More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3011 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_4054  ATPase domain-containing protein  47.34 
 
 		 1756 aa  1147    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.892687 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4360  serine/threonine protein kinase  75.2 
 
 		 1636 aa  2397    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  46.65 
 
 		 1788 aa  1123    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4550  serine/threonine protein kinase  68.2 
 
 		 1649 aa  2030    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7079  serine/threonine protein kinase  73.66 
 
 		 1643 aa  2262    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3011  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 1637 aa  3246    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3855  serine/threonine protein kinase  65.74 
 
 		 1726 aa  2032    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4642  serine/threonine protein kinase  73.81 
 
 		 1629 aa  2258    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.4 
 
 		 1780 aa  521  1e-146  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  28.47 
 
 		 2051 aa  496  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  28.66 
 
 		 1809 aa  474  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  24.75 
 
 		 1932 aa  476  1e-132  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.5 
 
 		 1808 aa  469  9.999999999999999e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  25.26 
 
 		 1914 aa  469  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  26.72 
 
 		 2361 aa  466  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  30.07 
 
 		 1837 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  29.56 
 
 		 1845 aa  462  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  24.5 
 
 		 1805 aa  463  9.999999999999999e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  28.67 
 
 		 1833 aa  446  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  26.96 
 
 		 1908 aa  438  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.57 
 
 		 1805 aa  440  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  24.88 
 
 		 1774 aa  439  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  29.34 
 
 		 1780 aa  435  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  25.54 
 
 		 1934 aa  434  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  25.29 
 
 		 2279 aa  432  1e-119  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  28.71 
 
 		 1922 aa  433  1e-119  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  29.31 
 
 		 2109 aa  427  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  26.52 
 
 		 2272 aa  429  1e-118  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.91 
 
 		 1795 aa  426  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  26.7 
 
 		 1644 aa  424  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24.51 
 
 		 1901 aa  422  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  28.41 
 
 		 1668 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.2 
 
 		 1804 aa  420  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  23.96 
 
 		 1850 aa  420  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  28.38 
 
 		 1836 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.2 
 
 		 1942 aa  417  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.45 
 
 		 1797 aa  411  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  28.9 
 
 		 1663 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  24.95 
 
 		 2303 aa  404  1e-111  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  28.31 
 
 		 1712 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  24.12 
 
 		 1811 aa  397  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  28.87 
 
 		 1697 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  23.36 
 
 		 2077 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24.7 
 
 		 1794 aa  379  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  27.6 
 
 		 1822 aa  366  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  27.85 
 
 		 1797 aa  348  4e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  27.09 
 
 		 2017 aa  340  9.999999999999999e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  25.53 
 
 		 1871 aa  332  3e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2107  serine/threonine protein kinase  29.91 
 
 		 670 aa  331  9e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1945  multi-sensor signal transduction multi-kinase  27.35 
 
 		 1832 aa  322  3.9999999999999996e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0187004 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  32.45 
 
 		 1885 aa  314  1e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  25.97 
 
 		 1739 aa  312  2.9999999999999997e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  29.82 
 
 		 1744 aa  293  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  28.49 
 
 		 1685 aa  280  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0230  ATPase domain-containing protein  26.72 
 
 		 1685 aa  275  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59916  normal  0.455487 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5242  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  26.66 
 
 		 1682 aa  268  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5152  ATPase domain-containing protein  26.51 
 
 		 1682 aa  256  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6696  multi-sensor signal transduction multi-kinase  28.12 
 
 		 1885 aa  237  1.0000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  25.4 
 
 		 1710 aa  236  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  30.05 
 
 		 1685 aa  229  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6170  multi-sensor signal transduction multi-kinase  31.29 
 
 		 1748 aa  209  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2495  diguanylate cyclase  49.52 
 
 		 422 aa  184  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1471  diguanylate cyclase  44.75 
 
 		 339 aa  172  5e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.435801  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1597  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  48.3 
 
 		 313 aa  171  7e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4535  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.96 
 
 		 345 aa  171  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0387275  normal  0.636684 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3671  putative signaling protein  48.13 
 
 		 480 aa  170  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4407  GGDEF family protein  41.37 
 
 		 344 aa  169  5e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3647  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.62 
 
 		 359 aa  167  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.745021  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0414  diguanylate cyclase  45.26 
 
 		 346 aa  167  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0411  PAS:GGDEF  49.7 
 
 		 317 aa  167  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.320308 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0058  diguanylate cyclase  47.18 
 
 		 565 aa  167  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.714624  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3973  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  46.49 
 
 		 362 aa  166  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.415221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4149  diguanylate cyclase  43.35 
 
 		 591 aa  166  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0015025  normal  0.169582 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2380  diguanylate cyclase  45.6 
 
 		 410 aa  166  4.0000000000000004e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3783  sensory transduction system, regulatory protein  46.35 
 
 		 546 aa  166  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3967  putative response regulator of a two-component system  36.53 
 
 		 335 aa  165  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000645274  normal  0.0110626 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1420  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  46.07 
 
 		 314 aa  164  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2194  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  51.1 
 
 		 636 aa  164  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00826  putative transmembrane protein  48.39 
 
 		 488 aa  163  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.61367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5389  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.85 
 
 		 372 aa  162  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0847  two component diguanylate cyclase  44.97 
 
 		 327 aa  162  4e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0310  diguanylate cyclase  45.11 
 
 		 340 aa  162  7e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0095  putative sensory transduction system, regulatory protein  45.64 
 
 		 536 aa  161  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.348008  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1738  diguanylate cyclase  42.71 
 
 		 462 aa  161  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2634  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  50.86 
 
 		 843 aa  160  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1713  diguanylate cyclase  42.71 
 
 		 462 aa  160  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6958  diguanylate cyclase  44.23 
 
 		 502 aa  160  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0766  diguanylate cyclase  45.41 
 
 		 501 aa  160  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6308  serine/threonine protein kinase  30.45 
 
 		 1235 aa  160  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1450  diguanylate cyclase  26.47 
 
 		 1774 aa  160  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00828  putative transmembrane protein  47.31 
 
 		 512 aa  159  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.33694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2281  GGDEF  46.33 
 
 		 555 aa  160  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000303682  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3170  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  46.59 
 
 		 344 aa  159  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.103544 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0133  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.39 
 
 		 461 aa  160  3e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0308  diguanylate cyclase  44.57 
 
 		 340 aa  159  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0175  diguanylate cyclase  48.07 
 
 		 516 aa  159  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0954  diguanylate cyclase  49.72 
 
 		 502 aa  159  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0641916  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2591  GGDEF domain protein  45.45 
 
 		 528 aa  159  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.200767  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0314  diguanylate cyclase  44.57 
 
 		 340 aa  159  6e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0313  diguanylate cyclase  44.57 
 
 		 340 aa  158  8e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>