More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0500 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0500  histidine kinase  100 
 
 
922 aa  1862    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  30.17 
 
 
1574 aa  311  2.9999999999999997e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3226  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.86 
 
 
1251 aa  296  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0796968  normal  0.806997 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.62 
 
 
1193 aa  264  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.62 
 
 
1193 aa  264  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.38 
 
 
870 aa  261  3e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4021  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.42 
 
 
1013 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.864375 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4445  response regulator/sensor histidine kinase  28.68 
 
 
1141 aa  257  7e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0288  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.15 
 
 
1141 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.35 
 
 
1410 aa  253  8.000000000000001e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0118  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.91 
 
 
1927 aa  251  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125924 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1864  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.29 
 
 
1069 aa  249  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0404414  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2349  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.62 
 
 
1093 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0868194  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2782  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.36 
 
 
1091 aa  243  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2225  histidine kinase  47.52 
 
 
845 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0086849  normal  0.197777 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2163  histidine kinase  47.87 
 
 
845 aa  241  4e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3413  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.16 
 
 
1093 aa  240  8e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.464366 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2527  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.37 
 
 
1090 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120042  normal  0.0845157 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2693  histidine kinase  29.48 
 
 
782 aa  238  4e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.145264  normal  0.474998 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.33 
 
 
1313 aa  232  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3652  Signal transduction histidine kinase-like  39.88 
 
 
765 aa  231  3e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.471696  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4410  virulence sensor protein BvgS  28.5 
 
 
948 aa  229  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.213714  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.69 
 
 
1433 aa  229  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.09 
 
 
1069 aa  228  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.5 
 
 
1369 aa  226  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0144  sensor protein evgS precursor  29.84 
 
 
830 aa  225  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4966  two-component sensor response receiver component, histidine kinase  30.09 
 
 
951 aa  224  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.292915 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2834  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.09 
 
 
808 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.83958  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.17 
 
 
833 aa  223  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.82 
 
 
1310 aa  222  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0191  sensor protein EvgS  30.22 
 
 
830 aa  223  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.337786  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0559  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.25 
 
 
704 aa  223  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.64 
 
 
1267 aa  221  3e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.7 
 
 
940 aa  221  6e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  40.58 
 
 
853 aa  220  7.999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1302  sensor histidine kinase/response regulator  47.51 
 
 
835 aa  220  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.924984  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2940  PAS  47.45 
 
 
1353 aa  219  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  47.35 
 
 
827 aa  219  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  48 
 
 
816 aa  219  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  44.79 
 
 
932 aa  219  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44.27 
 
 
667 aa  219  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.36 
 
 
738 aa  219  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  42.52 
 
 
882 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.42 
 
 
1166 aa  218  4e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2152  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.25 
 
 
985 aa  218  4e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0146455  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.98 
 
 
916 aa  218  5e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1697  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  41.84 
 
 
907 aa  218  5e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0419  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.91 
 
 
1260 aa  218  5e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.784662  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.28 
 
 
1582 aa  218  5.9999999999999996e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2788  histidine kinase  30.82 
 
 
576 aa  217  7e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.46 
 
 
1287 aa  217  9e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.88 
 
 
1452 aa  216  1.9999999999999998e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.85 
 
 
1195 aa  216  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.23 
 
 
1145 aa  215  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1035  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.68 
 
 
1201 aa  215  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  45.59 
 
 
764 aa  215  2.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0602  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.31 
 
 
1057 aa  215  3.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.862038  hitchhiker  0.00157552 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.75 
 
 
1271 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.46 
 
 
1040 aa  214  3.9999999999999995e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0726  histidine kinase  29.09 
 
 
570 aa  214  4.9999999999999996e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.408803  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1360  GAF sensor hybrid histidine kinase  46.82 
 
 
974 aa  214  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0393  histidine kinase  43.63 
 
 
1200 aa  214  5.999999999999999e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.564913 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.24 
 
 
919 aa  213  9e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0718  sensory box histidine kinase/response regulator  44.44 
 
 
589 aa  213  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.97168  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3683  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.1 
 
 
1124 aa  213  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.781779 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  45.7 
 
 
1763 aa  213  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2241  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.69 
 
 
956 aa  212  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87793  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  42.51 
 
 
1356 aa  212  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1887  transmission sensor LetS  42.58 
 
 
910 aa  212  3e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  48.96 
 
 
717 aa  212  3e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  43.68 
 
 
631 aa  212  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  46.18 
 
 
661 aa  211  4e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.98 
 
 
969 aa  211  4e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0621  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.22 
 
 
1309 aa  211  5e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.288255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.42 
 
 
1820 aa  211  6e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5573  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.75 
 
 
1203 aa  211  6e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.805596  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003637  hypothetical protein  42.13 
 
 
1055 aa  211  7e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2682  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.1 
 
 
827 aa  211  7e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.616307  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0261  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  42.91 
 
 
948 aa  211  7e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1250  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.2 
 
 
936 aa  210  8e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3595  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.54 
 
 
744 aa  210  8e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.91 
 
 
1768 aa  210  8e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2375  histidine kinase  40.94 
 
 
806 aa  210  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.824997  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.2 
 
 
1284 aa  210  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02212  Signal transduction histidine kinase  44.4 
 
 
1054 aa  210  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2858  signal transduction histidine kinase-like protein  50.83 
 
 
1001 aa  209  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.920291  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.53 
 
 
2213 aa  210  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  44.53 
 
 
929 aa  210  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  48.7 
 
 
735 aa  210  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.34 
 
 
1120 aa  209  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  45.49 
 
 
982 aa  209  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0974  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.28 
 
 
916 aa  209  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3532  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.18 
 
 
1271 aa  209  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4016  putative PAS/PAC sensor protein  44.57 
 
 
1626 aa  209  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.61 
 
 
1784 aa  208  3e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.61 
 
 
1792 aa  208  3e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.29 
 
 
927 aa  208  3e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.92 
 
 
1767 aa  208  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.61 
 
 
1786 aa  208  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.1 
 
 
1305 aa  208  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>