More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0709 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_0709  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  100 
 
 		 564 aa  1126    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2692  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  76.09 
 
 		 637 aa  801    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4272  putative PAS/PAC sensor protein  38.53 
 
 		 919 aa  296  8e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.312579  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4080  putative PAS/PAC sensor protein  34.74 
 
 		 1081 aa  261  3e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3482  putative PAS/PAC sensor protein  37.56 
 
 		 994 aa  256  1.0000000000000001e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4237  putative PAS/PAC sensor protein  36.54 
 
 		 843 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.28007  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0128  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  36.54 
 
 		 728 aa  247  4e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3382  putative PAS/PAC sensor protein  33.41 
 
 		 952 aa  236  7e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4116  putative PAS/PAC sensor protein  32.94 
 
 		 982 aa  227  5.0000000000000005e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.147835  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2128  putative PAS/PAC sensor protein  32.72 
 
 		 1059 aa  224  3e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4113  putative PAS/PAC sensor protein  33.41 
 
 		 896 aa  219  7.999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1541  putative PAS/PAC sensor protein  33.64 
 
 		 1071 aa  206  6e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0011  putative PAS/PAC sensor protein  34.34 
 
 		 781 aa  204  4e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.206274  normal  0.555511 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2813  putative PAS/PAC sensor protein  32.79 
 
 		 991 aa  200  6e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0150  putative PAS/PAC sensor protein  30.32 
 
 		 1969 aa  199  7.999999999999999e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0043  putative PAS/PAC sensor protein  31.03 
 
 		 1216 aa  194  3e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3905  putative PAS/PAC sensor protein  31.02 
 
 		 537 aa  194  5e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1262  putative PAS/PAC sensor protein  34.73 
 
 		 532 aa  193  7e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2698  putative PAS/PAC sensor protein  32.16 
 
 		 553 aa  188  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5264  putative PAS/PAC sensor protein  33.17 
 
 		 1073 aa  187  4e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.255684  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0348  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  30.45 
 
 		 700 aa  186  7e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5215  putative PAS/PAC sensor protein  30.55 
 
 		 677 aa  180  4.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3151  putative PAS/PAC sensor protein  30.11 
 
 		 1589 aa  180  8e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.274524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0683  putative PAS/PAC sensor protein  29.72 
 
 		 750 aa  173  7.999999999999999e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987157  normal  0.214918 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2147  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  30.5 
 
 		 712 aa  171  3e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1747  putative PAS/PAC sensor protein  31.55 
 
 		 524 aa  159  9e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3274  response regulator receiver protein  29.65 
 
 		 539 aa  159  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1371  putative PAS/PAC sensor protein  30.33 
 
 		 834 aa  159  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3168  putative PAS/PAC sensor protein  30.72 
 
 		 807 aa  157  5.0000000000000005e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0496  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 		 896 aa  154  5e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0317  bacterio-opsin activator  27.38 
 
 		 680 aa  152  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.331726  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0662  putative PAS/PAC sensor protein  28.47 
 
 		 644 aa  152  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3054  putative PAS/PAC sensor protein  25.79 
 
 		 1260 aa  146  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2266  putative PAS/PAC sensor protein  32.96 
 
 		 906 aa  146  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 		 653 aa  144  5e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1012  putative PAS/PAC sensor protein  31.35 
 
 		 1154 aa  144  6e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0819572  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2079  putative PAS/PAC sensor protein  30.5 
 
 		 666 aa  143  9e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0273003  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0977  putative PAS/PAC sensor protein  28.77 
 
 		 737 aa  143  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 		 530 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 		 783 aa  135  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0445794 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3065  putative PAS/PAC sensor protein  29.32 
 
 		 770 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2464  putative PAS/PAC sensor protein  29.8 
 
 		 812 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0622  putative PAS/PAC sensor protein  30.63 
 
 		 440 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0209  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 546 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  36.51 
 
 		 1171 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1305  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.49 
 
 		 598 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.42 
 
 		 1325 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.16 
 
 		 1032 aa  126  8.000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 656 aa  125  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.548294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2816  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.26 
 
 		 682 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0864703 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.67 
 
 		 657 aa  120  7e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  42.14 
 
 		 746 aa  120  9e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  31.65 
 
 		 1629 aa  119  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1495  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.14 
 
 		 389 aa  116  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.56 
 
 		 653 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1522  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.14 
 
 		 389 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2707  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.16 
 
 		 776 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0037  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 		 387 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0788  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.75 
 
 		 634 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1202  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.63 
 
 		 1126 aa  115  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.766255  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.67 
 
 		 759 aa  113  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3357  response regulator receiver protein  39.15 
 
 		 283 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2541  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 874 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3391  putative PAS/PAC sensor protein  33.89 
 
 		 1301 aa  110  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0258089  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3015  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.3 
 
 		 500 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2409  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 		 759 aa  110  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.456195  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 		 604 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5111  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.1 
 
 		 479 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4231  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.22 
 
 		 357 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113145  normal  0.678212 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1464  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.86 
 
 		 1135 aa  108  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.396763 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1653  guanylate cyclase  38.28 
 
 		 433 aa  108  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.181095  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1518  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.36 
 
 		 769 aa  107  6e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1700  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  38.82 
 
 		 553 aa  106  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.012241  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0672  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.77 
 
 		 770 aa  106  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4150  response regulator receiver protein  41.94 
 
 		 291 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0666389 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1150  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.63 
 
 		 1466 aa  104  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.765492  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1870  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 346 aa  103  6e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.181656  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4329  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 683 aa  103  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.213628  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1145  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.79 
 
 		 490 aa  103  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0011  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.87 
 
 		 952 aa  102  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0685  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.38 
 
 		 770 aa  102  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000495863 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0735  putative PAS/PAC sensor protein  28.35 
 
 		 512 aa  101  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 1354 aa  100  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2671  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.62 
 
 		 251 aa  100  9e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1932  Signal transduction histidine kinase  43.07 
 
 		 492 aa  100  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0476253  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0472  sensory box histidine kinase/response regulator  43.07 
 
 		 492 aa  99.8  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.798891  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0176  sensory box histidine kinase/response regulator  43.07 
 
 		 492 aa  99.8  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1842  response regulator/sensory box histidine kinase  43.07 
 
 		 492 aa  99.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1432  sensory box histidine kinase/response regulator  43.07 
 
 		 492 aa  99.8  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188442  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3033  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  33.52 
 
 		 777 aa  98.6  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1127  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.17 
 
 		 989 aa  98.6  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476664 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1708  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.74 
 
 		 869 aa  98.2  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2514  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.26 
 
 		 869 aa  97.8  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4378  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 		 773 aa  97.4  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2043  response regulator receiver protein  53.26 
 
 		 433 aa  97.1  7e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0665  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  32.16 
 
 		 1051 aa  96.7  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3854  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  38.78 
 
 		 386 aa  95.9  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22970  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  36.84 
 
 		 423 aa  94.7  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.376006 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4645  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.43 
 
 		 644 aa  94  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.224961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3712  putative PAS/PAC sensor protein  32.2 
 
 		 379 aa  94.4  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>