More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0316 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0316  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 713 aa  1462    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0285  multi-sensor signal transduction histidine kinase  90.34 
 
 		 713 aa  1315    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1289  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.6 
 
 		 662 aa  240  6.999999999999999e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.64 
 
 		 749 aa  236  9e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.541129  normal  0.358425 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1003  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  50.42 
 
 		 751 aa  236  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.972748  hitchhiker  0.000165551 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2450  PAS sensor signal transduction histidine kinase  35.39 
 
 		 499 aa  224  4e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1756  PAS sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 		 718 aa  223  9e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.977279  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.25 
 
 		 656 aa  216  9.999999999999999e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2352  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.34 
 
 		 760 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1143  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 502 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1703  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 		 368 aa  213  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.301457  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3163  sensory box histidine kinase  32.27 
 
 		 683 aa  209  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4724  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.74 
 
 		 774 aa  201  6e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.960478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1007  sensory box histidine kinase  33.97 
 
 		 812 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.572876  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3605  ATP-binding region, ATPase-like protein  34.66 
 
 		 873 aa  197  6e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0474  sensory box histidine kinase  34.25 
 
 		 821 aa  196  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0174  sensory box histidine kinase  34.25 
 
 		 821 aa  196  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1434  sensory box histidine kinase  34.25 
 
 		 821 aa  196  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0908  sensory box histidine kinase  34.25 
 
 		 723 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0382  sensory box histidine kinase  34.25 
 
 		 723 aa  195  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1934  two-component sensor kinase protein  34.25 
 
 		 723 aa  196  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3146  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 521 aa  195  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0534  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.37 
 
 		 697 aa  195  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.608337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1844  sensory box histidine kinase  34.25 
 
 		 723 aa  195  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1141  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 		 520 aa  192  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2607  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 		 1144 aa  191  2.9999999999999997e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 		 500 aa  191  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.814589  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  29.2 
 
 		 823 aa  190  8e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39 
 
 		 380 aa  189  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3017  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 		 1669 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3211  bacteriophytochrome-like protein  30.27 
 
 		 842 aa  187  8e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.880007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2223  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 457 aa  183  9.000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.450879  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1660  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.94 
 
 		 781 aa  183  9.000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0544  sensory box histidine kinase  32.29 
 
 		 717 aa  182  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0543  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 717 aa  183  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0542  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 		 719 aa  183  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2116  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 		 524 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3487  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 		 717 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 		 534 aa  180  7e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.311499 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3330  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 		 717 aa  180  8e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2774  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 535 aa  178  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1656  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 478 aa  178  3e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.999121 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3948  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 		 717 aa  178  4e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 		 384 aa  177  6e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00811703  normal  0.288098 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1615  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 		 608 aa  175  2.9999999999999996e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.23 
 
 		 1267 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.142245  normal  0.539943 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0631  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 501 aa  174  5.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.22133  normal  0.283314 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.94 
 
 		 717 aa  174  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 		 1140 aa  173  7.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3766  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 		 717 aa  172  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6522  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.49 
 
 		 556 aa  171  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0707299 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3822  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 		 717 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.834811  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1745  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 		 501 aa  171  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216394  normal  0.830414 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1419  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 		 831 aa  171  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1212  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 		 458 aa  171  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.377857  hitchhiker  0.00290095 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 712 aa  171  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0547872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2132  bacteriophytochrome-like protein  34.78 
 
 		 727 aa  171  4e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.205555  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 681 aa  170  8e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0484  multi-sensor histidine kinase  29.95 
 
 		 1255 aa  170  9e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.908962 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3323  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 		 445 aa  168  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2410  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.07 
 
 		 628 aa  169  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5360  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 		 515 aa  169  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.183815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2911  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 642 aa  168  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 1291 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0291  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.76 
 
 		 543 aa  168  4e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.808463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5112  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 1252 aa  168  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.758591 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 960 aa  167  5.9999999999999996e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3024  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 		 572 aa  167  6.9999999999999995e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2179  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 710 aa  167  6.9999999999999995e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.312055 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1286  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.25 
 
 		 859 aa  166  9e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2461  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 		 575 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1907  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 		 494 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1862  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 869 aa  166  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.557725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2195  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 		 502 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.067402 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2733  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.29 
 
 		 527 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.219338  normal  0.282473 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 		 515 aa  166  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.441834  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2719  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.29 
 
 		 527 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.521326 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.29 
 
 		 527 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.151228  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1131  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 		 373 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3507  PAS sensor protein  31.78 
 
 		 512 aa  165  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2998  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.59 
 
 		 391 aa  165  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  29.74 
 
 		 1629 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 		 604 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1447  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.64 
 
 		 1028 aa  164  5.0000000000000005e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.722583  unclonable  0.0000177894 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2024  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.41 
 
 		 517 aa  164  6e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0399  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.61 
 
 		 519 aa  164  6e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0009  sensory box histidine kinase  29.19 
 
 		 499 aa  164  7e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3765  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 		 562 aa  163  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.13531 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2042  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.61 
 
 		 379 aa  163  9e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.419009  hitchhiker  0.00181161 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1343  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 510 aa  163  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1953  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.24 
 
 		 632 aa  163  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3814  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 		 515 aa  162  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0790  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.98 
 
 		 566 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22960  bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)  36.19 
 
 		 552 aa  162  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.282071 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0667  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.17 
 
 		 929 aa  162  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2140  fused multi-sensor protein  30.89 
 
 		 882 aa  162  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.236911  normal  0.359885 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2077  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein (sensor for arcA)  30.13 
 
 		 492 aa  162  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0651522  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3274  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 		 526 aa  161  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.6 
 
 		 817 aa  161  4e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.34 
 
 		 874 aa  161  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>