More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2965 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2965  histidine kinase  100 
 
 
350 aa  719    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0935  histidine kinase  40.71 
 
 
379 aa  266  2.9999999999999995e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.957792  normal  0.0100677 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1647  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  52.65 
 
 
638 aa  237  2e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211834  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1234  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.1 
 
 
552 aa  236  3e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.397898  normal  0.016153 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.04 
 
 
1111 aa  231  2e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.13 
 
 
644 aa  212  7.999999999999999e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.83 
 
 
569 aa  207  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.176462  normal  0.11002 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0266  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.93 
 
 
736 aa  206  4e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.16 
 
 
901 aa  203  4e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.180969  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.77 
 
 
657 aa  202  7e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0053  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.82 
 
 
968 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.21 
 
 
1039 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1481  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.02 
 
 
1425 aa  197  3e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.82 
 
 
783 aa  197  3e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0445794 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.84 
 
 
1121 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1244  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.36 
 
 
813 aa  196  5.000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.02 
 
 
873 aa  195  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0545  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.95 
 
 
896 aa  194  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91043  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1112  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.4 
 
 
493 aa  194  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.607083 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.74 
 
 
500 aa  194  3e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.15 
 
 
931 aa  193  3e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.39 
 
 
931 aa  193  4e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.339388  normal  0.130033 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2719  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.44 
 
 
586 aa  193  4e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000435656  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0877  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.53 
 
 
1050 aa  192  6e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.948624  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.13 
 
 
651 aa  192  7e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45 
 
 
656 aa  191  1e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.548294  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0015  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 
347 aa  192  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.84393  normal  0.0442191 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.93 
 
 
1301 aa  191  1e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.89 
 
 
472 aa  191  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.974547  normal  0.0144544 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1121  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.93 
 
 
1513 aa  189  4e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1846  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.7 
 
 
737 aa  189  5e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1172  histidine kinase  44.74 
 
 
288 aa  189  7e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2061  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  45.54 
 
 
600 aa  188  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.658977 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1433  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.26 
 
 
974 aa  187  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.717996  normal  0.840517 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2676  histidine kinase  49.28 
 
 
213 aa  186  4e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.364042  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1231  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.62 
 
 
366 aa  186  4e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0108298  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1933  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.34 
 
 
589 aa  186  6e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.14 
 
 
862 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.72 
 
 
608 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.91 
 
 
1439 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2683  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.79 
 
 
372 aa  183  3e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.200357  normal  0.398114 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1199  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.57 
 
 
968 aa  182  7e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0569956 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.09 
 
 
439 aa  181  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.622382  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.69 
 
 
768 aa  180  2.9999999999999997e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.103172  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.7 
 
 
753 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1417  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.08 
 
 
1055 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0587691  normal  0.569805 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0986  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.09 
 
 
433 aa  179  7e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0645349  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1250  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.99 
 
 
559 aa  179  8e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 
1426 aa  178  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2038  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  44.44 
 
 
524 aa  178  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.032498  normal  0.0495143 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1943  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.59 
 
 
596 aa  177  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.2 
 
 
653 aa  177  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.79 
 
 
1032 aa  177  3e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1739  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.45 
 
 
841 aa  177  3e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.165697  normal  0.509542 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.46 
 
 
1078 aa  176  6e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1347  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.75 
 
 
638 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.679676  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1755  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.33 
 
 
781 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0157  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.09 
 
 
478 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.260977 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.55 
 
 
530 aa  173  2.9999999999999996e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2200  histidine kinase  41.43 
 
 
299 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.42 
 
 
566 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.866363 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1687  signal-transducing histidine kinase  42.42 
 
 
565 aa  172  9e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10306  normal  0.175724 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.08 
 
 
1325 aa  172  9e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.86 
 
 
789 aa  169  6e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1140  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.12 
 
 
563 aa  169  6e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.64 
 
 
765 aa  169  9e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1307  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.34 
 
 
1225 aa  169  9e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.551936  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0295  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.99 
 
 
655 aa  168  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1287  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.59 
 
 
935 aa  168  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0339259  normal  0.305866 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2259  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 
593 aa  168  1e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2693  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 
727 aa  168  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0252521 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.15 
 
 
472 aa  167  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.836728  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2554  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.73 
 
 
844 aa  167  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 
763 aa  167  4e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.926751  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1963  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 
642 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.743491  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 
544 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.230477  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 
813 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0237  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 
440 aa  164  3e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1055  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.38 
 
 
639 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1208  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.72 
 
 
619 aa  162  7e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0242207  normal  0.0474084 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2385  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.78 
 
 
720 aa  162  7e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1104  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.93 
 
 
569 aa  162  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.53532  normal  0.324425 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.65 
 
 
771 aa  161  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1242  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.79 
 
 
472 aa  161  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41521  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2213  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.45 
 
 
1069 aa  160  3e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.273979 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.79 
 
 
2072 aa  160  4e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0058  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 
581 aa  159  5e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1962  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.98 
 
 
603 aa  159  6e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.44 
 
 
1039 aa  158  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.763661  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.3 
 
 
1758 aa  159  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.669381 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1354  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
1276 aa  157  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.530457  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1687  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.74 
 
 
404 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0708821  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0467  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.99 
 
 
431 aa  155  7e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.466167  hitchhiker  0.00940458 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.18 
 
 
886 aa  155  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.257142  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.82 
 
 
766 aa  154  2e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.371468  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1293  putative PAS/PAC sensor protein  38.3 
 
 
1265 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.38 
 
 
481 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0656222  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0358  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 
571 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.213349  normal  0.100259 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2672  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.18 
 
 
619 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0493  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.6 
 
 
440 aa  152  8e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.274957  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>