More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5079 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5079  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 695 aa  1431    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.929766 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  56.1 
 
 		 547 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1559  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  43.84 
 
 		 508 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0906975 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4442  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.75 
 
 		 1267 aa  355  1e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.19 
 
 		 1383 aa  332  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1419  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.06 
 
 		 831 aa  325  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2092  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.56 
 
 		 882 aa  313  7.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3765  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.41 
 
 		 562 aa  300  6e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.13531 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2675  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.62 
 
 		 708 aa  282  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877  normal  0.897929 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3323  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.78 
 
 		 445 aa  253  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2377  hypothetical protein  53.12 
 
 		 425 aa  247  6e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0019  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.23 
 
 		 668 aa  246  9e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0021  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.23 
 
 		 668 aa  246  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2524  hypothetical protein  52.68 
 
 		 425 aa  243  1e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4128  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  39.52 
 
 		 663 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3163  sensory box histidine kinase  37.17 
 
 		 683 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2153  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 		 645 aa  230  6e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1954  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  57.44 
 
 		 468 aa  229  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.424678 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3330  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 717 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2070  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.24 
 
 		 645 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000789609 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1289  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.31 
 
 		 662 aa  222  1.9999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3605  ATP-binding region, ATPase-like protein  33.42 
 
 		 873 aa  216  8e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2084  sensor histidine kinase  42.64 
 
 		 816 aa  216  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 		 793 aa  215  2.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0542  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 		 719 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2165  histidine kinase  43.31 
 
 		 489 aa  214  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2074  sensor histidine kinase  42.25 
 
 		 816 aa  214  4.9999999999999996e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0543  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.95 
 
 		 717 aa  213  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3763  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.48 
 
 		 1255 aa  212  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 		 767 aa  212  2e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3487  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 		 717 aa  211  5e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6177  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.05 
 
 		 422 aa  209  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5027  normal  0.54606 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5224  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 		 374 aa  209  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3299  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.31 
 
 		 757 aa  207  6e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0544  sensory box histidine kinase  33.73 
 
 		 717 aa  206  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3948  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.06 
 
 		 717 aa  203  8e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3822  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.44 
 
 		 717 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.834811  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3766  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.06 
 
 		 717 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.06 
 
 		 717 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2815  sensory box histidine kinase  31.41 
 
 		 749 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3457  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.13 
 
 		 1070 aa  200  6e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 		 674 aa  200  7.999999999999999e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2659  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.82 
 
 		 1070 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.337944  normal  0.276356 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4417  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.48 
 
 		 1548 aa  197  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.409401 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4414  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 		 1166 aa  196  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.107711 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4352  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 		 1166 aa  194  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 		 1267 aa  192  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.142245  normal  0.539943 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.88 
 
 		 1965 aa  192  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7206  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  28.81 
 
 		 1499 aa  190  7e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4345  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  28.73 
 
 		 890 aa  190  9e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3046  two-component sensor histidine kinase  34.22 
 
 		 515 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3846  normal  0.30289 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2216  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 458 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.247022  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2607  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.73 
 
 		 1144 aa  183  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2215  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.93 
 
 		 810 aa  180  5.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1901  two-component sensor histidine kinase  27.8 
 
 		 931 aa  179  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0313083  normal  0.0871787 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3546  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.91 
 
 		 518 aa  177  5e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 		 883 aa  176  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3952  sensor histidine kinase  41.07 
 
 		 594 aa  174  2.9999999999999996e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.173157  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11543  sensory transduction histidine kinase  29.47 
 
 		 952 aa  174  5e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.166055  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.74 
 
 		 749 aa  174  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.541129  normal  0.358425 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3640  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  26.16 
 
 		 1303 aa  174  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.581797 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4101  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 		 786 aa  174  5.999999999999999e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4331  signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 545 aa  173  7.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.364366 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5034  histidine kinase  39.42 
 
 		 498 aa  173  7.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1650  sensory box protein  30.09 
 
 		 819 aa  172  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00487383  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2002  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 761 aa  172  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.897805  normal  0.398669 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 		 941 aa  172  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.109629  normal  0.20707 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0103  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 		 639 aa  172  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0386  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.87 
 
 		 674 aa  171  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.963585  normal  0.451057 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0902  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.68 
 
 		 732 aa  170  6e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.16722  normal  0.0140597 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2786  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 		 496 aa  166  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00094173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.47 
 
 		 770 aa  166  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2077  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein (sensor for arcA)  34.75 
 
 		 492 aa  165  3e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0651522  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  25.47 
 
 		 1629 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2461  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 		 575 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1703  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  36.5 
 
 		 368 aa  164  7e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.301457  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0291  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 		 543 aa  163  8.000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.808463 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2789  sensory box histidine kinase  29.37 
 
 		 770 aa  162  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2014  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 		 904 aa  161  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1003  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  38.11 
 
 		 751 aa  162  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.972748  hitchhiker  0.000165551 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0474  sensory box histidine kinase  31.57 
 
 		 821 aa  161  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1434  sensory box histidine kinase  31.57 
 
 		 821 aa  161  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3860  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  51.03 
 
 		 520 aa  161  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0174  sensory box histidine kinase  31.57 
 
 		 821 aa  161  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 713 aa  161  3e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.908922  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0908  sensory box histidine kinase  31.57 
 
 		 723 aa  161  4e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1844  sensory box histidine kinase  31.57 
 
 		 723 aa  161  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1934  two-component sensor kinase protein  31.57 
 
 		 723 aa  161  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0285  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 		 713 aa  160  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0382  sensory box histidine kinase  31.57 
 
 		 723 aa  160  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 		 380 aa  160  5e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5360  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 		 515 aa  160  6e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.183815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1216  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 		 769 aa  160  6e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.328064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2249  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25.71 
 
 		 771 aa  160  7e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.11 
 
 		 799 aa  160  8e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.190357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1221  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  49.02 
 
 		 532 aa  160  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178023 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.32 
 
 		 1501 aa  159  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4842  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.19 
 
 		 1339 aa  158  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6522  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 		 556 aa  159  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0707299 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1143  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 		 502 aa  159  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36757  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>