More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5322 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5322  histidine kinase sensor  100 
 
 		 529 aa  1065    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.968492 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2942  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.51 
 
 		 535 aa  574  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.51 
 
 		 535 aa  574  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0433443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4983  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  56.09 
 
 		 535 aa  550  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0185741 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2527  histidine kinase  55.71 
 
 		 535 aa  545  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0731082 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1550  ATP-binding region, ATPase-like protein  40.94 
 
 		 531 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221639  normal  0.141787 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4714  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.99 
 
 		 528 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1477  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.92 
 
 		 511 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.635572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1372  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.02 
 
 		 510 aa  171  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.94557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3784  histidine kinase  39.45 
 
 		 496 aa  163  8.000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540279  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 		 463 aa  159  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2337  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.74 
 
 		 564 aa  156  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139979  normal  0.523633 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2666  histidine kinase  37.94 
 
 		 586 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0592074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0583  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.87 
 
 		 816 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.412959  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4607  histidine kinase  38.97 
 
 		 696 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.998833  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2761  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 		 679 aa  142  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.47205 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4564  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 		 376 aa  136  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.531352 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2928  histidine kinase  35.6 
 
 		 455 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 686 aa  131  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000161382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8216  histidine kinase  37.66 
 
 		 392 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3554  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 		 541 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.32039  normal  0.384329 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 		 546 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116014 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 1138 aa  127  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.84915  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 		 1741 aa  127  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.294056 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2374  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 		 709 aa  125  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2682  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.42 
 
 		 827 aa  125  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.616307  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0288  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 		 884 aa  125  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1131  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 		 373 aa  125  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4741  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 		 474 aa  125  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.130107  normal  0.303178 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 1516 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5317  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 		 421 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0037  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 387 aa  124  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 815 aa  124  6e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1893  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 		 644 aa  124  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3003  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.07 
 
 		 498 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4249  ATP-binding region ATPase domain protein  32.05 
 
 		 374 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1114  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 373 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5380  histidine kinase  31.96 
 
 		 689 aa  122  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.392025 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2114  ATP-binding region ATPase domain protein  30.08 
 
 		 400 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.673781 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 		 418 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31890  signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 		 394 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 		 524 aa  121  3.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.72 
 
 		 562 aa  120  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 		 556 aa  119  9e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.236595  normal  0.180185 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 458 aa  120  9e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3271  sensor histidine kinase  26.85 
 
 		 458 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0499416  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  26.52 
 
 		 458 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3806  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 533 aa  119  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.576691  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4100  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 		 477 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  26.54 
 
 		 458 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1725  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 		 499 aa  119  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0823  ATP-binding region ATPase domain protein  30.46 
 
 		 488 aa  119  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.121658  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  27.36 
 
 		 463 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3278  sensor histidine kinase  26.54 
 
 		 458 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  26.54 
 
 		 458 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3248  sensor histidine kinase  26.93 
 
 		 458 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2948  sensor histidine kinase  26.54 
 
 		 458 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2970  histidine kinase  32.88 
 
 		 387 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0613  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 		 472 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0773099  normal  0.773415 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  26.54 
 
 		 458 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6146  histidine kinase  36.93 
 
 		 465 aa  119  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.854948 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0201  histidine kinase  33.7 
 
 		 347 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.370904  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  28.7 
 
 		 463 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0656  histidine kinase  37.85 
 
 		 423 aa  118  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.368822  hitchhiker  0.000112201 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3015  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 		 500 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2815  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 		 412 aa  118  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3600  histidine kinase  37.45 
 
 		 548 aa  118  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.94225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0779  sensor histidine kinase  27.47 
 
 		 463 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3783  Cache sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 		 708 aa  117  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4322  histidine kinase  35.5 
 
 		 636 aa  117  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.461598  normal  0.0714354 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  27.83 
 
 		 462 aa  117  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2878  PAS sensor protein  32.37 
 
 		 372 aa  117  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 585 aa  117  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03740  PhoR-like protein  34.98 
 
 		 409 aa  117  5e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.172965  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 592 aa  117  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0502  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.99 
 
 		 462 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1117  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.1 
 
 		 770 aa  116  8.999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0498  histidine kinase  33.33 
 
 		 391 aa  116  8.999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.96 
 
 		 473 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2909  sensor histidine kinase  36.96 
 
 		 377 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1417  ATPase domain-containing protein  32.35 
 
 		 470 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.110308 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  33.88 
 
 		 537 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2976  histidine kinase  27.16 
 
 		 458 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23989  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 		 1178 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  26.63 
 
 		 463 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3913  PAS sensor protein  30.56 
 
 		 1337 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.290527  normal  0.28306 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0869  histidine kinase  31.3 
 
 		 413 aa  115  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0275  histidine kinase  33.58 
 
 		 456 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.937393  normal  0.949667 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3018  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1839  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 		 423 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00841086  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  28.18 
 
 		 456 aa  115  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4476  histidine kinase  33.58 
 
 		 461 aa  115  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0860551  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  26.54 
 
 		 458 aa  115  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 		 581 aa  114  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1212  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 		 457 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 		 584 aa  115  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 509 aa  115  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 		 584 aa  114  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 600 aa  114  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1041  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.68 
 
 		 1406 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.845277 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>