More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0827 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0413  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  71.27 
 
 		 1276 aa  753    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0153135  hitchhiker  0.00020462 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  69.52 
 
 		 1138 aa  727    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.619733  normal  0.530694 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0827  two component sensor kinase  100 
 
 		 1410 aa  2816    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0381  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  68.55 
 
 		 1296 aa  758    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00957634 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0171  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.29 
 
 		 1192 aa  677    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3923  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  52.79 
 
 		 1055 aa  560  1e-158  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1606  sensory box histidine kinase  53.93 
 
 		 1035 aa  553  1e-156  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23328  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1549  sensory box histidine kinase  53.75 
 
 		 1035 aa  550  1e-154  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3474  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.78 
 
 		 836 aa  406  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0680  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50.79 
 
 		 728 aa  386  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.391065 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1249  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.03 
 
 		 1031 aa  384  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.244216  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4618  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.22 
 
 		 1191 aa  383  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5204  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.69 
 
 		 969 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.299525  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1447  histidine kinase A-like  40.81 
 
 		 1201 aa  373  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1469  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.15 
 
 		 1149 aa  365  4e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3942  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 		 1188 aa  364  7.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0478025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6820  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.28 
 
 		 981 aa  360  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0915227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1012  Signal transduction histidine kinase  39.43 
 
 		 1005 aa  356  2e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.948548  normal  0.15115 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2784  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 		 841 aa  248  9e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.759601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2561  PAS sensor protein  35.03 
 
 		 846 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.218837  normal  0.950665 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 		 798 aa  223  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0658643 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.03 
 
 		 717 aa  215  4.9999999999999996e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  42.91 
 
 		 778 aa  213  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2493  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 		 853 aa  213  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1935  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 		 523 aa  209  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0066  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  40.58 
 
 		 773 aa  208  7e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.712477  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.32 
 
 		 377 aa  205  6e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.360727  normal  0.404582 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4820  histidine kinase  41.54 
 
 		 513 aa  201  9e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.780698  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0438  putative non-motile and phage-resistance protein  40.64 
 
 		 773 aa  200  1.0000000000000001e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2574  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.92 
 
 		 512 aa  201  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0215  sensor histidine kinase  41.56 
 
 		 470 aa  199  4.0000000000000005e-49  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00343195  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.64 
 
 		 769 aa  198  6e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3431  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.77 
 
 		 844 aa  197  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.737925 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0848  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.15 
 
 		 513 aa  196  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88824  normal  0.551331 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1884  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 		 389 aa  196  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1373  two component sensor kinase  40.37 
 
 		 790 aa  195  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0956  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.97 
 
 		 600 aa  195  4e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2079  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.57 
 
 		 511 aa  195  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.964001  normal  0.759382 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2316  histidine kinase  40.57 
 
 		 511 aa  195  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.7 
 
 		 530 aa  194  9e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109713  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0873  histidine kinase  40.52 
 
 		 513 aa  194  9e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0912  ATPase domain-containing protein  40.52 
 
 		 513 aa  194  9e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2051  two component sensor kinase  40.57 
 
 		 511 aa  194  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0885  sensor histidine kinase  39.68 
 
 		 470 aa  194  1e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2064  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 		 533 aa  194  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0167055  normal  0.0634721 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1449  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.95 
 
 		 775 aa  194  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00109411  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3460  putative sensor histidine kinase, putative membrane protein  39.31 
 
 		 532 aa  193  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.305573 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 		 617 aa  193  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1212  Signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 		 536 aa  192  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.39876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3436  histidine kinase  41.46 
 
 		 771 aa  192  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.416045  normal  0.0284383 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1119  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.23 
 
 		 502 aa  192  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.092302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.98 
 
 		 511 aa  192  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.7 
 
 		 530 aa  192  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.227598  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 911 aa  192  5e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2185  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 		 531 aa  191  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1200  Signal transduction histidine kinase  41.84 
 
 		 779 aa  190  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.8 
 
 		 775 aa  191  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0491237  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1358  histidine kinase  39.02 
 
 		 288 aa  191  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.688927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0641  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 		 772 aa  191  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2018  ATP-binding region, ATPase-like  41.53 
 
 		 771 aa  189  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88254  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1469  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.64 
 
 		 536 aa  189  4e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.997673  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1035  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.52 
 
 		 1041 aa  188  5e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73134 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 456 aa  188  6e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  30.65 
 
 		 823 aa  187  1.0000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0905  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.04 
 
 		 774 aa  187  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3094  two-component sensor histidine kinase  40.5 
 
 		 774 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.24 
 
 		 882 aa  186  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 		 769 aa  185  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.59 
 
 		 468 aa  186  4.0000000000000006e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229393  normal  0.25439 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1749  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 		 511 aa  185  6e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 		 770 aa  185  6e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0929  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.15 
 
 		 769 aa  184  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0582666 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0484  multi-sensor histidine kinase  31.15 
 
 		 1255 aa  184  8.000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.908962 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.41 
 
 		 784 aa  183  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501852  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0327  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  40.39 
 
 		 620 aa  183  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3481  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.51 
 
 		 704 aa  183  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112139 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1238  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 		 579 aa  182  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0280549 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.78 
 
 		 518 aa  181  8e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5383  Signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 		 784 aa  181  9e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.626951  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0514  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 		 786 aa  181  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.292682 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1670  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 494 aa  179  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422523 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0615  sensory box histidine kinase  39.41 
 
 		 783 aa  179  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0616  sensory box histidine kinase  39.41 
 
 		 783 aa  179  3e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0534  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.98 
 
 		 697 aa  179  4e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.608337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 		 568 aa  178  6e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.98 
 
 		 866 aa  178  8e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1553  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.7 
 
 		 505 aa  177  9e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.86 
 
 		 594 aa  177  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1284  sensor histidine kinase  36.18 
 
 		 475 aa  177  1.9999999999999998e-42  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0711  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.25 
 
 		 646 aa  176  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.386988 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1010  histidine kinase  38.98 
 
 		 503 aa  176  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0700  PAS sensor protein  32.25 
 
 		 648 aa  176  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2221  Signal transduction histidine kinase  38.21 
 
 		 605 aa  176  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.763849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0648  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 		 661 aa  176  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1639  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 		 583 aa  175  5e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19247  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2033  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 		 797 aa  175  5e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 1046 aa  175  6.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0673  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 643 aa  175  6.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2119  multisensor signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 		 582 aa  174  7.999999999999999e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.15 
 
 		 484 aa  173  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197112  normal  0.954465 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>