More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0841 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0841  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  100 
 
 
715 aa  1436    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.101081  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1484  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.9 
 
 
555 aa  394  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1830  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.95 
 
 
941 aa  382  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4315  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.9 
 
 
554 aa  360  4e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.554314 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0723  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.04 
 
 
540 aa  345  2e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4377  GGDEF  36.27 
 
 
551 aa  344  4e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4837  response regulator  36.63 
 
 
551 aa  342  1e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.978785  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3442  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.4 
 
 
539 aa  337  7e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.677434  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0623  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.67 
 
 
556 aa  336  9e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.322116  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4602  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.7 
 
 
459 aa  334  3e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.195913 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0608  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.34 
 
 
452 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0597995 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5563  putative two-component response regulator  35.41 
 
 
542 aa  323  6e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.591571  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0563  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.34 
 
 
451 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64050  putative two-component response regulator  35.06 
 
 
542 aa  320  7e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0602  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.09 
 
 
451 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2212  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.74 
 
 
543 aa  310  8e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2118  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.33 
 
 
546 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2104  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.62 
 
 
546 aa  300  4e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0835719  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2358  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.45 
 
 
546 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2241  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.28 
 
 
546 aa  296  8e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.195601  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2127  response regulator  32.93 
 
 
544 aa  293  9e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2087  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.97 
 
 
544 aa  293  1e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1887  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.97 
 
 
544 aa  293  1e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.374169 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2228  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.5 
 
 
550 aa  281  3e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1039  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.26 
 
 
393 aa  280  5e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0950507  normal  0.205042 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3670  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.14 
 
 
561 aa  262  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1150  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.64 
 
 
547 aa  252  2e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3688  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.02 
 
 
543 aa  247  6e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1554  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.33 
 
 
419 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3139  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.06 
 
 
676 aa  208  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.990746 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2859  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.78 
 
 
532 aa  208  4e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.757844  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2752  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  31.34 
 
 
799 aa  203  8e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3505  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.88 
 
 
665 aa  192  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3557  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.89 
 
 
322 aa  188  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.457648  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3625  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.36 
 
 
322 aa  187  9e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1006  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.69 
 
 
312 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1139  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.54 
 
 
308 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1169  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.54 
 
 
308 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0178  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34 
 
 
322 aa  184  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.895619 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2326  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.65 
 
 
536 aa  184  6e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3473  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.83 
 
 
351 aa  183  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3614  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.87 
 
 
310 aa  182  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2951  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.57 
 
 
306 aa  173  7.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0069  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.34 
 
 
314 aa  173  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.840661 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1497  response regulator PleD  30.62 
 
 
454 aa  172  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1382  response regulator PleD  30.37 
 
 
457 aa  171  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0157  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.26 
 
 
917 aa  171  5e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1348  response regulator PleD  30.64 
 
 
457 aa  171  6e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1332  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.23 
 
 
306 aa  170  9e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1290  response regulator PleD  30.39 
 
 
457 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0138689  hitchhiker  0.00259394 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1643  GGDEF/response regulator receiver domain-containing protein  31.73 
 
 
316 aa  168  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0221  response regulator PleD  28.01 
 
 
460 aa  167  5e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7417  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.03 
 
 
457 aa  167  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196799  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2955  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37 
 
 
308 aa  167  5e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3851  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.95 
 
 
634 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0571122  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0195  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.33 
 
 
309 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0106599  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2693  diguanylate cyclase  35.55 
 
 
302 aa  165  3e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.31 
 
 
454 aa  164  5.0000000000000005e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1750  response regulator PleD  28.79 
 
 
457 aa  163  9e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3376  GGDEF/response regulator receiver domain-containing protein  34.01 
 
 
308 aa  163  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2463  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.33 
 
 
301 aa  163  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3790  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.14 
 
 
300 aa  161  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0926  response regulator PleD  29.61 
 
 
455 aa  161  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.773886 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0748  response regulator receiver protein  30.72 
 
 
312 aa  160  8e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2421  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.1 
 
 
684 aa  160  9e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000243595 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0365  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.01 
 
 
308 aa  160  9e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2313  response regulator  34.65 
 
 
301 aa  159  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.483613  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1984  threonine dehydratase  31.94 
 
 
418 aa  159  2e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.241676  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1477  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.79 
 
 
317 aa  159  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0228  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.85 
 
 
541 aa  157  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1684  GGDEF domain-containing protein  33.46 
 
 
323 aa  157  7e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0065  response regulator receiver protein  34.69 
 
 
305 aa  157  9e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1864  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.57 
 
 
457 aa  156  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  0.121309 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1192  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.65 
 
 
316 aa  156  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2192  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.7 
 
 
303 aa  156  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5250  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.35 
 
 
360 aa  155  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.395511  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0600  response regulator receiver protein  34.64 
 
 
301 aa  155  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6679  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.41 
 
 
457 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2407  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.22 
 
 
443 aa  154  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0296488 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1780  diguanylate cyclase  28.94 
 
 
414 aa  154  5.9999999999999996e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3541  response regulator PleD  28.92 
 
 
457 aa  154  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3038  response regulator PleD  30.15 
 
 
457 aa  154  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.372566  normal  0.319547 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2067  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.67 
 
 
317 aa  153  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2041  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.67 
 
 
317 aa  153  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4746  response regulator PleD  30.41 
 
 
466 aa  154  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0979514  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1341  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.74 
 
 
319 aa  153  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1382  response regulator receiver protein  35.34 
 
 
302 aa  153  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2815  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.02 
 
 
457 aa  152  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.631579  normal  0.0857187 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5066  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.96 
 
 
338 aa  151  4e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0462  3-deoxy-d-manno-octulosonic-acid transferase  31.73 
 
 
422 aa  151  4e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2032  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.2 
 
 
310 aa  151  5e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3583  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.29 
 
 
322 aa  150  7e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000864033 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0115  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.71 
 
 
304 aa  150  7e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.113218  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4535  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.88 
 
 
345 aa  150  9e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0387275  normal  0.636684 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1616  GGDEF domain protein  45.41 
 
 
358 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.515769  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2939  GGDEF  32.9 
 
 
318 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.417006  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2812  diguanylate cyclase  33.45 
 
 
315 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1507  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.77 
 
 
308 aa  149  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.914031 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0135  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.79 
 
 
306 aa  149  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.248217 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1309  GGDEF  34.04 
 
 
334 aa  148  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365402 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>