More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2493 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2493  PAS sensor protein  100 
 
 
394 aa  803    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0714891  decreased coverage  0.00496497 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1131  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.95 
 
 
373 aa  347  2e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5317  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.61 
 
 
421 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5555  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.19 
 
 
416 aa  276  4e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.786855  normal  0.0266117 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3554  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.38 
 
 
541 aa  267  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.32039  normal  0.384329 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.83 
 
 
405 aa  254  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  33.67 
 
 
823 aa  213  5.999999999999999e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2761  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 
679 aa  211  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.47205 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1893  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.96 
 
 
644 aa  209  5e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0534  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.84 
 
 
697 aa  196  6e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.608337  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0484  multi-sensor histidine kinase  32.09 
 
 
1255 aa  194  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.908962 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 
1138 aa  184  3e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.84915  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0583  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.34 
 
 
816 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.412959  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 
1291 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 
500 aa  172  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.814589  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1114  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.75 
 
 
373 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.83 
 
 
874 aa  167  2.9999999999999998e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2450  PAS sensor signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 
499 aa  166  5e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 
515 aa  166  8e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.441834  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0285  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
713 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6110  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 
513 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2223  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 
457 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.450879  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2140  fused multi-sensor protein  31.03 
 
 
882 aa  161  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.236911  normal  0.359885 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1522  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 
389 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1495  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 
389 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  38.77 
 
 
1741 aa  158  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.294056 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3714  histidine kinase  37.45 
 
 
438 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248399  hitchhiker  0.000324406 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3675  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.79 
 
 
966 aa  155  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0631  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 
501 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.22133  normal  0.283314 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0288  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 
884 aa  154  2.9999999999999998e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3394  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 
728 aa  153  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.99137  normal  0.249099 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 
832 aa  154  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2042  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
379 aa  154  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.419009  hitchhiker  0.00181161 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4229  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 
383 aa  151  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.599633  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0316  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 
713 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810499  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1907  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.5 
 
 
494 aa  150  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3015  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 
500 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.72 
 
 
534 aa  150  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.311499 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2969  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
634 aa  150  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.163827 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 
1516 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1745  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 
501 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216394  normal  0.830414 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2116  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
524 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6162  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.75 
 
 
673 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30079  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0037  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 
387 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2789  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 
503 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237879  normal  0.0648346 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2370  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.55 
 
 
1433 aa  147  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0399  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.01 
 
 
519 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1343  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.93 
 
 
510 aa  147  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1615  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 
608 aa  145  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2578  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 
527 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376758  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0249  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.61 
 
 
484 aa  145  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.83 
 
 
866 aa  145  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2066  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.47 
 
 
1167 aa  145  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.082343  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1029  Signal transduction histidine kinase  27.83 
 
 
511 aa  144  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3003  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.85 
 
 
498 aa  144  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1364  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.29 
 
 
510 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3829  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.52 
 
 
475 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.821642 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 
979 aa  143  6e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.366427 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2345  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.61 
 
 
509 aa  142  9e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4726  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.61 
 
 
508 aa  142  9e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4177  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.95 
 
 
490 aa  142  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 
1178 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3274  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 
526 aa  140  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  26.77 
 
 
1629 aa  140  4.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0139  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 
1066 aa  139  7e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3892  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 
512 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3806  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 
533 aa  138  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.576691  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0595  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 
752 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1574  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.51 
 
 
841 aa  138  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1826  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.37 
 
 
630 aa  137  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0888009 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2468  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.52 
 
 
1049 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.858637  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2459  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.19 
 
 
514 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.536831 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0578  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.72 
 
 
632 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.177294  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1041  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 
1406 aa  136  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.845277 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4052  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.63 
 
 
513 aa  136  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.7 
 
 
674 aa  136  8e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0618  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 
1484 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3854  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 
386 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.25 
 
 
881 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2613  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.35 
 
 
1166 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2015  putative PAS/PAC sensor protein  27.89 
 
 
1119 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000673901 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1704  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 
1168 aa  134  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1725  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 
499 aa  134  3.9999999999999996e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0066  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 
377 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359193  normal  0.0132857 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 
1043 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1039  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 
1259 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1960  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.59 
 
 
1680 aa  130  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.0344276 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1623  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.13 
 
 
377 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0973  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.53 
 
 
1064 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 
398 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.827775  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3648  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.07 
 
 
1237 aa  130  6e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289797  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0267  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.5 
 
 
631 aa  129  7.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.172451  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2941  putative PAS/PAC sensor protein  27.32 
 
 
1169 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.725686  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3474  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.57 
 
 
836 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1141  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.6 
 
 
520 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2480  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.84 
 
 
846 aa  129  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000921222 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  50.38 
 
 
778 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5621  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 
1258 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879931  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2536  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 
829 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1934  two-component sensor kinase protein  26.17 
 
 
723 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>