More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0673 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0673  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 643 aa  1263    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0700  PAS sensor protein  92.71 
 
 		 648 aa  1160    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  65.31 
 
 		 630 aa  716    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.591777 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0711  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  93.02 
 
 		 646 aa  1164    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.386988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0712  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  58.37 
 
 		 605 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0997338  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1778  multi-sensor signal transduction histidine kinase  59.83 
 
 		 606 aa  586  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.415214  decreased coverage  0.0072817 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3515  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.92 
 
 		 627 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.1939  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2063  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.78 
 
 		 610 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1944  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.39 
 
 		 607 aa  395  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.133284  normal  0.0645132 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2221  Signal transduction histidine kinase  43.45 
 
 		 605 aa  389  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.763849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3045  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.59 
 
 		 587 aa  385  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2623  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.42 
 
 		 614 aa  379  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1779  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.76 
 
 		 612 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.546306  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1639  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.68 
 
 		 583 aa  302  1e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19247  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1670  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.41 
 
 		 494 aa  289  1e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422523 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0617  histidine kinase  45.83 
 
 		 525 aa  261  4e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.49 
 
 		 513 aa  257  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1010  histidine kinase  38.66 
 
 		 503 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2683  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 		 614 aa  246  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.04 
 
 		 484 aa  242  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197112  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0577  sensor histidine kinase  36.08 
 
 		 609 aa  240  8e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0577  sensor histidine kinase  35.88 
 
 		 609 aa  236  7e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.704828  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1305  two component sensor kinase  38.96 
 
 		 599 aa  230  5e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.282696  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0648  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.25 
 
 		 661 aa  230  7e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0877  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.54 
 
 		 548 aa  227  6e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.991624  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1238  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 		 579 aa  224  4e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0280549 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0905  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.36 
 
 		 774 aa  208  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.03 
 
 		 784 aa  207  4e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501852  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.14 
 
 		 717 aa  205  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1553  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.58 
 
 		 505 aa  204  5e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 		 617 aa  203  8e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422617  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0616  sensory box histidine kinase  43.6 
 
 		 783 aa  201  3e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.35 
 
 		 646 aa  201  3e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0615  sensory box histidine kinase  43.6 
 
 		 783 aa  201  3e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0956  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 600 aa  201  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.02 
 
 		 911 aa  201  3.9999999999999996e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  44.22 
 
 		 778 aa  201  5e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0899  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.21 
 
 		 562 aa  200  6e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000736499  normal  0.0870171 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2018  ATP-binding region, ATPase-like  42.13 
 
 		 771 aa  200  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88254  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.56 
 
 		 770 aa  197  7e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.82 
 
 		 1352 aa  196  8.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3436  histidine kinase  41.34 
 
 		 771 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.416045  normal  0.0284383 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.21 
 
 		 973 aa  194  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3094  two-component sensor histidine kinase  39.56 
 
 		 774 aa  194  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0641  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.35 
 
 		 772 aa  194  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1373  two component sensor kinase  43.04 
 
 		 790 aa  194  5e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3431  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.3 
 
 		 844 aa  192  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.737925 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.02 
 
 		 969 aa  193  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.3 
 
 		 775 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0491237  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.23 
 
 		 767 aa  192  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5476  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.87 
 
 		 782 aa  192  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.73 
 
 		 769 aa  190  5e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 456 aa  190  5.999999999999999e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0929  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 769 aa  189  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0582666 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.74 
 
 		 798 aa  189  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0658643 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 1046 aa  189  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.84 
 
 		 769 aa  189  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0438  putative non-motile and phage-resistance protein  38.31 
 
 		 773 aa  187  4e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0848  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.59 
 
 		 513 aa  187  5e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88824  normal  0.551331 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0268  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.02 
 
 		 764 aa  187  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0862951 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4820  histidine kinase  40.3 
 
 		 513 aa  187  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.780698  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0873  histidine kinase  43.75 
 
 		 513 aa  187  6e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0912  ATPase domain-containing protein  43.75 
 
 		 513 aa  187  6e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1935  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.3 
 
 		 523 aa  186  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1358  histidine kinase  43.15 
 
 		 288 aa  186  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.688927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0327  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  43.93 
 
 		 620 aa  185  3e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1449  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.15 
 
 		 775 aa  184  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00109411  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1749  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.03 
 
 		 511 aa  185  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.28 
 
 		 568 aa  184  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2944  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 		 573 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.76 
 
 		 468 aa  184  4.0000000000000006e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229393  normal  0.25439 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2574  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.25 
 
 		 512 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2202  histidine kinase  39.13 
 
 		 613 aa  183  8.000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.143763  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5419  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.76 
 
 		 713 aa  182  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0955  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.39 
 
 		 765 aa  183  1e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2316  histidine kinase  41.25 
 
 		 511 aa  182  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.17 
 
 		 377 aa  182  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.360727  normal  0.404582 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2051  two component sensor kinase  42.08 
 
 		 511 aa  182  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2079  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.25 
 
 		 511 aa  182  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.964001  normal  0.759382 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.04 
 
 		 518 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3009  histidine kinase  36.4 
 
 		 603 aa  181  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2393  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.94 
 
 		 676 aa  181  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00822967 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0215  sensor histidine kinase  36.76 
 
 		 470 aa  181  4.999999999999999e-44  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00343195  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2119  multisensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 		 582 aa  181  4.999999999999999e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.17 
 
 		 1363 aa  180  7e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.52 
 
 		 1199 aa  180  9e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1100  PAS  36.69 
 
 		 576 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0381  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.25 
 
 		 1296 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00957634 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0171  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.85 
 
 		 1192 aa  179  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0413  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.87 
 
 		 1276 aa  179  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0153135  hitchhiker  0.00020462 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 		 1138 aa  179  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.619733  normal  0.530694 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1473  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.9 
 
 		 1380 aa  178  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  40.16 
 
 		 970 aa  178  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2675  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 708 aa  177  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877  normal  0.897929 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.54 
 
 		 1350 aa  177  8e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0827  two component sensor kinase  31.98 
 
 		 1410 aa  176  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1200  Signal transduction histidine kinase  38.17 
 
 		 779 aa  176  9.999999999999999e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.74 
 
 		 795 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.228463 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 		 594 aa  175  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.24 
 
 		 1064 aa  175  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>