More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3998 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3998  diguanylate cyclase  100 
 
 		 591 aa  1180    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3550  diguanylate cyclase  50.18 
 
 		 559 aa  504  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.953301  normal  0.354246 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3330  diguanylate cyclase  39.25 
 
 		 556 aa  391  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.702874 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2151  diguanylate cyclase  37.17 
 
 		 583 aa  284  3.0000000000000004e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.984421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0495  diguanylate cyclase  36.28 
 
 		 574 aa  249  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.355875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2192  diguanylate cyclase  31.35 
 
 		 535 aa  218  2e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.531458  normal  0.618886 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2868  diguanylate cyclase  30.3 
 
 		 555 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0836  diguanylate cyclase  40.62 
 
 		 487 aa  166  9e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.975884  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1662  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  48.33 
 
 		 820 aa  162  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.29973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2683  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  43.62 
 
 		 505 aa  153  8e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2050  diguanylate cyclase  31.67 
 
 		 523 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645943 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0651  diguanylate cyclase  28.16 
 
 		 574 aa  152  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000777615  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2413  diguanylate cyclase  31.17 
 
 		 544 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1889  diguanylate cyclase  36.07 
 
 		 714 aa  151  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.838759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3282  diguanylate cyclase  31.25 
 
 		 523 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1382  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.04 
 
 		 510 aa  150  5e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2999  diguanylate cyclase  26.79 
 
 		 548 aa  150  8e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1293  diguanylate cyclase  44.57 
 
 		 432 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.32079e-19 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1893  hypothetical protein  30.26 
 
 		 533 aa  148  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0317418  normal  0.65749 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2253  diguanylate cyclase  29.04 
 
 		 545 aa  148  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.346813  normal  0.544502 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1922  diguanylate cyclase  30.05 
 
 		 527 aa  147  6e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.252712 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3816  diguanylate cyclase  30.37 
 
 		 526 aa  147  6e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3218  diguanylate cyclase  30.39 
 
 		 532 aa  146  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2207  diguanylate cyclase  43.65 
 
 		 735 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0697  diguanylate cyclase  39.55 
 
 		 482 aa  146  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000140018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0636  diguanylate cyclase  41.94 
 
 		 559 aa  145  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.445559  normal  0.916917 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3437  diguanylate cyclase  39.55 
 
 		 483 aa  145  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0184931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3325  diguanylate cyclase  39.55 
 
 		 482 aa  145  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.662914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2096  diguanylate cyclase  37.45 
 
 		 368 aa  145  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2702  diguanylate cyclase  38.65 
 
 		 794 aa  144  6e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564678  normal  0.658888 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1109  diguanylate cyclase  29.9 
 
 		 532 aa  143  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3627  diguanylate cyclase  30.02 
 
 		 526 aa  143  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3525  diguanylate cyclase  43.27 
 
 		 227 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.395826  normal  0.08798 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0645  diguanylate cyclase  38.46 
 
 		 659 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0638  diguanylate cyclase  33.71 
 
 		 569 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1554  GGDEF domain-containing protein  33.44 
 
 		 729 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00526113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3671  putative signaling protein  29.27 
 
 		 480 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2422  diguanylate cyclase  31.74 
 
 		 532 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1872  diguanylate cyclase  44.39 
 
 		 342 aa  142  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.97558 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0058  diguanylate cyclase  43.46 
 
 		 565 aa  141  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.714624  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2049  GGDEF family protein  43.72 
 
 		 319 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2404  diguanylate cyclase  45.51 
 
 		 479 aa  140  4.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00227226  normal  0.966476 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2715  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.74 
 
 		 314 aa  140  7.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3677  diguanylate cyclase  32.62 
 
 		 524 aa  140  7.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2931  diguanylate cyclase  43.75 
 
 		 432 aa  140  8.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  36.32 
 
 		 517 aa  140  8.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1525  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.74 
 
 		 316 aa  139  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.15223e-23 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1887  diguanylate cyclase  31.23 
 
 		 517 aa  139  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2824  GGDEF domain-containing protein  41.43 
 
 		 628 aa  139  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1222  GGDEF domain-containing protein  40.76 
 
 		 466 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1418  diguanylate cyclase  40.76 
 
 		 466 aa  139  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0508  GGDEF domain-containing protein  40.76 
 
 		 454 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3066  GGDEF domain-containing protein  40.76 
 
 		 466 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3011  serine/threonine protein kinase  45.55 
 
 		 1637 aa  139  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1449  diguanylate cyclase  40.76 
 
 		 466 aa  139  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1551  GGDEF domain-containing protein  40.76 
 
 		 466 aa  139  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2661  diguanylate cyclase  35.23 
 
 		 644 aa  139  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.646845  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0645  GGDEF domain-containing protein  40.76 
 
 		 454 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3846  diguanylate cyclase  44.57 
 
 		 405 aa  138  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1695  diguanylate cyclase  43.55 
 
 		 753 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.560166  normal  0.428473 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2588  response regulator receiver protein  38.97 
 
 		 568 aa  137  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2227  diguanylate cyclase  41.33 
 
 		 342 aa  137  5e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0613  diguanylate cyclase  43.11 
 
 		 611 aa  137  5e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1387  cyclic nucleotide-binding protein  43.53 
 
 		 320 aa  137  5e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3523  diguanylate cyclase  48.45 
 
 		 452 aa  137  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.101344 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0462  3-deoxy-d-manno-octulosonic-acid transferase  38.38 
 
 		 422 aa  137  7.000000000000001e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0486  diguanylate cyclase  35.58 
 
 		 738 aa  137  7.000000000000001e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2420  diguanylate cyclase  47.98 
 
 		 532 aa  137  7.000000000000001e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.499921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0078  GGDEF domain-containing protein  42.33 
 
 		 565 aa  137  7.000000000000001e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4119  diguanylate cyclase  41.51 
 
 		 382 aa  137  7.000000000000001e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898336 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08240  GGDEF domain protein  31.82 
 
 		 448 aa  137  7.000000000000001e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1715  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  46.58 
 
 		 791 aa  137  7.000000000000001e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.680174 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3621  GGDEF  42.37 
 
 		 413 aa  137  8e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0388472 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6727  diguanylate cyclase  36.14 
 
 		 467 aa  137  8e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0090  diguanylate cyclase  42.26 
 
 		 420 aa  136  9e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.260319  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1154  sensory box protein  37.82 
 
 		 340 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6286  GGDEF domain-containing protein  45.05 
 
 		 668 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2297  sensor histidine kinase/GGDEF domain-containing protein  40.21 
 
 		 422 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2147  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  43.98 
 
 		 410 aa  136  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72420  GGDEF domain-containing protein  43.5 
 
 		 671 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0411466  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1477  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.21 
 
 		 317 aa  135  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0799  diguanylate cyclase  41.15 
 
 		 538 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0186826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1125  GGDEF  47.37 
 
 		 509 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.394023  normal  0.376452 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1953  diguanylate cyclase  43.72 
 
 		 454 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.363504  normal  0.99023 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3316  diguanylate cyclase  42.11 
 
 		 307 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3391  diguanylate cyclase  45.93 
 
 		 360 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.372073  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3477  diguanylate cyclase  40.76 
 
 		 342 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.377939  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4748  diguanylate cyclase  41.05 
 
 		 377 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0600  diguanylate cyclase with GAF sensor  45.61 
 
 		 669 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3102  GGDEF domain-containing protein  41.33 
 
 		 580 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1782  diguanylate cyclase  42.35 
 
 		 629 aa  135  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3203  diguanylate cyclase  43.15 
 
 		 569 aa  134  3e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0987619 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2008  diguanylate cyclase  41.92 
 
 		 574 aa  135  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2273  diguanylate cyclase  39.81 
 
 		 563 aa  135  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2943  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.19 
 
 		 438 aa  135  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.641955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0431  hypothetical protein  41.18 
 
 		 345 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139342  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1348  response regulator PleD  37.89 
 
 		 457 aa  134  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0124  diguanylate cyclase  41.1 
 
 		 492 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00884448  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1805  diguanylate cyclase  35.94 
 
 		 725 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1369  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  46.75 
 
 		 302 aa  134  3.9999999999999996e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>