More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1889 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1889  diguanylate cyclase  100 
 
 		 714 aa  1446    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.838759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3689  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 935 aa  450  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  39.69 
 
 		 1574 aa  426  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2702  diguanylate cyclase  36.02 
 
 		 794 aa  333  5e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564678  normal  0.658888 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0885  membrane associated GGDEF protein  28.61 
 
 		 712 aa  296  1e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1937  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 775 aa  288  2e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3437  diguanylate cyclase  31.6 
 
 		 483 aa  273  8.000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0184931  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0841  GGDEF domain-containing protein  32.89 
 
 		 489 aa  267  5e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3325  diguanylate cyclase  31.49 
 
 		 482 aa  266  8e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.662914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0697  diguanylate cyclase  31.26 
 
 		 482 aa  265  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000140018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2637  diguanylate cyclase with extracellular sensor  33.33 
 
 		 474 aa  262  1e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  31.21 
 
 		 778 aa  261  3e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0842  diguanylate cyclase with extracellular sensor  30.47 
 
 		 484 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.105968  hitchhiker  0.00226884 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0854  diguanylate cyclase  30.25 
 
 		 507 aa  253  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.485181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0819  diguanylate cyclase  30.47 
 
 		 507 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00531525  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0549  diguanylate cyclase  31 
 
 		 488 aa  241  2e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0215358  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1063  diguanylate cyclase  32.15 
 
 		 458 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.868006  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1733  diguanylate cyclase  30.19 
 
 		 464 aa  226  9e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000546701  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  27.23 
 
 		 2035 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3226  Hpt sensor hybrid histidine kinase  25.73 
 
 		 1251 aa  217  7e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0796968  normal  0.806997 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1794  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 589 aa  200  6e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000132214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.14 
 
 		 1410 aa  200  6e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2308  diguanylate cyclase  23.93 
 
 		 928 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00466975  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1934  diguanylate cyclase  24.93 
 
 		 937 aa  185  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0766434  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2039  diguanylate cyclase with extracellular sensor  24.01 
 
 		 912 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0269682  hitchhiker  0.000000244551 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2424  diguanylate cyclase  24.01 
 
 		 928 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00236557  normal  0.130217 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1952  diguanylate cyclase  24.02 
 
 		 937 aa  182  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.105215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.05 
 
 		 1788 aa  181  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2037  diguanylate cyclase  25.33 
 
 		 928 aa  181  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02407  GGDEF domain protein  24.67 
 
 		 503 aa  176  9e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1897  diguanylate cyclase  23.73 
 
 		 937 aa  174  5e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0415273 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2081  diguanylate cyclase  23.73 
 
 		 937 aa  174  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0379355  normal  0.0338945 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0836  diguanylate cyclase  45.14 
 
 		 487 aa  171  3e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.975884  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2367  diguanylate cyclase  27.66 
 
 		 923 aa  171  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.457753  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2434  extracellular solute-binding protein  23.55 
 
 		 937 aa  170  9e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  25.71 
 
 		 2213 aa  170  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0248  histidine kinase  26.69 
 
 		 1065 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1844  extracellular solute-binding protein  23.74 
 
 		 932 aa  163  9e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3409  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.08 
 
 		 2654 aa  159  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2029  diguanylate cyclase  23.87 
 
 		 932 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0571217  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2113  extracellular solute-binding protein  25.79 
 
 		 955 aa  154  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2185  diguanylate cyclase  24.3 
 
 		 941 aa  154  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.260855  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1920  diguanylate cyclase  30.39 
 
 		 893 aa  154  7e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1888  GGDEF domain-containing protein  22.81 
 
 		 930 aa  152  3e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000133848  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3998  diguanylate cyclase  36.07 
 
 		 591 aa  152  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1934  hypothetical protein  47.62 
 
 		 634 aa  151  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0392  diguanylate cyclase  44.44 
 
 		 768 aa  151  4e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000907702  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2508  diguanylate cyclase  38.89 
 
 		 387 aa  151  5e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1366  diguanylate cyclase  47.17 
 
 		 369 aa  150  6e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.112308 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0613  diguanylate cyclase  46.95 
 
 		 611 aa  150  7e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1497  putative GAF sensor protein  44.64 
 
 		 689 aa  150  8e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3525  diguanylate cyclase  42.69 
 
 		 227 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.395826  normal  0.08798 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2080  diguanylate cyclase  23.45 
 
 		 934 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1399  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.37 
 
 		 476 aa  148  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2959  GGDEF domain-containing protein  32.48 
 
 		 292 aa  148  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000656128  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3023  diguanylate cyclase  41.95 
 
 		 362 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2750  diguanylate cyclase  41.14 
 
 		 380 aa  146  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1036  diguanylate cyclase  47.85 
 
 		 427 aa  146  1e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.132028  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0124  diguanylate cyclase  44.3 
 
 		 492 aa  146  1e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00884448  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3540  diguanylate cyclase  41.38 
 
 		 365 aa  146  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.123648 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1154  sensory box protein  40.46 
 
 		 340 aa  146  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3519  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 		 366 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2683  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  43.27 
 
 		 505 aa  145  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1916  diguanylate cyclase  44.19 
 
 		 736 aa  145  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0645  diguanylate cyclase  39.31 
 
 		 659 aa  143  9e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1063  diguanylate cyclase  41.48 
 
 		 366 aa  143  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1293  diguanylate cyclase  40.59 
 
 		 432 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.32079e-19 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1169  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.92 
 
 		 308 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1139  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.92 
 
 		 308 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1336  diguanylate cyclase  39.23 
 
 		 439 aa  141  3e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0220322  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0726  histidine kinase  27.59 
 
 		 570 aa  142  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.408803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1319  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  43.2 
 
 		 610 aa  141  3.9999999999999997e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.104887  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3102  GGDEF domain-containing protein  40.44 
 
 		 580 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1091  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.88 
 
 		 424 aa  141  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3316  diguanylate cyclase  41.46 
 
 		 307 aa  140  7e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1815  diguanylate cyclase  38.69 
 
 		 379 aa  140  7e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.404044 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1357  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.8 
 
 		 901 aa  140  7.999999999999999e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000351362  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0220  diguanylate cyclase  41.82 
 
 		 539 aa  140  7.999999999999999e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.454807  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0207  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  44.97 
 
 		 772 aa  140  1e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.53871  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2511  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.52 
 
 		 419 aa  140  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0413  diguanylate cyclase  39.26 
 
 		 373 aa  140  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.191775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0838  diguanylate cyclase  38.51 
 
 		 332 aa  139  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.569939 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0500  histidine kinase  21.32 
 
 		 922 aa  139  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0926  response regulator PleD  36.24 
 
 		 455 aa  139  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.773886 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0486  diguanylate cyclase  39.11 
 
 		 738 aa  139  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3523  diguanylate cyclase  45.51 
 
 		 452 aa  139  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.101344 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1387  diguanylate cyclase  37.1 
 
 		 336 aa  139  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.617999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2096  diguanylate cyclase  35.62 
 
 		 368 aa  137  5e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2951  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.76 
 
 		 306 aa  137  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0600  diguanylate cyclase with GAF sensor  39.53 
 
 		 669 aa  137  5e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0674  diguanylate cyclase  38.74 
 
 		 355 aa  137  6.0000000000000005e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.811028 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0312  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.28 
 
 		 454 aa  137  6.0000000000000005e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2092  response regulator receiver protein  40.78 
 
 		 459 aa  137  7.000000000000001e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000936351  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0058  diguanylate cyclase  39.67 
 
 		 565 aa  137  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.714624  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3143  diguanylate cyclase  40.36 
 
 		 614 aa  136  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.212991  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1332  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.33 
 
 		 306 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1844  diguanylate cyclase  42.51 
 
 		 456 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.674113  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2207  diguanylate cyclase  38.95 
 
 		 735 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2469  diguanylate cyclase  45.66 
 
 		 351 aa  136  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0787  GGDEF  38.12 
 
 		 585 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109099  hitchhiker  0.00379197 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>