More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0956 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0956  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
600 aa  1214    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.53 
 
 
770 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255804  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3094  two-component sensor histidine kinase  48.76 
 
 
774 aa  514  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.34 
 
 
769 aa  505  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.41 
 
 
775 aa  502  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0491237  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1449  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  47.96 
 
 
775 aa  501  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00109411  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0905  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.42 
 
 
774 aa  496  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0616  sensory box histidine kinase  46.68 
 
 
783 aa  493  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3436  histidine kinase  47.17 
 
 
771 aa  495  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.416045  normal  0.0284383 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0615  sensory box histidine kinase  46.68 
 
 
783 aa  493  9.999999999999999e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.45 
 
 
784 aa  490  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501852  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5476  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.84 
 
 
782 aa  486  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1200  Signal transduction histidine kinase  46.48 
 
 
779 aa  488  1e-136  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0268  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.32 
 
 
764 aa  488  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0862951 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2018  ATP-binding region, ATPase-like  47.02 
 
 
771 aa  488  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88254  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2033  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.59 
 
 
797 aa  474  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0543  PAS sensor protein  45.66 
 
 
786 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0831512  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.41 
 
 
911 aa  466  9.999999999999999e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0477  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.29 
 
 
786 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0514  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.32 
 
 
786 aa  464  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.292682 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3431  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.18 
 
 
844 aa  465  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.737925 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1373  two component sensor kinase  44.33 
 
 
790 aa  463  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.76 
 
 
769 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459877  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0641  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.92 
 
 
772 aa  464  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.58 
 
 
795 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.228463 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0929  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.63 
 
 
769 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0582666 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0438  putative non-motile and phage-resistance protein  42.08 
 
 
773 aa  457  1e-127  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2369  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.45 
 
 
793 aa  430  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315374 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0066  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  40 
 
 
773 aa  265  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.712477  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  39.48 
 
 
778 aa  249  8e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.26 
 
 
1274 aa  249  1e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0648  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 
661 aa  246  6e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173169  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.85 
 
 
617 aa  238  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422617  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.81 
 
 
798 aa  237  4e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0658643 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.47 
 
 
1501 aa  231  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1772  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.89 
 
 
1169 aa  226  9e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.914739  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.78 
 
 
468 aa  224  3e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229393  normal  0.25439 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3284  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 
856 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0250894  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.28 
 
 
717 aa  221  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1935  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.91 
 
 
523 aa  222  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1639  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 
583 aa  221  3.9999999999999997e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19247  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2154  hypothetical protein  32.11 
 
 
786 aa  219  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0411448  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0899  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  48.75 
 
 
562 aa  219  1e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000736499  normal  0.0870171 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3460  putative sensor histidine kinase, putative membrane protein  48.41 
 
 
532 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.305573 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2185  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.17 
 
 
531 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  48.62 
 
 
687 aa  218  4e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  48.81 
 
 
530 aa  217  4e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109713  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1119  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.66 
 
 
502 aa  217  4e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.092302  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0215  sensor histidine kinase  47.72 
 
 
470 aa  216  9.999999999999999e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00343195  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  48.41 
 
 
530 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.227598  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4820  histidine kinase  49.58 
 
 
513 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.780698  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.64 
 
 
1369 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2079  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.66 
 
 
511 aa  214  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.964001  normal  0.759382 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  52.38 
 
 
508 aa  213  5.999999999999999e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2574  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.51 
 
 
512 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2316  histidine kinase  47.66 
 
 
511 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243806  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1749  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.42 
 
 
511 aa  213  7.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  46.47 
 
 
1046 aa  209  8e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.63 
 
 
989 aa  209  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.04 
 
 
1313 aa  208  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.22 
 
 
763 aa  207  4e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2064  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.83 
 
 
533 aa  207  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0167055  normal  0.0634721 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.01 
 
 
518 aa  207  5e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1553  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  48.09 
 
 
505 aa  207  6e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1212  Signal transduction histidine kinase  47.22 
 
 
536 aa  206  8e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.39876  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0848  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.09 
 
 
513 aa  206  8e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88824  normal  0.551331 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0885  sensor histidine kinase  46.06 
 
 
470 aa  206  9e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.53 
 
 
511 aa  206  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1305  two component sensor kinase  42.75 
 
 
599 aa  206  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.282696  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0327  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  47.17 
 
 
620 aa  205  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1469  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.43 
 
 
536 aa  205  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.997673  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1884  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.23 
 
 
389 aa  205  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329348  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0877  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.89 
 
 
548 aa  204  4e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.991624  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0912  ATPase domain-containing protein  48.09 
 
 
513 aa  204  5e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0873  histidine kinase  48.09 
 
 
513 aa  204  5e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.33 
 
 
989 aa  203  8e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0617  histidine kinase  43.86 
 
 
525 aa  203  9e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862925  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  29.91 
 
 
1560 aa  202  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 
456 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.04 
 
 
1138 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.619733  normal  0.530694 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1238  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.55 
 
 
579 aa  202  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0280549 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0711  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 
646 aa  201  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.386988 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0700  PAS sensor protein  33.76 
 
 
648 aa  201  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390085  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0673  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 
643 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.03 
 
 
377 aa  201  3.9999999999999996e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.360727  normal  0.404582 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 
568 aa  200  5e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2051  two component sensor kinase  47.23 
 
 
511 aa  200  5e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.42 
 
 
1352 aa  200  7e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1418  GAF sensor hybrid histidine kinase  45.8 
 
 
853 aa  200  7e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237881  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.68 
 
 
1820 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2944  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  44.77 
 
 
573 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3045  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.12 
 
 
587 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1358  histidine kinase  47.93 
 
 
288 aa  198  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.688927  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.93 
 
 
484 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197112  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.22 
 
 
594 aa  198  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.9 
 
 
509 aa  197  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1606  sensory box histidine kinase  31.38 
 
 
1035 aa  197  5.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23328  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0827  two component sensor kinase  35.97 
 
 
1410 aa  196  7e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.01 
 
 
738 aa  197  7e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0413  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.99 
 
 
1276 aa  196  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0153135  hitchhiker  0.00020462 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>