More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1556 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_0484  multi-sensor histidine kinase  44.79 
 
 
1255 aa  657    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.908962 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
1397 aa  2846    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5043  PAS  39.48 
 
 
855 aa  444  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.563138  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.71 
 
 
2213 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.66 
 
 
1202 aa  383  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2015  putative PAS/PAC sensor protein  31.9 
 
 
1119 aa  376  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000673901 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0139  histidine kinase  35.91 
 
 
1064 aa  360  9.999999999999999e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1381  Signal transduction histidine kinase-like protein  25.7 
 
 
1468 aa  355  2.9999999999999997e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.770562  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  31.93 
 
 
1765 aa  343  2e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.08 
 
 
1118 aa  338  3.9999999999999995e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.27 
 
 
1267 aa  338  5e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.57 
 
 
1771 aa  337  7.999999999999999e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.66 
 
 
1786 aa  337  1e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.75 
 
 
1767 aa  337  1e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  32 
 
 
1792 aa  336  2e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.37 
 
 
1784 aa  335  3e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.68 
 
 
1768 aa  335  3e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.92 
 
 
1765 aa  335  5e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.28 
 
 
1767 aa  333  1e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.97 
 
 
816 aa  333  1e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  31.92 
 
 
1763 aa  333  2e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.51 
 
 
1767 aa  332  3e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.28 
 
 
1326 aa  332  4e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.01 
 
 
977 aa  331  7e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0987  histidine kinase  34.22 
 
 
938 aa  330  9e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.718308  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.21 
 
 
1313 aa  327  9e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4605  histidine protein kinase  39.15 
 
 
1309 aa  326  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.292459  normal  0.0589738 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.44 
 
 
1245 aa  324  9.999999999999999e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.13 
 
 
1305 aa  323  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2787  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.49 
 
 
909 aa  322  3.9999999999999996e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319908  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4067  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.41 
 
 
1490 aa  321  5e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  33.38 
 
 
923 aa  320  1e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.59 
 
 
1611 aa  320  2e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0384  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.82 
 
 
1692 aa  319  2e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  37.97 
 
 
1177 aa  318  4e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  38.54 
 
 
758 aa  316  1.9999999999999998e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.73 
 
 
1442 aa  314  9e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.37 
 
 
921 aa  312  2.9999999999999997e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.95 
 
 
1240 aa  309  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.24 
 
 
993 aa  308  4.0000000000000004e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.295041 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.64 
 
 
1820 aa  307  9.000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  31.65 
 
 
1014 aa  307  1.0000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  29.87 
 
 
1322 aa  306  2.0000000000000002e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1037  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.95 
 
 
793 aa  305  3.0000000000000004e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 
833 aa  305  4.0000000000000003e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.04 
 
 
1582 aa  304  7.000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.35 
 
 
916 aa  303  1e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2078  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.72 
 
 
990 aa  302  2e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.553649  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 
929 aa  302  3e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1596  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.38 
 
 
705 aa  301  5e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1434  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.45 
 
 
1186 aa  301  6e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.67 
 
 
1165 aa  297  9e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.01 
 
 
1284 aa  296  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.3 
 
 
1398 aa  295  6e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2502  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.93 
 
 
957 aa  294  7e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000217317 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2946  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.9 
 
 
1303 aa  294  9e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2554  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.42 
 
 
876 aa  293  1e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00476673 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5724  two-component regulatory system sensory histidine kinase  36.83 
 
 
784 aa  293  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2152  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.15 
 
 
985 aa  293  1e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0146455  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.09 
 
 
1313 aa  293  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.05 
 
 
1266 aa  292  3e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.84 
 
 
1340 aa  292  3e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.88 
 
 
1310 aa  292  3e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.99 
 
 
1245 aa  291  6e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2022  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.38 
 
 
1258 aa  290  1e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.250401  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0066  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.54 
 
 
721 aa  290  1e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.46 
 
 
1230 aa  290  1e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.31 
 
 
1193 aa  288  4e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.22 
 
 
1397 aa  288  7e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  37.73 
 
 
1407 aa  287  1.0000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  26.65 
 
 
1179 aa  285  5.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00475  two-component system sensor histidine kinase-response regulator hybridprotein  30.28 
 
 
1364 aa  285  6.000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.679058  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0621  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.97 
 
 
1309 aa  285  6.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.288255 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19340  putative sensor/response regulator hybrid  36.69 
 
 
918 aa  285  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.44 
 
 
745 aa  284  7.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233978  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.27 
 
 
1333 aa  284  7.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202305 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3706  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.76 
 
 
738 aa  284  8.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2842  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.91 
 
 
936 aa  283  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.870655 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  43 
 
 
1369 aa  283  2e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3409  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.6 
 
 
2654 aa  283  2e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1512  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.11 
 
 
1480 aa  281  6e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0878697 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.01 
 
 
1042 aa  280  1e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3702  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.27 
 
 
1234 aa  280  1e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0538  ATP-binding region, ATPase-like protein  28.92 
 
 
1233 aa  280  2e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  33.7 
 
 
823 aa  279  3e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1665  putative sensor/response regulator hybrid  35.68 
 
 
918 aa  278  4e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.879832  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  30.45 
 
 
1574 aa  278  5e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1704  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.6 
 
 
1168 aa  277  8e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.2 
 
 
946 aa  278  8e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4645  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.41 
 
 
948 aa  277  9e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0588  ATP-binding region ATPase domain protein  31.55 
 
 
1068 aa  276  2.0000000000000002e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.9 
 
 
995 aa  276  2.0000000000000002e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4016  putative PAS/PAC sensor protein  34.5 
 
 
1626 aa  276  3e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0416  histidine kinase  33.63 
 
 
896 aa  276  3e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3158  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.28 
 
 
1131 aa  275  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0979379 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.17 
 
 
1236 aa  275  3e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4322  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.69 
 
 
1245 aa  275  4.0000000000000004e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3731  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.54 
 
 
1238 aa  275  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0316  response regulator, histidine kinase  34.15 
 
 
891 aa  275  4.0000000000000004e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.304506  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0576  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.25 
 
 
1236 aa  275  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>