More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1847 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  54.12 
 
 		 770 aa  778    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1200  Signal transduction histidine kinase  74.27 
 
 		 779 aa  1113    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2033  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.84 
 
 		 797 aa  654    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3436  histidine kinase  79.14 
 
 		 771 aa  1236    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.416045  normal  0.0284383 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 775 aa  1573    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0491237  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  78.08 
 
 		 769 aa  1219    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0268  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.28 
 
 		 764 aa  676    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0862951 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5476  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.28 
 
 		 782 aa  689    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2018  ATP-binding region, ATPase-like  79.4 
 
 		 771 aa  1251    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88254  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1449  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  76.16 
 
 		 775 aa  1188    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00109411  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.61 
 
 		 795 aa  645    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.228463 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3094  two-component sensor histidine kinase  77.71 
 
 		 774 aa  1240    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0477  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.98 
 
 		 786 aa  634  1e-180  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0543  PAS sensor protein  45.85 
 
 		 786 aa  634  1e-180  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0831512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0514  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.98 
 
 		 786 aa  626  1e-178  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.292682 
 
 
-
 
NC_004310  BR0616  sensory box histidine kinase  45.53 
 
 		 783 aa  619  1e-176  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0615  sensory box histidine kinase  45.53 
 
 		 783 aa  619  1e-176  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.48 
 
 		 784 aa  619  1e-176  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501852  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0905  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.82 
 
 		 774 aa  599  1e-170  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0641  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.24 
 
 		 772 aa  588  1e-166  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2369  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.25 
 
 		 793 aa  585  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315374 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0929  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.03 
 
 		 769 aa  571  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0582666 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.29 
 
 		 769 aa  570  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1373  two component sensor kinase  50.63 
 
 		 790 aa  561  1e-158  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0438  putative non-motile and phage-resistance protein  38.69 
 
 		 773 aa  529  1e-149  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0956  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.41 
 
 		 600 aa  502  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.86 
 
 		 911 aa  458  1e-127  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3431  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.97 
 
 		 844 aa  382  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.737925 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0648  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 		 661 aa  249  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1935  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.49 
 
 		 523 aa  238  4e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1772  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.73 
 
 		 1169 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.914739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2154  hypothetical protein  30.43 
 
 		 786 aa  226  9e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0411448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  44.33 
 
 		 778 aa  226  9e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0066  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  35.99 
 
 		 773 aa  219  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.712477  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.49 
 
 		 798 aa  218  2.9999999999999998e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0658643 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1119  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.94 
 
 		 502 aa  217  5e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.092302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.06 
 
 		 617 aa  217  5.9999999999999996e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3284  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 		 856 aa  217  8e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0250894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1305  two component sensor kinase  40.38 
 
 		 599 aa  216  9e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.282696  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3045  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.69 
 
 		 587 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.38 
 
 		 513 aa  213  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.46 
 
 		 1313 aa  211  5e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1010  histidine kinase  45.38 
 
 		 503 aa  210  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1238  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.87 
 
 		 579 aa  207  7e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0280549 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1357  cytoplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.98 
 
 		 849 aa  206  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0025  histidine kinase  34.98 
 
 		 849 aa  206  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  45.42 
 
 		 508 aa  205  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.27 
 
 		 687 aa  204  5e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4820  histidine kinase  43.77 
 
 		 513 aa  204  5e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.780698  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0899  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.34 
 
 		 562 aa  204  5e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000736499  normal  0.0870171 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1884  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.22 
 
 		 389 aa  203  8e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.22 
 
 		 846 aa  202  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0617  histidine kinase  45.89 
 
 		 525 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0327  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  43.87 
 
 		 620 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2574  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.06 
 
 		 512 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0848  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.21 
 
 		 513 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88824  normal  0.551331 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1553  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.61 
 
 		 505 aa  201  3.9999999999999996e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1749  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.81 
 
 		 511 aa  201  5e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0215  sensor histidine kinase  42.04 
 
 		 470 aa  201  5e-50  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00343195  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.67 
 
 		 717 aa  201  6e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.24 
 
 		 763 aa  200  6e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1778  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.08 
 
 		 606 aa  200  7.999999999999999e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.415214  decreased coverage  0.0072817 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0912  ATPase domain-containing protein  43.57 
 
 		 513 aa  200  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0873  histidine kinase  43.57 
 
 		 513 aa  200  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0015  histidine kinase  32.6 
 
 		 868 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.461208 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3764  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.99 
 
 		 917 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.432635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0712  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.33 
 
 		 605 aa  198  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0997338  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.22 
 
 		 1138 aa  198  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.619733  normal  0.530694 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  43.75 
 
 		 1046 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1212  Signal transduction histidine kinase  41.85 
 
 		 536 aa  197  6e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.39876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2788  histidine kinase  42.6 
 
 		 576 aa  197  6e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.97 
 
 		 468 aa  197  7e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229393  normal  0.25439 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.26 
 
 		 646 aa  197  8.000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 530 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109713  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2185  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 531 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0700  PAS sensor protein  42.11 
 
 		 648 aa  196  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0711  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 		 646 aa  196  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.386988 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.55 
 
 		 1363 aa  195  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3460  putative sensor histidine kinase, putative membrane protein  43.93 
 
 		 532 aa  195  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.305573 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.01 
 
 		 1352 aa  194  5e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2064  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.74 
 
 		 533 aa  194  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0167055  normal  0.0634721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2063  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.96 
 
 		 610 aa  194  6e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1670  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.64 
 
 		 494 aa  194  6e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422523 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0885  sensor histidine kinase  41.49 
 
 		 470 aa  194  6e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 530 aa  194  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.227598  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1469  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.74 
 
 		 536 aa  194  7e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.997673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 		 1274 aa  192  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0413  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.87 
 
 		 1276 aa  192  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0153135  hitchhiker  0.00020462 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3515  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.75 
 
 		 627 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.1939  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0400  PAS sensor signal transduction histidine kinase  43.59 
 
 		 436 aa  192  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.257658  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1639  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.54 
 
 		 583 aa  192  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19247  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1100  PAS  38.44 
 
 		 576 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2221  Signal transduction histidine kinase  43.16 
 
 		 605 aa  192  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.763849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0673  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.65 
 
 		 643 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 		 371 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  34.48 
 
 		 823 aa  191  2.9999999999999997e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0381  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.87 
 
 		 1296 aa  192  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00957634 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.84 
 
 		 377 aa  191  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.360727  normal  0.404582 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2944  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  46.32 
 
 		 573 aa  191  5e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0827  two component sensor kinase  41.8 
 
 		 1410 aa  191  5.999999999999999e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>