More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0936 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
617 aa  1241    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422617  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.88 
 
 
717 aa  259  1e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  39.95 
 
 
778 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1935  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.01 
 
 
523 aa  242  1e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.01 
 
 
798 aa  241  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0658643 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.23 
 
 
911 aa  239  6.999999999999999e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0956  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.85 
 
 
600 aa  238  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0905  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.14 
 
 
774 aa  237  4e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50.21 
 
 
770 aa  236  9e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255804  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0616  sensory box histidine kinase  47.01 
 
 
783 aa  235  2.0000000000000002e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0615  sensory box histidine kinase  47.01 
 
 
783 aa  235  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3431  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.46 
 
 
844 aa  234  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.737925 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.55 
 
 
784 aa  234  4.0000000000000004e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501852  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1884  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  50.41 
 
 
389 aa  233  6e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329348  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.27 
 
 
377 aa  232  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.360727  normal  0.404582 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0215  sensor histidine kinase  44.11 
 
 
470 aa  230  6e-59  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00343195  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0438  putative non-motile and phage-resistance protein  44.83 
 
 
773 aa  228  3e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 
769 aa  227  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459877  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3460  putative sensor histidine kinase, putative membrane protein  48.76 
 
 
532 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.305573 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1373  two component sensor kinase  42.95 
 
 
790 aa  226  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2948  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.41 
 
 
1000 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.420098  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 
456 aa  224  3e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2185  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.93 
 
 
531 aa  224  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.8 
 
 
530 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109713  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0929  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.88 
 
 
769 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0582666 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0648  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.69 
 
 
661 aa  221  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173169  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2079  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.85 
 
 
511 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.964001  normal  0.759382 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2018  ATP-binding region, ATPase-like  44.81 
 
 
771 aa  220  6e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88254  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.4 
 
 
530 aa  220  6e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.227598  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1449  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.4 
 
 
775 aa  220  7e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00109411  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2316  histidine kinase  47.93 
 
 
511 aa  220  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243806  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.52 
 
 
511 aa  220  7e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5204  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.94 
 
 
969 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.299525  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1553  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  47.76 
 
 
505 aa  219  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.15 
 
 
468 aa  219  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229393  normal  0.25439 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1119  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.96 
 
 
502 aa  219  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.092302  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0066  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  39.18 
 
 
773 aa  218  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.712477  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3436  histidine kinase  45.23 
 
 
771 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.416045  normal  0.0284383 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2064  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.4 
 
 
533 aa  219  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0167055  normal  0.0634721 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0885  sensor histidine kinase  43.67 
 
 
470 aa  217  5e-55  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1212  Signal transduction histidine kinase  46.69 
 
 
536 aa  217  5.9999999999999996e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.39876  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.06 
 
 
775 aa  217  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0491237  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0641  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.3 
 
 
772 aa  216  7e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1238  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.86 
 
 
579 aa  216  8e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0280549 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3515  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.75 
 
 
627 aa  216  9e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.1939  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3481  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.29 
 
 
704 aa  215  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.112139 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2051  two component sensor kinase  47.97 
 
 
511 aa  215  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4820  histidine kinase  45.68 
 
 
513 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.780698  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1749  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.75 
 
 
511 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1469  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.28 
 
 
536 aa  214  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.997673  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1200  Signal transduction histidine kinase  43.44 
 
 
779 aa  214  4.9999999999999996e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2574  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.31 
 
 
512 aa  213  7.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.07 
 
 
769 aa  213  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3094  two-component sensor histidine kinase  43.15 
 
 
774 aa  211  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0514  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 
786 aa  211  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.292682 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2944  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 
573 aa  210  8e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3563  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.63 
 
 
1023 aa  208  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1606  sensory box histidine kinase  34.96 
 
 
1035 aa  208  3e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23328  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0848  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.9 
 
 
513 aa  207  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88824  normal  0.551331 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1100  PAS  35.96 
 
 
576 aa  207  4e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897667  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1549  sensory box histidine kinase  35.05 
 
 
1035 aa  207  4e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0327  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  46.85 
 
 
620 aa  207  4e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1358  histidine kinase  46.47 
 
 
288 aa  207  4e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.688927  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3045  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 
587 aa  207  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 
1138 aa  206  8e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.619733  normal  0.530694 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0899  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.8 
 
 
562 aa  206  8e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000736499  normal  0.0870171 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0185  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 
691 aa  206  1e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.483444  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0912  ATPase domain-containing protein  45.9 
 
 
513 aa  205  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5476  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.4 
 
 
782 aa  205  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0268  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.23 
 
 
764 aa  205  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0862951 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0873  histidine kinase  45.9 
 
 
513 aa  205  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1944  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.85 
 
 
607 aa  205  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.133284  normal  0.0645132 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2221  Signal transduction histidine kinase  37.79 
 
 
605 aa  203  8e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.763849  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.83 
 
 
1363 aa  203  8e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.96 
 
 
518 aa  203  9e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0477  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.46 
 
 
786 aa  203  9e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0700  PAS sensor protein  32.47 
 
 
648 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390085  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0673  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 
643 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0543  PAS sensor protein  42.46 
 
 
786 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0831512  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.16 
 
 
509 aa  201  3.9999999999999996e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.84 
 
 
919 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0711  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 
646 aa  201  5e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.386988 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.2 
 
 
1352 aa  200  6e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2033  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.74 
 
 
797 aa  200  6e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3167  signal transduction histidine kinase-like protein  35.62 
 
 
1077 aa  199  9e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0540842 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  41.13 
 
 
1046 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3923  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 
1055 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.03 
 
 
795 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.228463 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2063  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 
610 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0413  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 
1276 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0153135  hitchhiker  0.00020462 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.11 
 
 
630 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.591777 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.54 
 
 
594 aa  198  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1778  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
606 aa  197  7e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.415214  decreased coverage  0.0072817 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.32 
 
 
1369 aa  196  7e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0680  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.8 
 
 
728 aa  196  9e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.391065 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2623  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.8 
 
 
614 aa  196  9e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0381  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.32 
 
 
1296 aa  196  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00957634 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0419  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.22 
 
 
1260 aa  196  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.784662  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 
763 aa  195  2e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3474  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.41 
 
 
836 aa  195  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>