More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2702 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2702  diguanylate cyclase  100 
 
 		 794 aa  1618    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564678  normal  0.658888 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1937  diguanylate cyclase  29.94 
 
 		 775 aa  410  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  30.62 
 
 		 778 aa  395  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0036  histidine kinase  33.98 
 
 		 856 aa  378  1e-103  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1889  diguanylate cyclase  36.02 
 
 		 714 aa  333  6e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.838759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0248  histidine kinase  34.48 
 
 		 1065 aa  326  1e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1920  diguanylate cyclase  30.28 
 
 		 893 aa  280  9e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3689  diguanylate cyclase  30.64 
 
 		 935 aa  270  5.9999999999999995e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0854  diguanylate cyclase  31.8 
 
 		 507 aa  250  6e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.485181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3437  diguanylate cyclase  30.06 
 
 		 483 aa  248  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0184931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0842  diguanylate cyclase with extracellular sensor  31.2 
 
 		 484 aa  249  2e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.105968  hitchhiker  0.00226884 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0885  membrane associated GGDEF protein  32.78 
 
 		 712 aa  247  6e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3325  diguanylate cyclase  29.39 
 
 		 482 aa  246  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.662914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0819  diguanylate cyclase  31.36 
 
 		 507 aa  245  3e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00531525  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0697  diguanylate cyclase  29.18 
 
 		 482 aa  244  7e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000140018  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0841  GGDEF domain-containing protein  29.93 
 
 		 489 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2637  diguanylate cyclase with extracellular sensor  29.75 
 
 		 474 aa  238  4e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1063  diguanylate cyclase  31.13 
 
 		 458 aa  233  1e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.868006  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0549  diguanylate cyclase  29.47 
 
 		 488 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0215358  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1794  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 		 589 aa  216  9.999999999999999e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000132214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1733  diguanylate cyclase  27.06 
 
 		 464 aa  213  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000546701  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1821  diguanylate cyclase  34.69 
 
 		 821 aa  206  2e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  34.77 
 
 		 1574 aa  204  6e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3226  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.89 
 
 		 1251 aa  191  2.9999999999999997e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0796968  normal  0.806997 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3750  PAS:GGDEF  34.56 
 
 		 721 aa  187  4e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.25 
 
 		 1238 aa  187  7e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.891716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.01 
 
 		 915 aa  186  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1513  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.09 
 
 		 1075 aa  185  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533351  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2950  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.88 
 
 		 1004 aa  179  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1273  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.09 
 
 		 1004 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1171  diguanylate cyclase  32.03 
 
 		 674 aa  174  5e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3387  histidine kinase  31.51 
 
 		 593 aa  171  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02407  GGDEF domain protein  23.88 
 
 		 503 aa  169  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2511  diguanylate cyclase  29.23 
 
 		 686 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315227  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3519  extracellular solute-binding protein  31.01 
 
 		 366 aa  157  8e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3816  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  47.9 
 
 		 797 aa  155  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.250791  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4457  GGDEF domain-containing protein  47.88 
 
 		 485 aa  155  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3508  diguanylate cyclase  38.92 
 
 		 638 aa  154  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0970585 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2185  diguanylate cyclase  26.99 
 
 		 941 aa  152  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.260855  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3922  GGDEF domain-containing protein  41.21 
 
 		 364 aa  151  4e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0269  diguanylate cyclase  46.06 
 
 		 485 aa  151  4e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.853723  hitchhiker  0.00000177476 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0836  diguanylate cyclase  40.7 
 
 		 487 aa  151  4e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.975884  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1309  NMT1/THI5-ike domain protein  30.77 
 
 		 375 aa  150  7e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  hitchhiker  0.0000217604 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0268  diguanylate cyclase  47.27 
 
 		 485 aa  150  9e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.624982  hitchhiker  0.000186113 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0280  diguanylate cyclase  46.67 
 
 		 486 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0272  diguanylate cyclase  46.67 
 
 		 486 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0276  diguanylate cyclase  46.67 
 
 		 486 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0279  diguanylate cyclase  46.67 
 
 		 486 aa  148  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00774453  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0384  diguanylate cyclase  46.06 
 
 		 486 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.21 
 
 		 454 aa  148  4.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2740  diguanylate cyclase  42.86 
 
 		 555 aa  147  5e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1934  diguanylate cyclase  27.86 
 
 		 937 aa  147  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0766434  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2683  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.78 
 
 		 505 aa  146  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1888  GGDEF domain-containing protein  26 
 
 		 930 aa  146  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000133848  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1952  diguanylate cyclase  25.93 
 
 		 937 aa  145  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.105215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0995  diguanylate cyclase with GAF sensor  44.91 
 
 		 792 aa  145  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.37011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3753  diguanylate cyclase  45.45 
 
 		 485 aa  145  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.580016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1336  diguanylate cyclase  41.99 
 
 		 495 aa  144  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3998  diguanylate cyclase  38.65 
 
 		 591 aa  144  7e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0747  diguanylate cyclase  43.83 
 
 		 508 aa  144  8e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3621  GGDEF  42.6 
 
 		 413 aa  144  9e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0388472 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1125  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.77 
 
 		 769 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.586946  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2113  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 		 955 aa  142  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1143  diguanylate cyclase  45.24 
 
 		 532 aa  142  3e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0645  diguanylate cyclase  45.06 
 
 		 659 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0636  diguanylate cyclase  37.23 
 
 		 559 aa  141  4.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.445559  normal  0.916917 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1851  diguanylate cyclase  39.05 
 
 		 620 aa  140  7e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2308  diguanylate cyclase  26.57 
 
 		 928 aa  140  7e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00466975  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0638  diguanylate cyclase  37.68 
 
 		 569 aa  140  8.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1897  diguanylate cyclase  26.54 
 
 		 937 aa  140  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0415273 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3563  cyclic nucleotide-binding protein  45.16 
 
 		 312 aa  140  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.187188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4400  diguanylate cyclase  43.04 
 
 		 681 aa  140  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.118889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1006  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.92 
 
 		 312 aa  140  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2297  sensor histidine kinase/GGDEF domain-containing protein  36.87 
 
 		 422 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0392  diguanylate cyclase  41.21 
 
 		 768 aa  138  4e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000907702  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1136  diguanylate cyclase  37.95 
 
 		 582 aa  138  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2081  diguanylate cyclase  25.74 
 
 		 937 aa  138  5e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0379355  normal  0.0338945 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1483  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.36 
 
 		 335 aa  137  6.0000000000000005e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.882912  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2954  diguanylate cyclase  37 
 
 		 612 aa  137  6.0000000000000005e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0512853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2039  diguanylate cyclase with extracellular sensor  25.77 
 
 		 912 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0269682  hitchhiker  0.000000244551 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1477  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.33 
 
 		 317 aa  137  8e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1723  response regulator receiver domain-containing protein  43.75 
 
 		 325 aa  137  8e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0069  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.15 
 
 		 314 aa  137  9e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.840661 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0489  GGDEF family protein  26.74 
 
 		 469 aa  137  9e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.788627  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0680  diguanylate cyclase  39.9 
 
 		 466 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3023  diguanylate cyclase  41.21 
 
 		 362 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2322  diguanylate cyclase  36.73 
 
 		 354 aa  136  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2424  diguanylate cyclase  25.57 
 
 		 928 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00236557  normal  0.130217 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1411  GGDEF domain-containing protein  42.77 
 
 		 493 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0895588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0911  sensory box histidine kinase  34.51 
 
 		 581 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3010  diguanylate cyclase  36.76 
 
 		 382 aa  136  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0304  diguanylate cyclase  35.98 
 
 		 464 aa  135  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3704  diguanylate cyclase  39.38 
 
 		 460 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2037  diguanylate cyclase  25.57 
 
 		 928 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0144  diguanylate cyclase  35.89 
 
 		 642 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4400  diguanylate cyclase  44.03 
 
 		 493 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3330  diguanylate cyclase  35.41 
 
 		 556 aa  135  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.702874 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0260  diguanylate cyclase  38.25 
 
 		 611 aa  136  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.832837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0187  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  43.29 
 
 		 469 aa  135  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2151  diguanylate cyclase  35.75 
 
 		 583 aa  135  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.984421  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>