More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_00336 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00332  predicted diguanylate cyclase  100 
 
 
371 aa  761    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3223  diguanylate cyclase  100 
 
 
371 aa  761    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00336  hypothetical protein  100 
 
 
371 aa  761    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0302  diguanylate cyclase AdrA  98.11 
 
 
366 aa  741    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0415  diguanylate cyclase AdrA  100 
 
 
371 aa  761    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3247  diguanylate cyclase AdrA  100 
 
 
371 aa  761    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0905888 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0453  diguanylate cyclase AdrA  99.46 
 
 
371 aa  758    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0459  diguanylate cyclase AdrA  99.73 
 
 
371 aa  759    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0412  diguanylate cyclase AdrA  99.46 
 
 
371 aa  758    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0427  diguanylate cyclase AdrA  75.47 
 
 
370 aa  591  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0440  diguanylate cyclase AdrA  75.47 
 
 
370 aa  591  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0421  diguanylate cyclase AdrA  75.74 
 
 
370 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0482  diguanylate cyclase AdrA  75.47 
 
 
370 aa  592  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0422  diguanylate cyclase AdrA  75.47 
 
 
370 aa  592  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.143029 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0856  diguanylate cyclase AdrA  69.27 
 
 
371 aa  551  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0674918 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3007  diguanylate cyclase  47.85 
 
 
353 aa  355  8.999999999999999e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1329  diguanylate cyclase  48.29 
 
 
353 aa  351  1e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.681295  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1193  diguanylate cyclase  47.66 
 
 
353 aa  339  4e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1205  diguanylate cyclase  46.02 
 
 
371 aa  331  2e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1155  diguanylate cyclase  37.87 
 
 
357 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.149088  normal  0.131446 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4307  diguanylate cyclase  38.78 
 
 
350 aa  267  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.896568  normal  0.748721 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1172  diguanylate cyclase  39.22 
 
 
361 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00821476  hitchhiker  0.00260233 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1189  diguanylate cyclase  37.28 
 
 
357 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0106637  normal  0.54324 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4260  diguanylate cyclase  37.75 
 
 
360 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860912  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1616  GGDEF domain protein  35.5 
 
 
358 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.515769  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3763  GGDEF  34.81 
 
 
358 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3853  diguanylate cyclase  37.9 
 
 
359 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2049  diguanylate cyclase  38.21 
 
 
357 aa  226  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2010  diguanylate cyclase  33.33 
 
 
351 aa  210  3e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.379687  normal  0.0370672 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1224  diguanylate cyclase  35.71 
 
 
359 aa  206  7e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.988641  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5901  diguanylate cyclase  34.53 
 
 
386 aa  173  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3711  diguanylate cyclase  39.77 
 
 
320 aa  146  5e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.336724  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3835  diguanylate cyclase  35.24 
 
 
316 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0921  putative GGDEF protein  39.53 
 
 
322 aa  142  6e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0452  diguanylate cyclase  39.64 
 
 
323 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1380  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.77 
 
 
332 aa  138  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.238298  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4748  diguanylate cyclase  32.4 
 
 
377 aa  138  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1051  diguanylate cyclase  28.78 
 
 
350 aa  137  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0154093  normal  0.979636 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0621  diguanylate cyclase  37.28 
 
 
323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003519  diguanylate cyclase (GGDEF domain) with PAS/PAC sensor  39.9 
 
 
280 aa  137  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000133532  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4518  diguanylate cyclase  42.05 
 
 
345 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4293  GGDEF domain-containing protein  40.24 
 
 
334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0725016  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4329  diguanylate cyclase  35.98 
 
 
320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.406414  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02241  hypothetical protein  39.77 
 
 
320 aa  133  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2425  diguanylate cyclase  39.13 
 
 
353 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2608  diguanylate cyclase  33.22 
 
 
380 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0392  diguanylate cyclase  37.95 
 
 
319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0549299  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3512  diguanylate cyclase  36.84 
 
 
318 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3137  response regulator receiver protein  36.84 
 
 
319 aa  130  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3459  diguanylate cyclase  37.28 
 
 
324 aa  130  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0570  diguanylate cyclase  37.28 
 
 
324 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0571  diguanylate cyclase  37.28 
 
 
324 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3577  GGDEF domain-containing protein  34.74 
 
 
322 aa  129  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.635523  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2607  diguanylate cyclase  36.81 
 
 
316 aa  129  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000143356  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1811  diguanylate cyclase  38.2 
 
 
1037 aa  128  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.688838  normal  0.296213 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0204  diguanylate cyclase  40.62 
 
 
453 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.209858  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2521  diguanylate cyclase  39.2 
 
 
350 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4030  diguanylate cyclase  27.16 
 
 
498 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0532  GGDEF domain-containing protein  36.36 
 
 
321 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2463  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.5 
 
 
301 aa  127  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1536  diguanylate cyclase  30.66 
 
 
278 aa  127  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.370191  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1467  diguanylate cyclase  37.22 
 
 
722 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1497  putative GAF sensor protein  40.23 
 
 
689 aa  126  5e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0802  diguanylate cyclase  38.38 
 
 
321 aa  126  5e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1715  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.38 
 
 
791 aa  126  5e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.680174 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1851  diguanylate cyclase  37.79 
 
 
620 aa  126  6e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0452  sensory box protein  34.97 
 
 
451 aa  125  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0241  diguanylate cyclase  33.17 
 
 
640 aa  125  1e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3306  diguanylate cyclase  39.05 
 
 
324 aa  125  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.198506  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1484  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.69 
 
 
555 aa  125  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3704  diguanylate cyclase  38.04 
 
 
460 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1282  diguanylate cyclase with GAF sensor  35.67 
 
 
550 aa  125  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000101268  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2297  sensor histidine kinase/GGDEF domain-containing protein  36.93 
 
 
422 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03704  GGDEF domain protein  34.92 
 
 
325 aa  124  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3316  diguanylate cyclase  36.52 
 
 
307 aa  124  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3178  diguanylate cyclase  32.76 
 
 
452 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0366604  hitchhiker  0.0000463802 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0699  diguanylate cyclase  43.98 
 
 
226 aa  124  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.642785 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1121  diguanylate cyclase  38.83 
 
 
305 aa  124  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.323017 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0569  sensory box/GGDEF family protein  38.6 
 
 
324 aa  124  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3096  diguanylate cyclase  32.33 
 
 
452 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0200719  hitchhiker  0.00269086 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0411  PAS:GGDEF  37.29 
 
 
317 aa  124  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.320308 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0009  diguanylate cyclase  39.05 
 
 
312 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214527  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0953  diguanylate cyclase  38.51 
 
 
494 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3653  GGDEF  35 
 
 
308 aa  124  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.203802  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0836  diguanylate cyclase  34.68 
 
 
487 aa  123  4e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.975884  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2699  diguanylate cyclase  40.12 
 
 
251 aa  123  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1198  diguanylate cyclase  39.38 
 
 
394 aa  123  4e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000754903  normal  0.715416 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1337  diguanylate cyclase  37.06 
 
 
635 aa  123  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.018023  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1477  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40 
 
 
730 aa  123  5e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3384  diguanylate cyclase  37.11 
 
 
481 aa  122  7e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.32659  normal  0.816188 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2458  diguanylate cyclase  38.69 
 
 
343 aa  122  7e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7026  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.05 
 
 
312 aa  122  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.398098  hitchhiker  0.000000633587 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1484  diguanylate cyclase  36.97 
 
 
615 aa  122  9e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1063  diguanylate cyclase  37.32 
 
 
366 aa  122  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1003  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.42 
 
 
538 aa  122  9.999999999999999e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0926  diguanylate cyclase  38.12 
 
 
494 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1579  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40 
 
 
324 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0680  diguanylate cyclase  37.42 
 
 
466 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4128  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  38.59 
 
 
663 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4666  diguanylate cyclase  36.16 
 
 
407 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00608192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>