More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2216 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2216  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 458 aa  949    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.247022  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2002  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 		 761 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.897805  normal  0.398669 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0667  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  63.67 
 
 		 929 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2461  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.24 
 
 		 575 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1660  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  59.22 
 
 		 781 aa  298  1e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1656  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.64 
 
 		 478 aa  286  5e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.999121 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3017  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 		 1669 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.12 
 
 		 1267 aa  248  2e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.142245  normal  0.539943 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1703  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  47.51 
 
 		 368 aa  239  8e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.301457  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0994  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.43 
 
 		 640 aa  233  8.000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.620121  normal  0.0418978 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1007  sensory box histidine kinase  38.98 
 
 		 812 aa  225  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.572876  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.13 
 
 		 793 aa  220  3e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2179  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.81 
 
 		 710 aa  221  3e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.312055 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 		 361 aa  220  3.9999999999999997e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.121387  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0908  sensory box histidine kinase  39.65 
 
 		 723 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0382  sensory box histidine kinase  39.65 
 
 		 723 aa  219  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1934  two-component sensor kinase protein  39.65 
 
 		 723 aa  219  6e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1844  sensory box histidine kinase  39.65 
 
 		 723 aa  219  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2774  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.25 
 
 		 535 aa  219  1e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0474  sensory box histidine kinase  39.65 
 
 		 821 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0174  sensory box histidine kinase  39.65 
 
 		 821 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1434  sensory box histidine kinase  39.65 
 
 		 821 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1143  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.19 
 
 		 502 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.1 
 
 		 681 aa  217  4e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1083  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.26 
 
 		 973 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4119  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 		 380 aa  213  3.9999999999999995e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.86 
 
 		 1140 aa  212  1e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45 
 
 		 532 aa  211  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.030472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8461  Bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)-like protein  45.97 
 
 		 528 aa  208  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2907  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 		 520 aa  209  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0790  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.72 
 
 		 566 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1264  histidine kinase  43.88 
 
 		 421 aa  206  6e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.557954  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3954  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.21 
 
 		 792 aa  206  8e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 817 aa  206  8e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2911  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.87 
 
 		 642 aa  206  9e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2280  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 		 821 aa  205  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3852  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  44.21 
 
 		 765 aa  205  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 674 aa  204  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 		 770 aa  204  2e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2818  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.86 
 
 		 769 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0945314 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2049  histidine kinase  44.93 
 
 		 494 aa  204  3e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.4 
 
 		 626 aa  204  3e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 767 aa  203  5e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0323  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.69 
 
 		 789 aa  203  5e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.179581  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2998  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.91 
 
 		 391 aa  202  8e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5360  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.71 
 
 		 515 aa  202  9e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.183815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.47 
 
 		 960 aa  202  9.999999999999999e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4345  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 890 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.77 
 
 		 380 aa  201  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 384 aa  200  5e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00811703  normal  0.288098 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0970  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45 
 
 		 729 aa  200  5e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0291  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 543 aa  200  5e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.808463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0035  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.78 
 
 		 769 aa  199  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22960  bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)  42.19 
 
 		 552 aa  199  7e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.282071 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4114  histidine kinase  46.61 
 
 		 268 aa  199  7.999999999999999e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0596823  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2607  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.03 
 
 		 1144 aa  199  9e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1296  histidine kinase  44.12 
 
 		 378 aa  199  1.0000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.572141  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5112  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.05 
 
 		 1252 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.758591 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.21 
 
 		 760 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4111  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.21 
 
 		 760 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.35 
 
 		 553 aa  195  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.199199  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1862  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 		 869 aa  195  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.557725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.51 
 
 		 1195 aa  194  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 		 883 aa  195  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2827  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.95 
 
 		 1064 aa  195  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4329  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.87 
 
 		 683 aa  194  4e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.213628  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4064  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.79 
 
 		 639 aa  193  4e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.12518  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5080  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 		 677 aa  194  4e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4101  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.29 
 
 		 786 aa  194  4e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2606  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  43.28 
 
 		 664 aa  192  7e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.383776  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0519  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.4 
 
 		 1532 aa  192  8e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0443  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.64 
 
 		 641 aa  192  9e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.324888 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0386  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 674 aa  192  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.963585  normal  0.451057 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6522  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 556 aa  191  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0707299 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1125  histidine kinase  43.62 
 
 		 564 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2988  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.67 
 
 		 529 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.633654  normal  0.687189 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 1807 aa  189  9e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.869779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5034  histidine kinase  41.56 
 
 		 498 aa  188  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3046  two-component sensor histidine kinase  29.48 
 
 		 515 aa  187  3e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3846  normal  0.30289 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1875  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  40.68 
 
 		 501 aa  187  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3297  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.52 
 
 		 838 aa  185  1.0000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5079  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 695 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.929766 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5571  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 540 aa  184  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.982003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1237  chemotaxis response regulator (methyltransferase)  30.4 
 
 		 1618 aa  184  3e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2176  histidine kinase  39.18 
 
 		 520 aa  183  6e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.955283 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.57 
 
 		 527 aa  183  7e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.151228  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2733  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.57 
 
 		 527 aa  183  7e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.219338  normal  0.282473 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2719  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.57 
 
 		 527 aa  183  7e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.521326 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3546  sensor protein (histidine protein kinase), acting on arcA  36.19 
 
 		 586 aa  182  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00933538  normal  0.0548176 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3269  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.11 
 
 		 529 aa  181  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.481885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2062  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.39 
 
 		 951 aa  181  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.275424  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2882  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 		 528 aa  181  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1881  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 		 435 aa  181  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.652277 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0255  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.07 
 
 		 525 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3150  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.67 
 
 		 408 aa  180  4.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3436  histidine kinase  38.28 
 
 		 362 aa  180  5.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0262  bacteriophytochrome-like protein  38.49 
 
 		 505 aa  179  8e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.268371 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3917  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 		 683 aa  179  9e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.465717 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1725  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.67 
 
 		 407 aa  179  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2837  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 		 716 aa  179  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>