More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3015 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3015  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
500 aa  1017    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.56 
 
 
653 aa  256  6e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697975  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0583  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.38 
 
 
816 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.412959  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.34 
 
 
1138 aa  219  1e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.84915  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3003  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.11 
 
 
498 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1495  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.47 
 
 
389 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1522  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.47 
 
 
389 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0288  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 
884 aa  211  4e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0037  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.86 
 
 
387 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1725  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 
499 aa  206  8e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 
1741 aa  202  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.294056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3854  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  46.12 
 
 
386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4229  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.87 
 
 
383 aa  200  6e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.599633  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 
1516 aa  190  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1114  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 
373 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.19 
 
 
975 aa  171  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.817585  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3325  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.43 
 
 
667 aa  168  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2266  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.21 
 
 
372 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00620911 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3806  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 
533 aa  167  5e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.576691  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1700  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  27.61 
 
 
553 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.012241  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.16 
 
 
1397 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4616  GAF sensor hybrid histidine kinase  27.19 
 
 
701 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4564  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 
376 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.531352 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0066  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.76 
 
 
377 aa  159  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359193  normal  0.0132857 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1893  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 
644 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0989  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.05 
 
 
477 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1372  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 
510 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.94557  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1039  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 
1259 aa  156  9e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1131  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 
373 aa  155  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0788  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.2 
 
 
634 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2928  histidine kinase  38.02 
 
 
455 aa  154  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 
978 aa  153  7e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149383  normal  0.186346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2761  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.3 
 
 
679 aa  153  7e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.47205 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5317  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 
421 aa  153  7e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3394  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 
728 aa  150  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.99137  normal  0.249099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.91 
 
 
1178 aa  150  7e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3813  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.84 
 
 
963 aa  149  9e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000539796  normal  0.0501343 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1477  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 
511 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.635572  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5621  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.46 
 
 
1258 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879931  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.29 
 
 
927 aa  148  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0595  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 
752 aa  146  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 
405 aa  146  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2493  PAS sensor protein  35.92 
 
 
394 aa  146  8.000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0714891  decreased coverage  0.00496497 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0065  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 
377 aa  146  1e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1041  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 
1406 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.845277 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0618  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 
1484 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0393x  response regulator, histidine kinase  32.47 
 
 
943 aa  145  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.621999  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.42 
 
 
919 aa  145  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2748  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.45 
 
 
476 aa  144  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.662437  normal  0.393877 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.44 
 
 
652 aa  144  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.950985 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2811  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.22 
 
 
498 aa  143  6e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.782124  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3554  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 
541 aa  143  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.32039  normal  0.384329 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.02 
 
 
1369 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2317  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.85 
 
 
657 aa  141  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.553373  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.34 
 
 
511 aa  141  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3143  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.64 
 
 
652 aa  141  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.417887  normal  0.0487579 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 
701 aa  140  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.14 
 
 
509 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.923259 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.14 
 
 
508 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.45 
 
 
1287 aa  140  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1870  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.47 
 
 
657 aa  138  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240453  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.64 
 
 
759 aa  138  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77937  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 
568 aa  139  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0992  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.69 
 
 
663 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374279  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02206  hypothetical protein  28.16 
 
 
827 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 
1043 aa  137  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4783  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.31 
 
 
680 aa  137  7.000000000000001e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.302794  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.75 
 
 
846 aa  136  8e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  32.33 
 
 
1046 aa  136  9e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2947  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.2 
 
 
503 aa  136  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.36 
 
 
637 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2816  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.36 
 
 
682 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0864703 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
1010 aa  135  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2108  multisensor signal transduction histidine kinase  24.22 
 
 
492 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5555  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 
416 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.786855  normal  0.0266117 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.01 
 
 
1767 aa  134  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.01 
 
 
1767 aa  134  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0781  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 
1101 aa  134  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.114215 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0974  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.27 
 
 
916 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1932  Signal transduction histidine kinase  26.63 
 
 
492 aa  134  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0476253  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1432  sensory box histidine kinase/response regulator  26.73 
 
 
492 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188442  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1842  response regulator/sensory box histidine kinase  26.73 
 
 
492 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3829  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 
475 aa  133  7.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.821642 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0176  sensory box histidine kinase/response regulator  26.73 
 
 
492 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0472  sensory box histidine kinase/response regulator  26.73 
 
 
492 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.798891  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  27.38 
 
 
1322 aa  133  9e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1113  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.29 
 
 
1042 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0247  ATPase domain-containing protein  35.74 
 
 
628 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3771  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 
1039 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5380  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 
625 aa  132  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00714338  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5761  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.24 
 
 
1204 aa  131  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.122146 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.72 
 
 
1177 aa  131  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.83 
 
 
1431 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0139  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 
1066 aa  130  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00931  aerobic respiration control sensor protein ArcB  27.86 
 
 
786 aa  131  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2666  histidine kinase  33.33 
 
 
586 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0592074  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2792  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 
930 aa  130  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.111634 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.05 
 
 
738 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2393  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.65 
 
 
676 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00822967 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.75 
 
 
1767 aa  130  6e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>