More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1937 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1937  diguanylate cyclase  100 
 
 		 775 aa  1612    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  43.24 
 
 		 778 aa  648    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2702  diguanylate cyclase  29.94 
 
 		 794 aa  410  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564678  normal  0.658888 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1920  diguanylate cyclase  32.25 
 
 		 893 aa  347  6e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0036  histidine kinase  29.58 
 
 		 856 aa  296  1e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1889  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 714 aa  288  2.9999999999999996e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.838759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2637  diguanylate cyclase with extracellular sensor  33.04 
 
 		 474 aa  277  4e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1733  diguanylate cyclase  30.09 
 
 		 464 aa  253  8.000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000546701  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1063  diguanylate cyclase  31.07 
 
 		 458 aa  253  8.000000000000001e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.868006  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3689  diguanylate cyclase  31.03 
 
 		 935 aa  251  4e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0248  histidine kinase  28.47 
 
 		 1065 aa  244  3.9999999999999997e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0885  membrane associated GGDEF protein  31.9 
 
 		 712 aa  243  7e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0549  diguanylate cyclase  27.88 
 
 		 488 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0215358  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2511  diguanylate cyclase  35.58 
 
 		 686 aa  214  4.9999999999999996e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315227  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1513  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.01 
 
 		 1075 aa  213  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533351  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3437  diguanylate cyclase  25.44 
 
 		 483 aa  211  4e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0184931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.72 
 
 		 1238 aa  208  3e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.891716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0854  diguanylate cyclase  25.97 
 
 		 507 aa  207  5e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.485181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0819  diguanylate cyclase  26.2 
 
 		 507 aa  207  6e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00531525  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0841  GGDEF domain-containing protein  25.74 
 
 		 489 aa  207  7e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0842  diguanylate cyclase with extracellular sensor  25.97 
 
 		 484 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.105968  hitchhiker  0.00226884 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3325  diguanylate cyclase  25.17 
 
 		 482 aa  204  5e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.662914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0697  diguanylate cyclase  24.94 
 
 		 482 aa  204  7e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000140018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3387  histidine kinase  35.62 
 
 		 593 aa  197  4.0000000000000005e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2950  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.16 
 
 		 1004 aa  196  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1273  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.23 
 
 		 1004 aa  192  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1171  diguanylate cyclase  33.54 
 
 		 674 aa  192  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2037  diguanylate cyclase  28.95 
 
 		 928 aa  190  9e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2039  diguanylate cyclase with extracellular sensor  28.8 
 
 		 912 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0269682  hitchhiker  0.000000244551 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1952  diguanylate cyclase  27.79 
 
 		 937 aa  189  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.105215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2424  diguanylate cyclase  28.74 
 
 		 928 aa  189  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00236557  normal  0.130217 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2308  diguanylate cyclase  28.6 
 
 		 928 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00466975  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2367  diguanylate cyclase  27.17 
 
 		 923 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.457753  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2081  diguanylate cyclase  27.64 
 
 		 937 aa  185  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0379355  normal  0.0338945 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2113  extracellular solute-binding protein  27.67 
 
 		 955 aa  184  4.0000000000000006e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1897  diguanylate cyclase  27.24 
 
 		 937 aa  183  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0415273 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.54 
 
 		 915 aa  182  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3750  PAS:GGDEF  33.78 
 
 		 721 aa  181  4e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1844  extracellular solute-binding protein  27.87 
 
 		 932 aa  180  7e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02407  GGDEF domain protein  25.37 
 
 		 503 aa  180  9e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2434  extracellular solute-binding protein  27.64 
 
 		 937 aa  180  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1934  diguanylate cyclase  27.81 
 
 		 937 aa  177  7e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0766434  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1821  diguanylate cyclase  33.55 
 
 		 821 aa  177  9e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2080  diguanylate cyclase  27.13 
 
 		 934 aa  170  9e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1934  hypothetical protein  50.62 
 
 		 634 aa  168  4e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2185  diguanylate cyclase  25.16 
 
 		 941 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.260855  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0726  histidine kinase  31.74 
 
 		 570 aa  162  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.408803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2029  diguanylate cyclase  25.49 
 
 		 932 aa  162  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0571217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2110  PAS:GGDEF  43.53 
 
 		 796 aa  161  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172113  normal  0.0218284 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2092  response regulator receiver protein  41.15 
 
 		 459 aa  160  6e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000936351  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2313  sensory box/GGDEF domain protein  42.94 
 
 		 323 aa  160  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.447231  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1136  extracellular solute-binding protein  33.21 
 
 		 342 aa  160  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1091  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  49.35 
 
 		 424 aa  159  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0836  diguanylate cyclase  40.8 
 
 		 487 aa  158  4e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.975884  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  29.62 
 
 		 1574 aa  157  6e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07500  hypothetical protein  30.5 
 
 		 1245 aa  156  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.411522  normal  0.391796 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.38 
 
 		 2213 aa  155  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1991  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 		 1255 aa  155  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1399  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  45.34 
 
 		 476 aa  154  5e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2959  GGDEF domain-containing protein  33.33 
 
 		 292 aa  152  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000656128  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0347  diguanylate cyclase with hemerythrin-like metal-binding domain  44.59 
 
 		 531 aa  152  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0090  diguanylate cyclase  40.31 
 
 		 420 aa  151  5e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.260319  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0392  diguanylate cyclase  44.44 
 
 		 768 aa  150  6e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000907702  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1157  PAS:GGDEF  38.95 
 
 		 418 aa  150  7e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal  0.862731 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1477  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.86 
 
 		 317 aa  150  9e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1483  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.01 
 
 		 335 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.882912  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1851  diguanylate cyclase  44.17 
 
 		 620 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1789  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.17 
 
 		 794 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.993763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2576  diguanylate cyclase  24.1 
 
 		 931 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000375627  hitchhiker  0.0011212 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4523  diguanylate cyclase with GAF sensor  47.85 
 
 		 499 aa  149  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.967133  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3115  diguanylate cyclase  41.92 
 
 		 354 aa  149  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.276087 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1888  GGDEF domain-containing protein  26.06 
 
 		 930 aa  148  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000133848  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2097  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.86 
 
 		 800 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.115037 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0069  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.11 
 
 		 314 aa  148  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.840661 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1336  diguanylate cyclase  41.9 
 
 		 439 aa  148  4.0000000000000006e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0220322  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0195  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.78 
 
 		 309 aa  148  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0106599  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3642  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.86 
 
 		 796 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127426  normal  0.751556 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3508  diguanylate cyclase  41.36 
 
 		 638 aa  148  5e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0970585 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2943  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.88 
 
 		 438 aa  147  5e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.641955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1169  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.34 
 
 		 308 aa  147  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1139  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.34 
 
 		 308 aa  147  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1497  putative GAF sensor protein  40.12 
 
 		 689 aa  147  9e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0486  diguanylate cyclase  42.17 
 
 		 738 aa  147  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0645  diguanylate cyclase  43.2 
 
 		 659 aa  146  1e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1958  putative PAS/PAC sensor protein  28.27 
 
 		 598 aa  146  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0273  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  43.2 
 
 		 1078 aa  146  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0782  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.22 
 
 		 729 aa  146  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.15545  normal  0.515162 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4816  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.15 
 
 		 1247 aa  146  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.201907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0589  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.18 
 
 		 305 aa  145  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.352095  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1695  diguanylate cyclase  36.82 
 
 		 753 aa  145  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.560166  normal  0.428473 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0600  diguanylate cyclase with GAF sensor  41.86 
 
 		 669 aa  144  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0838  diguanylate cyclase  38.3 
 
 		 332 aa  144  4e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.569939 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02325  GGDEF domain protein  37.64 
 
 		 949 aa  144  5e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6727  diguanylate cyclase  38.54 
 
 		 467 aa  144  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0604  diguanylate cyclase  37.39 
 
 		 291 aa  144  7e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.436873  normal  0.310553 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3614  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.34 
 
 		 310 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0207  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  45.81 
 
 		 772 aa  143  9.999999999999999e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.53871  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.08 
 
 		 1788 aa  143  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1609  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.96 
 
 		 796 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248445 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1369  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  45.1 
 
 		 302 aa  143  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>