More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5379 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5379  histidine kinase  100 
 
 		 698 aa  1410    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5380  histidine kinase  66.67 
 
 		 689 aa  872    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.392025 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4322  histidine kinase  57.41 
 
 		 636 aa  298  3e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.461598  normal  0.0714354 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.23 
 
 		 686 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000161382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1562  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 680 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.327156  normal  0.581936 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4607  histidine kinase  29.03 
 
 		 696 aa  162  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.998833  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1372  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 		 510 aa  140  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.94557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1477  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 		 511 aa  137  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.635572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2666  histidine kinase  34.24 
 
 		 586 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0592074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2337  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 564 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139979  normal  0.523633 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1024  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.9 
 
 		 682 aa  130  7.000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000464711  normal  0.0237782 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0933  sensor histidine kinase  37.93 
 
 		 442 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141795  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1145  sensor histidine kinase  37.55 
 
 		 442 aa  122  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2258  sensor kinase protein  37.55 
 
 		 442 aa  122  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1333  histidine kinase  37.39 
 
 		 461 aa  122  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249082  normal  0.153676 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0095  sensor histidine kinase  37.55 
 
 		 442 aa  122  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18865  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1018  sensor histidine kinase  37.55 
 
 		 442 aa  122  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1518  sensor histidine kinase  37.55 
 
 		 442 aa  122  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.250734  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1351  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 		 461 aa  121  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1740  sensor histidine kinase  37.84 
 
 		 442 aa  120  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187783  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0378  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.6 
 
 		 686 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 		 463 aa  119  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3783  Cache sensor signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 		 708 aa  118  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2942  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.51 
 
 		 535 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4493  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 		 458 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0870  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.34 
 
 		 469 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.51 
 
 		 535 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0433443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2537  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.84 
 
 		 602 aa  115  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3063  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  37.5 
 
 		 433 aa  115  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9979  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4983  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 		 535 aa  114  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0185741 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1893  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 		 644 aa  113  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2527  histidine kinase  34.85 
 
 		 535 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0731082 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34990  integral membrane hybrid histidine protein kinase  25.34 
 
 		 914 aa  112  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.77 
 
 		 466 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1235  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 		 456 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.403806  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  30.6 
 
 		 998 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1256  histidine kinase  35.89 
 
 		 652 aa  111  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3103  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 522 aa  111  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 		 456 aa  111  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5322  histidine kinase sensor  33.73 
 
 		 529 aa  110  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.968492 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2551  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 		 401 aa  109  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.203481  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.75 
 
 		 680 aa  109  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1899  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 		 694 aa  109  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149051  hitchhiker  0.00556122 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3076  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 		 616 aa  108  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.315862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.58 
 
 		 921 aa  108  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2958  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.92 
 
 		 914 aa  108  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0730745  normal  0.010886 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1904  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.82 
 
 		 932 aa  108  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.636099  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0892  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 902 aa  108  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0037  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 		 387 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11300  signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 		 556 aa  107  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0674  histidine kinase  31 
 
 		 332 aa  106  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5743  histidine kinase  29.61 
 
 		 357 aa  106  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.022107  hitchhiker  0.000697261 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  28.98 
 
 		 970 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 452 aa  105  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1722  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 763 aa  105  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.418059 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0806  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 587 aa  104  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3784  histidine kinase  33.2 
 
 		 496 aa  104  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540279  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 530 aa  104  6e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104669  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2761  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 		 679 aa  103  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.47205 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2045  histidine kinase  29.23 
 
 		 906 aa  103  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189516  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02680  histidine kinase  33.86 
 
 		 416 aa  103  9e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4186  histidine kinase  35.27 
 
 		 526 aa  103  9e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.277122  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2987  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 		 410 aa  103  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.472941  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0943  histidine kinase  34.57 
 
 		 530 aa  103  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.215183  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  26.44 
 
 		 463 aa  102  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.96 
 
 		 1029 aa  102  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 		 587 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.773486  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3944  two-component sensor/regulator  30.94 
 
 		 891 aa  102  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0305517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 581 aa  102  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1640  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 		 672 aa  102  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.934605  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.1 
 
 		 858 aa  101  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1867  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 763 aa  102  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31140  sensory histidine protein kinase  29.96 
 
 		 412 aa  101  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0370261  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  26.72 
 
 		 461 aa  101  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1550  ATP-binding region, ATPase-like protein  32.57 
 
 		 531 aa  101  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221639  normal  0.141787 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1942  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.65 
 
 		 1038 aa  101  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 537 aa  101  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.806824 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2189  histidine kinase  31.67 
 
 		 482 aa  101  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0711  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 		 581 aa  101  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0736  histidine kinase  34.39 
 
 		 431 aa  101  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  26.05 
 
 		 463 aa  100  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  23.22 
 
 		 473 aa  100  6e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0717  sensor protein KdpD  33.03 
 
 		 894 aa  100  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.649763  normal  0.772603 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00652  fused sensory histidine kinase in two-component regulatory system with KdpE: signal sensing protein  33.03 
 
 		 895 aa  100  7e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2941  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 894 aa  100  7e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0788  sensor protein KdpD  33.03 
 
 		 894 aa  100  7e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0742  sensor protein KdpD  33.03 
 
 		 894 aa  100  7e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.204063  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0554  sensor protein KdpD  33.03 
 
 		 894 aa  100  7e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  26.34 
 
 		 463 aa  100  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00643  hypothetical protein  33.03 
 
 		 894 aa  100  7e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1500  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 590 aa  100  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  26.34 
 
 		 463 aa  100  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0500  histidine kinase  30.29 
 
 		 922 aa  100  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0721  sensor protein KdpD  33.03 
 
 		 894 aa  100  7e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.594911  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.5 
 
 		 1058 aa  100  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1054  sensor histidine kinase SrrB  26.97 
 
 		 589 aa  100  9e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0265  sensor histidine kinase  29.06 
 
 		 697 aa  100  9e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1495  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.45 
 
 		 579 aa  100  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  23.31 
 
 		 310 aa  100  9e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  32.75 
 
 		 508 aa  100  9e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>