More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2928 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2928  histidine kinase  100 
 
 
455 aa  923    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0583  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.24 
 
 
816 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.412959  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0288  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.83 
 
 
884 aa  230  4e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  49.39 
 
 
1741 aa  229  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.294056 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.62 
 
 
1138 aa  223  4e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.84915  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1114  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  49.38 
 
 
373 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.68 
 
 
1516 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0037  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.87 
 
 
387 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1522  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
389 aa  186  8e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1495  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
389 aa  186  9e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4564  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.69 
 
 
376 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.531352 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1725  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.98 
 
 
499 aa  183  4.0000000000000006e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3806  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.35 
 
 
533 aa  183  5.0000000000000004e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.576691  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3854  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  40.91 
 
 
386 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3003  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.4 
 
 
498 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2266  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 
372 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00620911 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3554  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.25 
 
 
541 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.32039  normal  0.384329 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5317  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 
421 aa  170  5e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0066  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.24 
 
 
377 aa  168  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359193  normal  0.0132857 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3015  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.02 
 
 
500 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4229  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.33 
 
 
383 aa  166  8e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.599633  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2761  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.66 
 
 
679 aa  160  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.47205 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0618  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.15 
 
 
1484 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1893  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.72 
 
 
644 aa  155  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1131  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 
373 aa  152  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3394  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 
728 aa  147  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.99137  normal  0.249099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 
1178 aa  146  9e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5322  histidine kinase sensor  35.6 
 
 
529 aa  144  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.968492 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5621  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 
1258 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879931  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 
405 aa  140  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  34.81 
 
 
1344 aa  138  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5555  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.75 
 
 
416 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.786855  normal  0.0266117 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1039  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 
1259 aa  137  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 
1043 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0030  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.53 
 
 
460 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.292632  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3600  histidine kinase  36.19 
 
 
548 aa  134  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.94225  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2666  histidine kinase  30.82 
 
 
586 aa  133  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0592074  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.02 
 
 
1350 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2797  histidine kinase  35.04 
 
 
583 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0139  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 
1066 aa  131  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2942  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
535 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
535 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0433443  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 
1153 aa  130  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359014  hitchhiker  0.0000017622 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1451  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 
877 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2337  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 
564 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139979  normal  0.523633 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0595  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 
752 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 
1029 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135444  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2527  histidine kinase  32.5 
 
 
535 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0731082 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4983  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 
535 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0185741 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5380  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 
625 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00714338  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2412  histidine kinase  36.28 
 
 
603 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0921  histidine kinase  36.47 
 
 
1105 aa  127  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.615746 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2792  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 
930 aa  127  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.111634 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0958  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.18 
 
 
734 aa  126  7e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.73 
 
 
1352 aa  126  9e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0478  histidine kinase  32.48 
 
 
560 aa  126  9e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.676006  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5188  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.49 
 
 
482 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000262234 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1041  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 
1406 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.845277 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2944  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  34.46 
 
 
573 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.19 
 
 
608 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.765653  hitchhiker  0.000174254 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 
1383 aa  124  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1421  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 
404 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1771  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.13 
 
 
613 aa  124  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000228361 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4784  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.19 
 
 
1141 aa  124  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1550  ATP-binding region, ATPase-like protein  32.32 
 
 
531 aa  124  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221639  normal  0.141787 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0654  multi-sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 
934 aa  123  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.78924 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.2 
 
 
975 aa  123  8e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.817585  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3270  histidine kinase  31.76 
 
 
565 aa  123  8e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1302  sensor histidine kinase/response regulator  36.22 
 
 
835 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.924984  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  32.95 
 
 
2051 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.62 
 
 
977 aa  122  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  31.58 
 
 
970 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0636  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 
535 aa  122  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.318643  normal  0.125988 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0099  signal transduction histidine kinase-like protein  33.59 
 
 
938 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.878773 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3784  histidine kinase  32.19 
 
 
496 aa  122  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540279  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.47 
 
 
827 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.31 
 
 
1022 aa  121  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1058 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 
1131 aa  121  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.1 
 
 
1711 aa  121  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6993  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1159 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.922616  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2093  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.51 
 
 
530 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874358  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1246  histidine kinase  30.07 
 
 
762 aa  120  3.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0124717  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2805  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.25 
 
 
927 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  32.48 
 
 
1133 aa  120  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.22 
 
 
1064 aa  120  3.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3575  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.23 
 
 
735 aa  120  4.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 
701 aa  120  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2365  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 
734 aa  120  6e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.656612  hitchhiker  0.0000890263 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 
631 aa  120  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 
880 aa  120  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2790  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.59 
 
 
592 aa  120  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0688167 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.37 
 
 
721 aa  120  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8878  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 
460 aa  120  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575508  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2145  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 
408 aa  120  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001377 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 
1390 aa  120  7e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 
1390 aa  120  7e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3365  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 
733 aa  119  7.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 
1118 aa  119  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000390432  normal  0.0407868 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4899  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.92 
 
 
607 aa  119  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal  0.0631454 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>