More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0053 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0053  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
968 aa  1978    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
1121 aa  320  7e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 
1325 aa  318  4e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2554  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 
844 aa  288  2e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0877  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 
1050 aa  279  2e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.948624  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.89 
 
 
1301 aa  278  5e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1739  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 
841 aa  277  7e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.165697  normal  0.509542 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 
931 aa  273  2e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.339388  normal  0.130033 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2693  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 
727 aa  267  7e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0252521 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 
651 aa  266  1e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1307  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.73 
 
 
1225 aa  262  2e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.551936  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0058  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.99 
 
 
581 aa  259  1e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 
1390 aa  255  3e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1354  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.72 
 
 
1276 aa  254  6e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.530457  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.1 
 
 
657 aa  253  9.000000000000001e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1140  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.94 
 
 
563 aa  252  2e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.76 
 
 
783 aa  252  2e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0445794 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 
789 aa  251  4e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1244  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 
813 aa  250  1e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.18 
 
 
862 aa  249  1e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0295  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 
655 aa  248  3e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1199  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 
968 aa  246  9.999999999999999e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0569956 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 
608 aa  245  3e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 
1032 aa  245  3e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2213  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 
1069 aa  244  5e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.273979 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1933  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 
589 aa  243  2e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 
768 aa  239  2e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.103172  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.82 
 
 
1111 aa  239  2e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 
1253 aa  238  4e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841858  normal  0.0475592 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 
901 aa  237  7e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.180969  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.02 
 
 
753 aa  237  8e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 
656 aa  236  1.0000000000000001e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.548294  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1481  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.17 
 
 
1425 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1846  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
737 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2672  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 
619 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 
1039 aa  235  2.0000000000000002e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0467  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
431 aa  235  3e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.466167  hitchhiker  0.00940458 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1417  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 
1055 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0587691  normal  0.569805 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0545  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 
896 aa  233  1e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91043  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.88 
 
 
2072 aa  233  1e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1647  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 
638 aa  231  3e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211834  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1231  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.65 
 
 
366 aa  231  4e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0108298  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 
1039 aa  231  7e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.763661  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.32 
 
 
1439 aa  230  7e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.78 
 
 
472 aa  230  8e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.836728  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.53 
 
 
1078 aa  230  1e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.04 
 
 
769 aa  227  9e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1755  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 
781 aa  225  2e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 
842 aa  226  2e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.469652 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.55 
 
 
766 aa  225  4e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.371468  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.43 
 
 
472 aa  224  6e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.974547  normal  0.0144544 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 
873 aa  224  8e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0005  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.99 
 
 
1399 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.7049  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.44 
 
 
644 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 
765 aa  221  5e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.31 
 
 
1758 aa  221  7e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.669381 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1287  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 
935 aa  220  7.999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0339259  normal  0.305866 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  26.97 
 
 
1676 aa  220  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2061  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  48.89 
 
 
600 aa  220  1e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.658977 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1208  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.24 
 
 
619 aa  219  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0242207  normal  0.0474084 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 
603 aa  218  5e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 
813 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 
653 aa  216  1.9999999999999998e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.46 
 
 
931 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1250  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
559 aa  215  2.9999999999999995e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0266  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 
736 aa  214  7e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1104  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 
569 aa  214  7.999999999999999e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.53532  normal  0.324425 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0157  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.16 
 
 
478 aa  213  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.260977 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.89 
 
 
886 aa  210  1e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.257142  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0935  histidine kinase  46.02 
 
 
379 aa  209  2e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.957792  normal  0.0100677 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1943  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 
596 aa  209  3e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1352  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 
732 aa  207  5e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.161755  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1293  putative PAS/PAC sensor protein  28.44 
 
 
1265 aa  207  6e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 
500 aa  207  7e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1433  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 
974 aa  207  9e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.717996  normal  0.840517 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1112  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.43 
 
 
493 aa  206  2e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.607083 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2379  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.98 
 
 
1509 aa  206  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1121  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.84 
 
 
1513 aa  205  4e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1234  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 
552 aa  204  6e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.397898  normal  0.016153 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 
771 aa  203  9.999999999999999e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1962  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.62 
 
 
603 aa  203  9.999999999999999e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0015  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.65 
 
 
347 aa  202  3e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.84393  normal  0.0442191 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0986  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.19 
 
 
433 aa  201  7e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0645349  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1687  signal-transducing histidine kinase  35.42 
 
 
565 aa  201  7.999999999999999e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10306  normal  0.175724 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.25 
 
 
1309 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.4 
 
 
1426 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1687  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 
404 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0708821  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1055  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.37 
 
 
639 aa  199  3e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2385  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.11 
 
 
720 aa  198  4.0000000000000005e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1242  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 
472 aa  198  4.0000000000000005e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41521  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2965  histidine kinase  46.82 
 
 
350 aa  197  8.000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.42 
 
 
544 aa  196  3e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.230477  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 
439 aa  191  4e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.622382  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2683  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.6 
 
 
372 aa  191  8e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.200357  normal  0.398114 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1347  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.3 
 
 
638 aa  191  8e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.679676  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2038  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  37.74 
 
 
524 aa  190  9e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.032498  normal  0.0495143 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1172  histidine kinase  46.67 
 
 
288 aa  190  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.36 
 
 
569 aa  189  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.176462  normal  0.11002 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1372  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1362 aa  187  6e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2719  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.39 
 
 
586 aa  187  6e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000435656  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>