More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1979 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1979  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
348 aa  723    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.927247  normal  0.526243 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2433  Osmosensitive K+ channel histidine kinase-like protein  49.11 
 
 
359 aa  226  4e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0545  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 
896 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91043  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 
1253 aa  194  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841858  normal  0.0475592 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1933  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 
589 aa  194  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1199  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 
968 aa  168  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0569956 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0999  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 
455 aa  162  7e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0658985  normal  0.43266 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0236  putative PAS/PAC sensor protein  28.86 
 
 
468 aa  153  4e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
651 aa  152  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1287  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.65 
 
 
935 aa  149  6e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0339259  normal  0.305866 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0574  putative PAS/PAC sensor protein  29.03 
 
 
375 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.194056 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3012  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 
556 aa  145  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0214699  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0053  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 
968 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.11 
 
 
862 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1267  putative PAS/PAC sensor protein  40.72 
 
 
849 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0446298  normal  0.4297 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 
753 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1687  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.08 
 
 
404 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0708821  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1244  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 
813 aa  139  4.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1433  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
974 aa  139  6e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.717996  normal  0.840517 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2200  histidine kinase  31.44 
 
 
299 aa  139  7e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1250  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 
559 aa  138  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 
931 aa  138  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1293  putative PAS/PAC sensor protein  28.63 
 
 
1265 aa  137  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0782  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 
729 aa  137  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.15545  normal  0.515162 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1231  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 
366 aa  136  6.0000000000000005e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0108298  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1347  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 
638 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.679676  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1622  putative PAS/PAC sensor protein  45.45 
 
 
565 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0238251 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0877  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 
1050 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.948624  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1242  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 
472 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41521  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1755  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 
781 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2038  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.37 
 
 
524 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.032498  normal  0.0495143 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2693  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 
727 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0252521 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 
931 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.339388  normal  0.130033 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2672  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 
619 aa  130  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0295  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 
655 aa  129  5.0000000000000004e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1112  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 
493 aa  129  8.000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.607083 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2379  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.11 
 
 
1509 aa  128  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 
765 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0157  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 
478 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.260977 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.73 
 
 
1032 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.88 
 
 
783 aa  126  5e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0445794 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0266  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 
736 aa  126  5e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0058  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.14 
 
 
581 aa  125  9e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0935  histidine kinase  29.65 
 
 
379 aa  125  9e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.957792  normal  0.0100677 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 
603 aa  125  9e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 
657 aa  125  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 
1301 aa  125  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.83 
 
 
634 aa  124  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000423635  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1307  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 
1225 aa  124  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.551936  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 
890 aa  122  6e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0271774 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 
901 aa  122  7e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.180969  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2385  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.22 
 
 
720 aa  122  7e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1121  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 
1513 aa  122  8e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2061  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.9 
 
 
600 aa  122  9e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.658977 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 
472 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.836728  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1055  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 
639 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2554  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 
844 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 
886 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.257142  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 
766 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.371468  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1635  putative PAS/PAC sensor protein  32.35 
 
 
374 aa  120  3e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.143018  hitchhiker  0.00206871 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 
544 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.230477  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.26 
 
 
842 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.469652 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1028  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 
335 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 
656 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.548294  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 
1121 aa  119  6e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29 
 
 
439 aa  119  7e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.622382  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2775  ATP-binding region, ATPase-like  29.02 
 
 
310 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2107  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
660 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.02 
 
 
644 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.56 
 
 
1439 aa  117  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 
653 aa  117  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2213  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.02 
 
 
1069 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.273979 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 
813 aa  116  5e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1140  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 
563 aa  116  6e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1352  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.11 
 
 
732 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.161755  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1647  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.38 
 
 
638 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211834  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 
768 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.103172  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 
472 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.974547  normal  0.0144544 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1846  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 
737 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 
500 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2965  histidine kinase  32.74 
 
 
350 aa  114  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1417  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 
1055 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0587691  normal  0.569805 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0170  ATP-binding region, ATPase-like  27.59 
 
 
277 aa  113  5e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1156  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.96 
 
 
469 aa  113  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0015  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 
347 aa  113  6e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.84393  normal  0.0442191 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.07 
 
 
771 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.9 
 
 
608 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2259  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.64 
 
 
593 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.42 
 
 
1039 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.51 
 
 
645 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 
1111 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1943  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 
596 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1413  putative PAS/PAC sensor protein  25.49 
 
 
1251 aa  110  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.629832 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1234  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 
552 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.397898  normal  0.016153 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.15 
 
 
873 aa  110  5e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0467  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.77 
 
 
431 aa  109  7.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.466167  hitchhiker  0.00940458 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0471  histidine kinase  29.15 
 
 
351 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.570966  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 
678 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2453  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 
603 aa  108  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704197  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0046  ATP-binding region ATPase domain protein  35.37 
 
 
161 aa  108  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>