More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1449 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  74.15 
 
 
769 aa  1158    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3094  two-component sensor histidine kinase  75 
 
 
774 aa  1177    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5476  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.5 
 
 
782 aa  650    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1200  Signal transduction histidine kinase  86.4 
 
 
779 aa  1291    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3436  histidine kinase  76.67 
 
 
771 aa  1177    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.416045  normal  0.0284383 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0268  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.23 
 
 
764 aa  637    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0862951 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  75.88 
 
 
775 aa  1163    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0491237  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2018  ATP-binding region, ATPase-like  75.52 
 
 
771 aa  1168    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88254  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1449  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
775 aa  1573    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00109411  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  53.95 
 
 
770 aa  776    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255804  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2033  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.45 
 
 
797 aa  628  1e-178  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.51 
 
 
795 aa  622  1e-177  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.228463 
 
 
-
 
NC_004310  BR0616  sensory box histidine kinase  44.07 
 
 
783 aa  607  9.999999999999999e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0615  sensory box histidine kinase  44.07 
 
 
783 aa  607  9.999999999999999e-173  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.38 
 
 
784 aa  600  1e-170  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501852  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0514  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.61 
 
 
786 aa  600  1e-170  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.292682 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0477  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.76 
 
 
786 aa  598  1e-169  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0543  PAS sensor protein  44.06 
 
 
786 aa  597  1e-169  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0831512  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0905  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.82 
 
 
774 aa  585  1.0000000000000001e-165  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0929  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.88 
 
 
769 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0582666 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0641  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.63 
 
 
772 aa  574  1.0000000000000001e-162  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.5 
 
 
769 aa  570  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459877  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1373  two component sensor kinase  50.53 
 
 
790 aa  563  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2369  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.8 
 
 
793 aa  550  1e-155  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315374 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0438  putative non-motile and phage-resistance protein  39.69 
 
 
773 aa  543  1e-153  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0956  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.96 
 
 
600 aa  502  1e-141  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.33 
 
 
911 aa  429  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3431  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 
844 aa  388  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.737925 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1935  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.12 
 
 
523 aa  232  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0648  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 
661 aa  231  3e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173169  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.86 
 
 
798 aa  229  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0658643 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0066  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 
773 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.712477  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  43.48 
 
 
778 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1772  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.58 
 
 
1169 aa  222  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.914739  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1119  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.72 
 
 
502 aa  222  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.092302  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.4 
 
 
617 aa  220  8.999999999999998e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422617  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.1 
 
 
1274 aa  216  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1305  two component sensor kinase  44.98 
 
 
599 aa  214  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.282696  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3284  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 
856 aa  214  4.9999999999999996e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0250894  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2154  hypothetical protein  31.85 
 
 
786 aa  213  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0411448  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1010  histidine kinase  43.07 
 
 
503 aa  210  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  48.48 
 
 
508 aa  209  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0848  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.06 
 
 
513 aa  209  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88824  normal  0.551331 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1749  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.03 
 
 
511 aa  210  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1357  cytoplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.35 
 
 
849 aa  209  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0873  histidine kinase  44.6 
 
 
513 aa  208  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0025  histidine kinase  34.35 
 
 
849 aa  208  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0912  ATPase domain-containing protein  44.6 
 
 
513 aa  208  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.89 
 
 
1313 aa  207  4e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3045  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.87 
 
 
587 aa  207  7e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.34 
 
 
513 aa  207  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683034  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.9 
 
 
1313 aa  206  9e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0327  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  43.02 
 
 
620 aa  207  9e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.66 
 
 
1352 aa  204  5e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2574  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.11 
 
 
512 aa  203  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1884  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.53 
 
 
389 aa  203  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329348  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4820  histidine kinase  44.71 
 
 
513 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.780698  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0899  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.55 
 
 
562 aa  201  6e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000736499  normal  0.0870171 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0617  histidine kinase  44.93 
 
 
525 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862925  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.49 
 
 
1363 aa  198  3e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0015  histidine kinase  32.9 
 
 
868 aa  198  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.461208 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  42.92 
 
 
1046 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.51 
 
 
646 aa  198  4.0000000000000005e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.91 
 
 
717 aa  197  5.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0215  sensor histidine kinase  40.87 
 
 
470 aa  197  5.000000000000001e-49  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00343195  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1553  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.92 
 
 
505 aa  197  8.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0931  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.75 
 
 
446 aa  196  1e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.523505  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3460  putative sensor histidine kinase, putative membrane protein  42.97 
 
 
532 aa  196  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.305573 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2805  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.88 
 
 
927 aa  195  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.58 
 
 
484 aa  194  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197112  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1358  histidine kinase  42.91 
 
 
288 aa  194  5e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.688927  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0827  two component sensor kinase  41.95 
 
 
1410 aa  194  6e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.11 
 
 
371 aa  194  6e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1639  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.12 
 
 
583 aa  194  6e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19247  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2185  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.21 
 
 
531 aa  194  7e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 
568 aa  194  7e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2064  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.35 
 
 
533 aa  193  9e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0167055  normal  0.0634721 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1238  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.64 
 
 
579 aa  193  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0280549 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.97 
 
 
530 aa  193  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109713  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.32 
 
 
1138 aa  192  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.619733  normal  0.530694 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 
846 aa  192  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1212  Signal transduction histidine kinase  43.35 
 
 
536 aa  192  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.39876  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0413  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
1276 aa  192  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0153135  hitchhiker  0.00020462 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  33.64 
 
 
823 aa  192  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1469  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.97 
 
 
536 aa  191  4e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.997673  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3764  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.34 
 
 
917 aa  191  5.999999999999999e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.432635  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2788  histidine kinase  40.51 
 
 
576 aa  191  5.999999999999999e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0381  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
1296 aa  191  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00957634 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.96 
 
 
1433 aa  191  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0885  sensor histidine kinase  39.68 
 
 
470 aa  190  7e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.76 
 
 
468 aa  190  7e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229393  normal  0.25439 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.59 
 
 
530 aa  190  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.227598  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2683  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.38 
 
 
614 aa  190  8e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.13 
 
 
940 aa  189  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0118  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.13 
 
 
1927 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125924 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  29.83 
 
 
1560 aa  187  5e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1473  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.93 
 
 
1380 aa  186  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.93 
 
 
377 aa  186  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.360727  normal  0.404582 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.6 
 
 
763 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0877  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.13 
 
 
548 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.991624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>