More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1944 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  48.88 
 
 		 1182 aa  654    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  61.85 
 
 		 945 aa  869    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  100 
 
 		 1248 aa  2575    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  44.84 
 
 		 1289 aa  665    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  54.29 
 
 		 1047 aa  633  1e-180  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3250  sensory transduction histidine kinase  60.49 
 
 		 1019 aa  451  1e-125  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.145129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  50.83 
 
 		 676 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  60.18 
 
 		 936 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  36.89 
 
 		 886 aa  372  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  34.19 
 
 		 819 aa  353  1e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  32.18 
 
 		 1210 aa  315  3.9999999999999997e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  40.35 
 
 		 754 aa  312  2e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  67.08 
 
 		 800 aa  308  3e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  40.3 
 
 		 746 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  45.37 
 
 		 918 aa  297  1e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 		 1654 aa  283  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  58.92 
 
 		 657 aa  280  1e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 980 aa  279  3e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 		 1093 aa  278  4e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  28.8 
 
 		 1093 aa  277  9e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  34.24 
 
 		 783 aa  271  7e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 		 3706 aa  268  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  35.14 
 
 		 892 aa  253  2e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 		 1714 aa  249  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  45.45 
 
 		 449 aa  248  4e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  39.68 
 
 		 682 aa  243  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3467  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.25 
 
 		 865 aa  239  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  28.25 
 
 		 1390 aa  239  2e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  39.19 
 
 		 704 aa  239  3e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  34.89 
 
 		 492 aa  229  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  26.51 
 
 		 1676 aa  227  8e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3572  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 1341 aa  227  9e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  42.27 
 
 		 834 aa  222  3.9999999999999997e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 		 1253 aa  220  1e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 		 1177 aa  220  2e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 		 613 aa  217  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 		 991 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  33.76 
 
 		 1239 aa  204  6e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0851  signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 		 1124 aa  204  6e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.596817 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 964 aa  203  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0767  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  30.31 
 
 		 1278 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.74653 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1417  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.45 
 
 		 1055 aa  201  5e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0587691  normal  0.569805 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3508  putative PAS/PAC sensor protein  34.46 
 
 		 554 aa  201  6e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.254838 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 815 aa  199  4.0000000000000005e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 		 637 aa  195  5e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 		 681 aa  193  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1533  sensory box protein  37.45 
 
 		 965 aa  192  4e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.76081  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 		 771 aa  191  9e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.69 
 
 		 1032 aa  190  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  48.13 
 
 		 727 aa  189  2e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  28.92 
 
 		 744 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4417  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.49 
 
 		 1548 aa  186  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.409401 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 		 572 aa  186  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 488 aa  186  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  26.33 
 
 		 1246 aa  180  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 		 1516 aa  180  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1456  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.14 
 
 		 1212 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.4231 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  31.24 
 
 		 767 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1918  ATP-binding region, ATPase-like protein  32.81 
 
 		 935 aa  177  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0915  PAS sensor protein  35.22 
 
 		 1132 aa  174  6.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.476466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.05 
 
 		 1977 aa  174  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0876  signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 		 1132 aa  174  7.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.61927  normal  0.464028 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  24.61 
 
 		 2693 aa  174  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 		 839 aa  174  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0011  putative PAS/PAC sensor protein  31.82 
 
 		 969 aa  172  3e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.161167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 		 945 aa  172  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 		 1171 aa  172  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135263 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0877  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 		 1050 aa  170  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.948624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  29.54 
 
 		 912 aa  169  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  40.81 
 
 		 462 aa  168  5e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 		 932 aa  168  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0600  putative PAS/PAC sensor protein  29.67 
 
 		 727 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000188746  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4442  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 		 1267 aa  166  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5893  signal transduction histidine kinase  27.77 
 
 		 465 aa  165  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  25.35 
 
 		 909 aa  164  8.000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 547 aa  164  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  43.14 
 
 		 723 aa  164  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  28.27 
 
 		 1051 aa  163  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 		 1171 aa  163  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48946  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2014  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  54.01 
 
 		 904 aa  162  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0614  putative PAS/PAC sensor protein  28.99 
 
 		 727 aa  162  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8657800000000003e-24 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  28.28 
 
 		 913 aa  162  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4766  signal transduction histidine kinase  28.66 
 
 		 461 aa  162  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134291  normal  0.334258 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1809  putative PAS/PAC sensor protein  29.53 
 
 		 868 aa  159  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.109167 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  33.14 
 
 		 439 aa  160  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  27.98 
 
 		 631 aa  159  3e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 		 551 aa  158  8e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  26.52 
 
 		 764 aa  157  9e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1487  signal transduction histidine kinase  26.21 
 
 		 924 aa  157  9e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.588746 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 215 aa  157  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2854  putative two component signal transduction protein  26.4 
 
 		 917 aa  156  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 		 1183 aa  156  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3370  PAS sensor protein  35.19 
 
 		 713 aa  155  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.277761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0193  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  25.99 
 
 		 924 aa  155  5.9999999999999996e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0289682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 		 832 aa  153  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  39.74 
 
 		 347 aa  152  3e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.59 
 
 		 1297 aa  151  8e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2272  putative PAS/PAC sensor protein  27.71 
 
 		 925 aa  151  9e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  34.96 
 
 		 1663 aa  151  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 		 674 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>