More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4748 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4748  diguanylate cyclase  100 
 
 
377 aa  769    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4030  diguanylate cyclase  39.54 
 
 
498 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3750  PAS:GGDEF  53.93 
 
 
721 aa  206  7e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3508  diguanylate cyclase  50.74 
 
 
638 aa  202  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0970585 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2544  diguanylate cyclase  44.33 
 
 
398 aa  178  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.871243  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1614  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  48.26 
 
 
531 aa  177  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.423577 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2740  diguanylate cyclase  53.14 
 
 
555 aa  174  2.9999999999999996e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0953  diguanylate cyclase  48.52 
 
 
494 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0021  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  48.57 
 
 
668 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0019  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  48.57 
 
 
668 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1315  diguanylate cyclase  50 
 
 
608 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.243862  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0926  diguanylate cyclase  47.93 
 
 
494 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3523  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  47.06 
 
 
1079 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01741  Putative CHASE3/GGDEF domain-containing signal protein  50 
 
 
563 aa  164  3e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4128  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  48.52 
 
 
663 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2333  hypothetical protein  44.12 
 
 
565 aa  160  4e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2477  hypothetical protein  43.53 
 
 
273 aa  158  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0299  hypothetical protein  43.93 
 
 
609 aa  156  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0283  hypothetical protein  44.12 
 
 
709 aa  156  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1107  two component signal transduction response regulator  48.59 
 
 
323 aa  156  7e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1348  response regulator PleD  46.7 
 
 
457 aa  153  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0034  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  48.24 
 
 
728 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2109  diguanylate cyclase  44.62 
 
 
630 aa  151  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.843932  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1387  cyclic nucleotide-binding protein  48.26 
 
 
320 aa  151  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243824  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3853  diguanylate cyclase  34.06 
 
 
359 aa  150  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1382  response regulator PleD  44.97 
 
 
457 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2535  diguanylate cyclase  37.55 
 
 
1099 aa  148  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.12937  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1193  diguanylate cyclase  30.52 
 
 
353 aa  148  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2497  diguanylate cyclase with GAF sensor  43.18 
 
 
355 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000595067  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0841  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  47.5 
 
 
715 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.101081  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0453  diguanylate cyclase AdrA  32.62 
 
 
371 aa  146  5e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0412  diguanylate cyclase AdrA  32.62 
 
 
371 aa  146  5e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1290  response regulator PleD  44.97 
 
 
457 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0138689  hitchhiker  0.00259394 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3846  diguanylate cyclase  47.34 
 
 
405 aa  146  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0207  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  44.44 
 
 
772 aa  146  6e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.53871  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0402  diguanylate cyclase  49.11 
 
 
866 aa  146  7.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.362695  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0069  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  45.7 
 
 
314 aa  145  9e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.840661 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2049  diguanylate cyclase  36.79 
 
 
357 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00332  predicted diguanylate cyclase  32.31 
 
 
371 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3223  diguanylate cyclase  32.31 
 
 
371 aa  144  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00336  hypothetical protein  32.31 
 
 
371 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0459  diguanylate cyclase AdrA  32.31 
 
 
371 aa  144  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0096  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  47.37 
 
 
407 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.758352  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0415  diguanylate cyclase AdrA  32.31 
 
 
371 aa  144  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0767  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.21 
 
 
675 aa  144  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000798179  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3247  diguanylate cyclase AdrA  32.31 
 
 
371 aa  144  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0905888 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3646  diguanylate cyclase  45 
 
 
357 aa  144  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.567193 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2413  response regulator PleD  45.09 
 
 
457 aa  143  5e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592932  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2008  diguanylate cyclase  44.71 
 
 
574 aa  143  6e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3631  GGDEF domain-containing protein  38.86 
 
 
722 aa  142  7e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.770761  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1616  GGDEF domain protein  31.36 
 
 
358 aa  142  8e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.515769  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1172  diguanylate cyclase  33.23 
 
 
361 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00821476  hitchhiker  0.00260233 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0302  diguanylate cyclase AdrA  32.62 
 
 
366 aa  142  9e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1689  diguanylate cyclase  44.71 
 
 
574 aa  142  9e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1405  diguanylate cyclase  40.8 
 
 
464 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3038  response regulator PleD  45.09 
 
 
457 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.372566  normal  0.319547 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1205  diguanylate cyclase  30.25 
 
 
371 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3430  diguanylate cyclase  43.02 
 
 
513 aa  142  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2815  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.72 
 
 
457 aa  141  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.631579  normal  0.0857187 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2189  diguanylate cyclase with GAF sensor  42.69 
 
 
415 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0655  diguanylate cyclase  42.94 
 
 
172 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000725118  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0699  diguanylate cyclase  45.81 
 
 
226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.642785 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3024  diguanylate cyclase  46.07 
 
 
260 aa  140  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.104216  normal  0.207783 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3541  response regulator PleD  45.09 
 
 
457 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0926  response regulator PleD  44.97 
 
 
455 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.773886 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3308  response regulator PleD  45.09 
 
 
457 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268667  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  46.71 
 
 
1644 aa  140  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1595  response regulator receiver domain-containing protein  42.26 
 
 
234 aa  140  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000347977  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0507  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.46 
 
 
557 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2979  diguanylate cyclase  44.19 
 
 
490 aa  140  4.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2276  diguanylate cyclase  45.51 
 
 
257 aa  139  6e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40422  normal  0.360858 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1598  diguanylate cyclase  45.51 
 
 
257 aa  139  6e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1282  diguanylate cyclase with GAF sensor  41.32 
 
 
550 aa  139  7.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000101268  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4746  response regulator PleD  42.13 
 
 
466 aa  139  8.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0979514  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0085  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  45.09 
 
 
301 aa  139  8.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1977  membrane associated GGDEF protein  40.7 
 
 
583 aa  138  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2940  sensor diguanylate cyclase  43.89 
 
 
571 aa  139  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3525  diguanylate cyclase  46.82 
 
 
227 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.395826  normal  0.08798 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03704  GGDEF domain protein  43.27 
 
 
325 aa  138  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2634  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  46.59 
 
 
843 aa  137  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1834  diguanylate cyclase  47.27 
 
 
525 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.245567  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2754  diguanylate cyclase  37.96 
 
 
355 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0798314  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2683  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  45.35 
 
 
505 aa  138  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0195  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  45.81 
 
 
309 aa  138  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0106599  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1228  diguanylate cyclase  45.14 
 
 
490 aa  137  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1155  diguanylate cyclase  51.23 
 
 
605 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.290971  normal  0.125636 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4681  GGDEF domain-containing protein  37.78 
 
 
1034 aa  137  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3400  GGDEF  45.26 
 
 
584 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.884579  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1051  diguanylate cyclase  43.43 
 
 
424 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1332  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  45.9 
 
 
306 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0452  diguanylate cyclase  39.88 
 
 
323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3835  diguanylate cyclase  39.53 
 
 
316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0100  diguanylate cyclase  44.04 
 
 
446 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.246337  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3376  GGDEF/response regulator receiver domain-containing protein  44.62 
 
 
308 aa  137  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1325  sensory box protein  41.04 
 
 
428 aa  137  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.294155  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0273  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.62 
 
 
1078 aa  137  4e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1741  diguanylate cyclase  43.11 
 
 
374 aa  137  4e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.564976  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0638  diguanylate cyclase  41.08 
 
 
569 aa  137  4e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3476  diguanylate cyclase  40.59 
 
 
298 aa  137  4e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00597173 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1536  diguanylate cyclase  40.35 
 
 
278 aa  137  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.370191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>