More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1477 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1372  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  90.59 
 
 
510 aa  949    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.94557  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1477  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
511 aa  1049    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.635572  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2337  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55 
 
 
564 aa  299  7e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139979  normal  0.523633 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2666  histidine kinase  54.41 
 
 
586 aa  296  8e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0592074  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2527  histidine kinase  43.67 
 
 
535 aa  179  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0731082 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4983  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.67 
 
 
535 aa  179  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0185741 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.92 
 
 
535 aa  176  7e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0433443  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2942  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.92 
 
 
535 aa  176  7e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 
463 aa  176  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5322  histidine kinase sensor  37.92 
 
 
529 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.968492 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1893  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 
644 aa  171  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2761  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 
679 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.47205 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3431  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 
844 aa  166  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.737925 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1550  ATP-binding region, ATPase-like protein  37.5 
 
 
531 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221639  normal  0.141787 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3784  histidine kinase  36.82 
 
 
496 aa  164  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540279  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0583  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 
816 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.412959  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0699  signal transduction histidine kinase  28.84 
 
 
744 aa  158  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.324444  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 
770 aa  157  5.0000000000000005e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255804  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3554  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 
541 aa  157  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.32039  normal  0.384329 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 
405 aa  156  7e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2060  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.88 
 
 
1111 aa  156  8e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.749505  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 
911 aa  155  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0037  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 
387 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.22 
 
 
701 aa  150  6e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3015  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 
500 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5317  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.22 
 
 
421 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  25.96 
 
 
1159 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3365  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 
733 aa  147  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  25.96 
 
 
1159 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00164  sensor histidine kinase  26.12 
 
 
1177 aa  147  5e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2695  sensor histidine kinase  26.12 
 
 
1147 aa  147  5e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02398  sensor histidine kinase  28.76 
 
 
881 aa  147  5e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1131  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 
373 aa  147  6e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0139  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.52 
 
 
1066 aa  146  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 
1138 aa  146  7.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.84915  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4741  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 
474 aa  146  8.000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.130107  normal  0.303178 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2078  sensor histidine kinase/response regulator  26.29 
 
 
1141 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.45474  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0065  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 
377 aa  145  1e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1250  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.12 
 
 
1158 aa  146  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0252543 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 
359 aa  145  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.95 
 
 
1174 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854881  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2074  sensor histidine kinase  27.54 
 
 
816 aa  145  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1864  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.56 
 
 
1159 aa  145  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0562222 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 
581 aa  145  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.79 
 
 
1159 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948496  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2018  ATP-binding region, ATPase-like  28.54 
 
 
771 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88254  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 
769 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1534  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.21 
 
 
1140 aa  144  4e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.254728  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002203  sensor histidine kinase  25.75 
 
 
1055 aa  144  5e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.88 
 
 
1159 aa  143  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0372313  normal  0.867611 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 
1516 aa  143  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2557  histidine kinase  26.61 
 
 
1142 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.257497  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2084  sensor histidine kinase  27.25 
 
 
816 aa  142  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3003  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.39 
 
 
498 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3436  histidine kinase  28.12 
 
 
771 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.416045  normal  0.0284383 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.82 
 
 
1140 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178694  hitchhiker  0.00103188 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2522  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.98 
 
 
1146 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00042371 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1200  Signal transduction histidine kinase  28.25 
 
 
779 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4607  histidine kinase  33.9 
 
 
696 aa  142  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.998833  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2744  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.03 
 
 
446 aa  142  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000449051 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3846  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 
352 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0618  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 
1484 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3930  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 
342 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0182336 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4025  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.76 
 
 
1159 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0792472  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 
815 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2742  sensor histidine kinase/response regulator  25.98 
 
 
1145 aa  141  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  34 
 
 
486 aa  141  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.84 
 
 
969 aa  141  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00719  Multidomain protein contains Na+/proline symporter PutP-like domain, sensory histidine kinase and receiver domain  29.57 
 
 
1147 aa  141  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.82 
 
 
1172 aa  140  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 
473 aa  140  4.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.77 
 
 
973 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
795 aa  140  6e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.228463 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0165  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.75 
 
 
1168 aa  140  7.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.851256 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 
775 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0491237  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2829  membrane associated response regulator, histidine kinase  24.44 
 
 
1148 aa  139  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.96 
 
 
737 aa  139  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.224344 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0956  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.19 
 
 
600 aa  139  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1702  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 
608 aa  139  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0620  two component sensor kinase/response regulator hybrid  27.7 
 
 
1169 aa  138  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2433  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.46 
 
 
1146 aa  138  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0224  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.3 
 
 
1167 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3767  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 
587 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634012  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.46 
 
 
1146 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248753 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35230  integral membrane sensor hybrid histidine protein kinase  25.37 
 
 
1161 aa  137  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234785  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5379  histidine kinase  32.28 
 
 
698 aa  137  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4714  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 
528 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5476  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 
782 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0268  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 
764 aa  136  8e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0862951 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.22 
 
 
592 aa  136  8e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 
584 aa  136  9e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2033  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.63 
 
 
797 aa  136  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02256  Multidomain protein, contains Na+/proline symporter PutP-like domain, sensory histidine kinase and receiver domain  27 
 
 
1006 aa  136  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.371064  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.63 
 
 
1352 aa  136  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.72 
 
 
1145 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1749  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.46 
 
 
1146 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0353406  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3094  two-component sensor histidine kinase  27.95 
 
 
774 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 
1741 aa  134  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.294056 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1373  two component sensor kinase  25.88 
 
 
790 aa  134  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0274  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.44 
 
 
1169 aa  134  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>