95 
 
 		 906 aa  375  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 		 1253 aa  347  8.999999999999999e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.13 
 
 		 862 aa  330  7e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 		 1325 aa  327  5e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 530 aa  315  2.9999999999999996e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0877  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 		 1050 aa  314  5.999999999999999e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.948624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2554  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 		 844 aa  307  5.0000000000000004e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.47 
 
 		 768 aa  306  2.0000000000000002e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.103172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 608 aa  293  9e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.61 
 
 		 1301 aa  285  4.0000000000000003e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.86 
 
 		 544 aa  281  6e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.230477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.99 
 
 		 1426 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  55.16 
 
 		 1439 aa  263  1e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.81 
 
 		 651 aa  258  3e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1739  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 		 841 aa  252  3e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.165697  normal  0.509542 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0622  putative PAS/PAC sensor protein  40.05 
 
 		 440 aa  251  5e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0545  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 		 896 aa  251  6e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 1121 aa  250  1e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0053  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 		 968 aa  245  3.9999999999999997e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1307  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.75 
 
 		 1225 aa  242  2e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.551936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 1039 aa  242  2e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2693  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 		 727 aa  240  9e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0252521 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.84 
 
 		 931 aa  240  1e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.339388  normal  0.130033 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1287  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.53 
 
 		 935 aa  237  8e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0339259  normal  0.305866 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 		 789 aa  235  4.0000000000000004e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1242  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.84 
 
 		 472 aa  235  4.0000000000000004e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1244  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 813 aa  234  4.0000000000000004e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 2072 aa  234  5e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.75 
 
 		 886 aa  234  6e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.257142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0058  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.44 
 
 		 581 aa  233  1e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1709  putative PAS/PAC sensor protein  37.32 
 
 		 669 aa  230  1e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0628445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 		 603 aa  228  6e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0328  putative PAS/PAC sensor protein  46.38 
 
 		 365 aa  226  1e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1755  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 		 781 aa  226  2e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2213  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 1069 aa  226  2e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.273979 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 873 aa  226  2e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 		 753 aa  223  9.999999999999999e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1140  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.11 
 
 		 563 aa  223  1.9999999999999999e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2672  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 		 619 aa  222  3e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3508  putative PAS/PAC sensor protein  34.22 
 
 		 554 aa  221  7e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.254838 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.06 
 
 		 1039 aa  220  1e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.763661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 		 1111 aa  219  1e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.65 
 
 		 1758 aa  220  1e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.669381 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1199  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 		 968 aa  219  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0569956 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 		 765 aa  218  4e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.7 
 
 		 931 aa  218  5.9999999999999996e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0295  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 		 655 aa  218  5.9999999999999996e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0266  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.4 
 
 		 736 aa  217  8e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.25 
 
 		 813 aa  217  9.999999999999999e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1481  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.76 
 
 		 1425 aa  217  9.999999999999999e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0005  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 		 1399 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.7049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.85 
 
 		 766 aa  214  5.999999999999999e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.371468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 		 769 aa  213  1e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.13 
 
 		 901 aa  212  2e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.180969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1055  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 		 639 aa  212  4e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0903  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.57 
 
 		 1262 aa  211  5e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0935  histidine kinase  46.96 
 
 		 379 aa  211  8e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.957792  normal  0.0100677 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1347  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 		 638 aa  210  1e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.679676  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1121  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 		 1513 aa  209  1e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1943  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 596 aa  210  1e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2259  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.88 
 
 		 593 aa  210  1e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3250  sensory transduction histidine kinase  41.29 
 
 		 1019 aa  208  5e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.145129 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.94 
 
 		 566 aa  208  5e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.866363 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0237  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  47.98 
 
 		 440 aa  208  5e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1352  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.15 
 
 		 732 aa  206  1e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.161755  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 		 1078 aa  204  6e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1104  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.65 
 
 		 569 aa  204  7e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.53532  normal  0.324425 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2038  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  31.12 
 
 		 524 aa  204  7e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.032498  normal  0.0495143 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1354  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.36 
 
 		 1276 aa  203  9.999999999999999e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.530457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1417  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 		 1055 aa  203  9.999999999999999e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0587691  normal  0.569805 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1208  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 		 619 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0242207  normal  0.0474084 
 
 
-
 
NC_002936  DET1016  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  34.59 
 
 		 1258 aa  202  3e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0157  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.57 
 
 		 478 aa  201  7.999999999999999e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.260977 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0496  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 		 896 aa  199  2.0000000000000003e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 		 472 aa  198  5.000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.836728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2061  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  35.92 
 
 		 600 aa  196  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.658977 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.39 
 
 		 763 aa  196  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.926751  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 		 500 aa  196  3e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1687  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 404 aa  196  3e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0708821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1647  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.94 
 
 		 638 aa  194  9e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  64.14 
 
 		 1182 aa  194  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1250  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.18 
 
 		 559 aa  193  1e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2676  histidine kinase  48.36 
 
 		 213 aa  194  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.364042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1933  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 		 589 aa  192  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1962  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 603 aa  193  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1293  putative PAS/PAC sensor protein  25.47 
 
 		 1265 aa  191  4e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  52.69 
 
 		 1248 aa  190  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0358  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.2 
 
 		 571 aa  189  3e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.213349  normal  0.100259 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0493  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.22 
 
 		 440 aa  189  3e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.274957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_887  sensor histidine kinase/response regulator  31.92 
 
 		 1258 aa  188  4e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1433  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 		 974 aa  187  8e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.717996  normal  0.840517 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1846  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 		 737 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.44 
 
 		 842 aa  184  6e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.469652 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>