More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0700 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  65.24 
 
 		 630 aa  712    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.591777 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0700  PAS sensor protein  100 
 
 		 648 aa  1276    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0711  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  98.92 
 
 		 646 aa  1258    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.386988 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0673  multi-sensor signal transduction histidine kinase  92.57 
 
 		 643 aa  1170    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0712  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  59.93 
 
 		 605 aa  594  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0997338  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1778  multi-sensor signal transduction histidine kinase  59.41 
 
 		 606 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.415214  decreased coverage  0.0072817 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3515  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.58 
 
 		 627 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.1939  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1944  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.75 
 
 		 607 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.133284  normal  0.0645132 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2063  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.14 
 
 		 610 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2221  Signal transduction histidine kinase  43.52 
 
 		 605 aa  388  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.763849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3045  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.93 
 
 		 587 aa  382  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2623  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.81 
 
 		 614 aa  376  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1779  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.4 
 
 		 612 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.546306  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1639  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 		 583 aa  300  4e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19247  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1670  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.5 
 
 		 494 aa  295  2e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422523 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0617  histidine kinase  45.53 
 
 		 525 aa  264  3e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.66 
 
 		 513 aa  254  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1010  histidine kinase  38.19 
 
 		 503 aa  252  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2683  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.39 
 
 		 614 aa  244  3.9999999999999997e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.32 
 
 		 484 aa  242  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197112  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1305  two component sensor kinase  39.85 
 
 		 599 aa  235  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.282696  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0577  sensor histidine kinase  35.49 
 
 		 609 aa  235  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0577  sensor histidine kinase  35.29 
 
 		 609 aa  232  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.704828  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0877  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.09 
 
 		 548 aa  229  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.991624  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0648  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 		 661 aa  227  7e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1238  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 		 579 aa  218  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0280549 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0905  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.45 
 
 		 774 aa  211  4e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.17 
 
 		 717 aa  207  4e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.03 
 
 		 784 aa  207  5e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501852  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.43 
 
 		 911 aa  203  9e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.35 
 
 		 646 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 		 617 aa  202  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422617  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0616  sensory box histidine kinase  43.6 
 
 		 783 aa  201  3e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0615  sensory box histidine kinase  43.6 
 
 		 783 aa  201  3e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  44.22 
 
 		 778 aa  201  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0956  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 		 600 aa  201  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.06 
 
 		 770 aa  201  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2018  ATP-binding region, ATPase-like  42.29 
 
 		 771 aa  199  9e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88254  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1553  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.17 
 
 		 505 aa  199  9e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0899  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.83 
 
 		 562 aa  199  2.0000000000000003e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000736499  normal  0.0870171 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.78 
 
 		 1352 aa  197  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3436  histidine kinase  41.9 
 
 		 771 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.416045  normal  0.0284383 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3094  two-component sensor histidine kinase  40.37 
 
 		 774 aa  197  6e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 		 775 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0491237  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 1046 aa  195  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.57 
 
 		 769 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5476  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.73 
 
 		 782 aa  194  6e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3431  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.3 
 
 		 844 aa  193  7e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.737925 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.31 
 
 		 767 aa  192  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0438  putative non-motile and phage-resistance protein  39.11 
 
 		 773 aa  191  4e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0641  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.93 
 
 		 772 aa  191  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.18 
 
 		 973 aa  191  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1373  two component sensor kinase  42.62 
 
 		 790 aa  190  5.999999999999999e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 456 aa  190  5.999999999999999e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.7 
 
 		 798 aa  189  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0658643 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0268  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.87 
 
 		 764 aa  189  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0862951 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0327  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  44.77 
 
 		 620 aa  188  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1358  histidine kinase  43.98 
 
 		 288 aa  188  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.688927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.68 
 
 		 568 aa  187  8e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1935  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.15 
 
 		 523 aa  186  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0929  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.25 
 
 		 769 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0582666 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0955  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 		 765 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2202  histidine kinase  39.13 
 
 		 613 aa  185  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.143763  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2944  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 		 573 aa  184  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.42 
 
 		 769 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0912  ATPase domain-containing protein  43.75 
 
 		 513 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0873  histidine kinase  43.75 
 
 		 513 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0848  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.33 
 
 		 513 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88824  normal  0.551331 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.25 
 
 		 969 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1449  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.87 
 
 		 775 aa  184  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00109411  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3009  histidine kinase  38.82 
 
 		 603 aa  183  7e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4820  histidine kinase  41.25 
 
 		 513 aa  183  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.780698  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2574  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.25 
 
 		 512 aa  183  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3007  two component system histidine kinase  28.87 
 
 		 729 aa  182  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0422303  hitchhiker  0.00299589 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.43 
 
 		 518 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0381  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.62 
 
 		 1296 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00957634 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0215  sensor histidine kinase  36.76 
 
 		 470 aa  181  4e-44  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00343195  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1749  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.92 
 
 		 511 aa  181  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 1138 aa  181  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.619733  normal  0.530694 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0171  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.85 
 
 		 1192 aa  181  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.76 
 
 		 468 aa  181  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229393  normal  0.25439 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.77 
 
 		 377 aa  181  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.360727  normal  0.404582 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2051  two component sensor kinase  41.67 
 
 		 511 aa  181  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0413  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.25 
 
 		 1276 aa  181  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0153135  hitchhiker  0.00020462 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2316  histidine kinase  40.83 
 
 		 511 aa  180  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2079  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.83 
 
 		 511 aa  180  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.964001  normal  0.759382 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.98 
 
 		 1363 aa  179  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1473  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.16 
 
 		 1380 aa  179  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2393  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.37 
 
 		 676 aa  178  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00822967 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1100  PAS  36.36 
 
 		 576 aa  177  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2119  multisensor signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 		 582 aa  177  4e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0827  two component sensor kinase  32.25 
 
 		 1410 aa  177  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1884  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.37 
 
 		 389 aa  176  8e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.98 
 
 		 795 aa  176  9e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.228463 
 
 
-
 
NC_004310  BR1606  sensory box histidine kinase  39.1 
 
 		 1035 aa  176  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23328  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1200  Signal transduction histidine kinase  38.17 
 
 		 779 aa  176  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0996  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.71 
 
 		 832 aa  175  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2033  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.43 
 
 		 797 aa  175  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5419  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.26 
 
 		 713 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2675  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.41 
 
 		 708 aa  175  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877  normal  0.897929 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>