More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2539 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
681 aa  1363    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1703  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  42.15 
 
 
368 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.301457  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2461  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.81 
 
 
575 aa  275  3e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3017  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.02 
 
 
1669 aa  272  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0994  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.83 
 
 
640 aa  268  2e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.620121  normal  0.0418978 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4329  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.83 
 
 
683 aa  265  2e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.213628  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2002  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.41 
 
 
761 aa  265  2e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.897805  normal  0.398669 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50.77 
 
 
380 aa  264  3e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0790  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.39 
 
 
566 aa  263  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391268  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2280  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.51 
 
 
821 aa  261  3e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2410  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.24 
 
 
628 aa  261  4e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1007  sensory box histidine kinase  50.74 
 
 
812 aa  259  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.572876  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0667  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.04 
 
 
929 aa  259  2e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.76 
 
 
1267 aa  259  2e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.142245  normal  0.539943 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4345  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 
890 aa  257  4e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5665  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.41 
 
 
626 aa  257  6e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2827  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.25 
 
 
1064 aa  256  8e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4064  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.9 
 
 
639 aa  256  9e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.12518  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1934  two-component sensor kinase protein  51.72 
 
 
723 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0908  sensory box histidine kinase  51.72 
 
 
723 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0382  sensory box histidine kinase  51.72 
 
 
723 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1844  sensory box histidine kinase  51.72 
 
 
723 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1434  sensory box histidine kinase  51.72 
 
 
821 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0474  sensory box histidine kinase  51.72 
 
 
821 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0174  sensory box histidine kinase  51.72 
 
 
821 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1143  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.8 
 
 
502 aa  254  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36757  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1656  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 
478 aa  253  8.000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.999121 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.69 
 
 
817 aa  251  3e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.16 
 
 
960 aa  249  1e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2179  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.33 
 
 
710 aa  248  2e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.312055 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2049  histidine kinase  49.8 
 
 
494 aa  248  3e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.43 
 
 
361 aa  248  3e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.121387  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.46 
 
 
883 aa  247  4.9999999999999997e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8461  Bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)-like protein  52.05 
 
 
528 aa  246  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3852  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  50.21 
 
 
765 aa  245  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51 
 
 
1195 aa  245  1.9999999999999999e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1660  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.36 
 
 
781 aa  244  3e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.12 
 
 
793 aa  244  3e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1725  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.16 
 
 
407 aa  244  3e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1125  histidine kinase  52.42 
 
 
564 aa  244  5e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3297  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.67 
 
 
838 aa  243  6e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2774  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.71 
 
 
535 aa  243  1e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5360  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.8 
 
 
515 aa  242  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.183815  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2988  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.67 
 
 
529 aa  241  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.633654  normal  0.687189 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4114  histidine kinase  50.21 
 
 
268 aa  241  2.9999999999999997e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0596823  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2911  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.43 
 
 
642 aa  241  2.9999999999999997e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0970  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.64 
 
 
729 aa  240  5.999999999999999e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5034  histidine kinase  50.43 
 
 
498 aa  240  8e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2062  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.54 
 
 
951 aa  239  1e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.275424  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2907  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.3 
 
 
520 aa  238  2e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4111  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.95 
 
 
760 aa  238  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.95 
 
 
760 aa  238  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5232  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.02 
 
 
698 aa  236  9e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0291  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.19 
 
 
543 aa  236  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.808463 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3954  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.7 
 
 
792 aa  236  1.0000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22960  bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)  49.18 
 
 
552 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.282071 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0035  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.79 
 
 
769 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.1 
 
 
674 aa  234  3e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.61 
 
 
767 aa  234  3e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.26 
 
 
527 aa  234  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.151228  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2719  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.26 
 
 
527 aa  234  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.521326 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2733  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.26 
 
 
527 aa  234  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.219338  normal  0.282473 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0323  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.82 
 
 
789 aa  234  5e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.179581  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4119  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.46 
 
 
380 aa  234  5e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4101  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.59 
 
 
786 aa  234  5e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.36 
 
 
553 aa  233  9e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.199199  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.38 
 
 
532 aa  233  1e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.030472 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3150  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.59 
 
 
408 aa  231  3e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3269  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.25 
 
 
529 aa  231  4e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.481885  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2818  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.79 
 
 
769 aa  230  5e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0945314 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0443  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.91 
 
 
641 aa  230  7e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.324888 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1264  histidine kinase  49.81 
 
 
421 aa  230  7e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.557954  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.59 
 
 
1140 aa  230  7e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1083  GAF sensor signal transduction histidine kinase  48.58 
 
 
973 aa  230  8e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1875  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  42.95 
 
 
501 aa  229  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2998  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.81 
 
 
391 aa  228  3e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6522  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.39 
 
 
556 aa  228  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0707299 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.02 
 
 
551 aa  226  9e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2215  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.76 
 
 
810 aa  226  1e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3424  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.49 
 
 
450 aa  225  2e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01275  putative two-component sensor histidine kinase  46.89 
 
 
503 aa  225  3e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.590202  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.04 
 
 
770 aa  223  8e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3188  GAF sensor signal transduction histidine kinase  48.33 
 
 
810 aa  222  1.9999999999999999e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3485  histidine kinase  43.75 
 
 
565 aa  222  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5844  Bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)-like protein  48.13 
 
 
529 aa  221  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.533062 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0255  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 
525 aa  221  3e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5112  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.94 
 
 
1252 aa  221  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.758591 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0519  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.2 
 
 
1532 aa  221  3.9999999999999997e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2531  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.88 
 
 
880 aa  219  1e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.39 
 
 
1359 aa  219  2e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.19 
 
 
385 aa  219  2e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34075  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1080  GAF sensor signal transduction histidine kinase  48.46 
 
 
1128 aa  218  4e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3820  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 
881 aa  217  5.9999999999999996e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2216  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.1 
 
 
458 aa  217  7e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.247022  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1994  histidine kinase  43.68 
 
 
387 aa  216  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.376445  hitchhiker  0.00440814 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2837  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 
716 aa  216  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1296  histidine kinase  45.49 
 
 
378 aa  215  2.9999999999999995e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.572141  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1862  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.43 
 
 
869 aa  212  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.557725  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0435  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.67 
 
 
409 aa  212  2e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.77 
 
 
1807 aa  211  2e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.869779  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>