More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2033 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2033  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 797 aa  1628    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0268  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.64 
 
 		 764 aa  740    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0862951 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0477  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.28 
 
 		 786 aa  716    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0514  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.41 
 
 		 786 aa  724    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.292682 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3436  histidine kinase  47.19 
 
 		 771 aa  681    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.416045  normal  0.0284383 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.14 
 
 		 769 aa  676    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.16 
 
 		 775 aa  656    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0491237  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3094  two-component sensor histidine kinase  46.34 
 
 		 774 aa  662    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0543  PAS sensor protein  49.15 
 
 		 786 aa  715    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0831512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2018  ATP-binding region, ATPase-like  47.66 
 
 		 771 aa  670    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88254  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  70.8 
 
 		 795 aa  1072    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.228463 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5476  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.9 
 
 		 782 aa  759    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2369  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.8 
 
 		 793 aa  659    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315374 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.87 
 
 		 770 aa  734    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1449  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.01 
 
 		 775 aa  634  1e-180  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00109411  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1200  Signal transduction histidine kinase  43.81 
 
 		 779 aa  625  1e-177  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.06 
 
 		 784 aa  598  1e-170  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501852  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0616  sensory box histidine kinase  43.93 
 
 		 783 aa  596  1e-169  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0615  sensory box histidine kinase  43.93 
 
 		 783 aa  596  1e-169  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0905  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.83 
 
 		 774 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1373  two component sensor kinase  45.48 
 
 		 790 aa  572  1e-161  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0929  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.37 
 
 		 769 aa  567  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0582666 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 		 769 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0641  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.82 
 
 		 772 aa  545  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0438  putative non-motile and phage-resistance protein  35.95 
 
 		 773 aa  499  1e-139  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0956  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.59 
 
 		 600 aa  474  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.89 
 
 		 911 aa  395  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3431  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.71 
 
 		 844 aa  358  1.9999999999999998e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.737925 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1772  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.61 
 
 		 1169 aa  233  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.914739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2154  hypothetical protein  33.98 
 
 		 786 aa  224  4.9999999999999996e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0411448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0648  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 		 661 aa  218  4e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.16 
 
 		 798 aa  213  7.999999999999999e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0658643 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.84 
 
 		 1501 aa  207  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3284  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 856 aa  204  4e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0250894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  42.31 
 
 		 778 aa  204  8e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.74 
 
 		 617 aa  201  6e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0066  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 		 773 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.712477  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44.68 
 
 		 687 aa  199  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1935  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.1 
 
 		 523 aa  191  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0899  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.32 
 
 		 562 aa  191  5e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000736499  normal  0.0870171 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.99 
 
 		 1313 aa  188  3e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1010  histidine kinase  39.87 
 
 		 503 aa  188  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1639  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 583 aa  187  6e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19247  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1238  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.61 
 
 		 579 aa  186  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0280549 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.6 
 
 		 1622 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.98 
 
 		 484 aa  184  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197112  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.44 
 
 		 1352 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  40 
 
 		 1046 aa  184  6e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.68 
 
 		 1274 aa  184  8.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1119  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.76 
 
 		 502 aa  182  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.092302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  30.19 
 
 		 1560 aa  182  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1357  cytoplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.86 
 
 		 849 aa  182  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.31 
 
 		 468 aa  182  2.9999999999999997e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229393  normal  0.25439 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0025  histidine kinase  31.86 
 
 		 849 aa  180  8e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0711  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.15 
 
 		 646 aa  180  8e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.386988 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0484  multi-sensor histidine kinase  26.89 
 
 		 1255 aa  180  9e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.908962 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2574  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 512 aa  179  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  39.68 
 
 		 461 aa  180  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2590  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.79 
 
 		 1959 aa  179  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0694001 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.99 
 
 		 513 aa  180  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.98 
 
 		 456 aa  179  2e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1418  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.62 
 
 		 853 aa  179  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.62 
 
 		 377 aa  178  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.360727  normal  0.404582 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0700  PAS sensor protein  38.43 
 
 		 648 aa  177  6e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4820  histidine kinase  42.45 
 
 		 513 aa  177  7e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.780698  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0099  signal transduction histidine kinase-like protein  30.77 
 
 		 938 aa  177  7e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.878773 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.6 
 
 		 631 aa  177  7e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3543  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.34 
 
 		 1603 aa  176  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00143205 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0413  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 		 1276 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0153135  hitchhiker  0.00020462 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4457  histidine kinase  38.87 
 
 		 461 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4476  histidine kinase  38.87 
 
 		 461 aa  176  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0860551  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0827  two component sensor kinase  32.49 
 
 		 1410 aa  176  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0400  PAS sensor signal transduction histidine kinase  38.4 
 
 		 436 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.257658  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  42.37 
 
 		 508 aa  175  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1670  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.76 
 
 		 494 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422523 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0381  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 		 1296 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00957634 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1884  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.07 
 
 		 389 aa  174  5e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 		 763 aa  174  9e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  31.63 
 
 		 823 aa  173  9e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2185  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.42 
 
 		 531 aa  173  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1464  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.2 
 
 		 1135 aa  173  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.396763 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.87 
 
 		 530 aa  172  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.227598  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2805  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32 
 
 		 927 aa  172  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0617  histidine kinase  42.29 
 
 		 525 aa  171  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.99 
 
 		 1611 aa  171  3e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2003  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.5 
 
 		 1109 aa  172  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.19 
 
 		 846 aa  171  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 		 530 aa  171  5e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109713  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3332  sensor histidine kinase/response regulator  32.27 
 
 		 819 aa  171  5e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 		 1138 aa  171  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.619733  normal  0.530694 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3007  two component system histidine kinase  38.59 
 
 		 729 aa  170  8e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0422303  hitchhiker  0.00299589 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3460  putative sensor histidine kinase, putative membrane protein  40.08 
 
 		 532 aa  170  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.305573 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0015  histidine kinase  30.15 
 
 		 868 aa  170  9e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.461208 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0673  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.43 
 
 		 643 aa  170  9e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1553  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 		 505 aa  170  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0848  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.38 
 
 		 513 aa  169  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88824  normal  0.551331 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.73 
 
 		 509 aa  169  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1005  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 		 646 aa  169  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.442988  decreased coverage  0.0000217029 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2944  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  38.81 
 
 		 573 aa  169  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1409  Signal transduction histidine kinase-like  26.71 
 
 		 685 aa  169  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>