More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1270 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
941 aa  1875    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.109629  normal  0.20707 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3744  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  58.47 
 
 
479 aa  284  6.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0408317  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3146  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  56 
 
 
521 aa  273  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1141  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  54.8 
 
 
520 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4352  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 
1166 aa  260  8e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3432  histidine kinase  52.9 
 
 
796 aa  260  8e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4414  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 
1166 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.107711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  54.58 
 
 
553 aa  256  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 
770 aa  256  2.0000000000000002e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1148  sensor histidine kinase  53.31 
 
 
604 aa  252  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2815  sensory box histidine kinase  31.84 
 
 
749 aa  249  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.48 
 
 
748 aa  249  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1796  GAF sensor signal transduction histidine kinase  54.19 
 
 
756 aa  249  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.232536 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2356  phytochrome family protein, putative  53.48 
 
 
755 aa  248  3e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.634458 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  56.6 
 
 
656 aa  248  4e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1956  GAF sensor signal transduction histidine kinase  53.48 
 
 
748 aa  247  6e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727974  normal  0.121547 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1730  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.86 
 
 
591 aa  241  4e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2567  sensor histidine kinase  47.54 
 
 
583 aa  239  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2299  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 
670 aa  239  2e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.465317  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3141  GAF sensor signal transduction histidine kinase  51.57 
 
 
762 aa  234  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583701  normal  0.345899 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4842  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.24 
 
 
1339 aa  235  4.0000000000000004e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2793  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.09 
 
 
763 aa  234  6e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.172208  normal  0.714834 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2811  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.6 
 
 
738 aa  233  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.76 
 
 
725 aa  232  2e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.302229  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3437  sensory box histidine kinase  34.26 
 
 
533 aa  231  5e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0539  GAF sensor signal transduction histidine kinase  54.31 
 
 
751 aa  231  5e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.802089  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.19 
 
 
604 aa  230  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  45.1 
 
 
616 aa  229  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.459436  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2388  sensory box histidine kinase  51.56 
 
 
733 aa  228  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2154  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  48.09 
 
 
572 aa  228  3e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.32555 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04304  two-component system sensor protein  44.08 
 
 
603 aa  227  7e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4420  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.58 
 
 
922 aa  227  9e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0348998  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0011  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.68 
 
 
483 aa  226  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0404114  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2168  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 
828 aa  225  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.419482 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2206  GAF sensor signal transduction histidine kinase  51.88 
 
 
762 aa  224  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15596  normal  0.128973 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00620  two-component system sensor protein  28.08 
 
 
1131 aa  224  6e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282271  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3435  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.37 
 
 
605 aa  224  9e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.188279 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4270  GAF sensor signal transduction histidine kinase  52.16 
 
 
751 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.235212 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2179  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 
710 aa  222  3e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.312055 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2639  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.01 
 
 
396 aa  221  3.9999999999999997e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.717158 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1284  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.34 
 
 
791 aa  220  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2086  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 
798 aa  220  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0947899999999999e-22 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2077  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein (sensor for arcA)  46.25 
 
 
492 aa  219  1e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0651522  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2762  histidine kinase  46.23 
 
 
558 aa  217  7e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2131  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 
810 aa  217  8e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0852026  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2297  sensory box histidine kinase  46.49 
 
 
762 aa  215  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00806153  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2789  sensory box histidine kinase  32.57 
 
 
770 aa  215  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0731  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.75 
 
 
536 aa  213  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000138137  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0009  sensory box histidine kinase  49.42 
 
 
499 aa  212  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3012  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.19 
 
 
556 aa  213  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0214699  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0875  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  48.26 
 
 
368 aa  213  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021337 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3455  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.39 
 
 
472 aa  212  3e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0255  sensory box histidine kinase  47.18 
 
 
616 aa  211  5e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1212  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.43 
 
 
458 aa  210  8e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.377857  hitchhiker  0.00290095 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0822  sensory box histidine kinase  45.6 
 
 
729 aa  209  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2200  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 
678 aa  209  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.541226  hitchhiker  0.00764394 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1286  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.83 
 
 
859 aa  209  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0097  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.33 
 
 
1224 aa  208  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.105547 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3357  sensory box histidine kinase  49.04 
 
 
794 aa  208  4e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2669  sensor histidine kinase  46.56 
 
 
343 aa  207  5e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2014  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.39 
 
 
904 aa  207  8e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3347  sensor histidine kinase  25.12 
 
 
1020 aa  207  8e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0428099 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2567  two component sensor histidine kinase  47.29 
 
 
526 aa  207  9e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3294  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.6 
 
 
714 aa  206  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.523166 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3148  sensor histidine kinase  50.89 
 
 
671 aa  206  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.45 
 
 
1354 aa  206  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1116  Bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)-like protein  45.42 
 
 
496 aa  206  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2571  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.42 
 
 
406 aa  204  5e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.156881 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2024  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.09 
 
 
517 aa  204  6e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1193  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  48.56 
 
 
857 aa  204  7e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146062  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.97 
 
 
778 aa  204  7e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.260825 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01275  putative two-component sensor histidine kinase  40.07 
 
 
503 aa  203  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.590202  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1642  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.02 
 
 
406 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.905013  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4276  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.82 
 
 
779 aa  202  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2770  histidine kinase  48.17 
 
 
418 aa  202  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2195  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.86 
 
 
502 aa  202  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.067402 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1219  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.18 
 
 
396 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000364001 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0666  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.32 
 
 
618 aa  201  5e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4154  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.73 
 
 
493 aa  201  5e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.15 
 
 
604 aa  201  6e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2042  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.56 
 
 
547 aa  201  7e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0504248  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3377  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.34 
 
 
775 aa  200  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1881  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.22 
 
 
435 aa  199  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.652277 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5638  histidine kinase  46 
 
 
540 aa  199  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0010  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.46 
 
 
363 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4197  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.3 
 
 
1562 aa  199  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1145  multi-sensor signal transduction multi-kinase  32.9 
 
 
532 aa  198  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0011  histidine kinase  47.46 
 
 
330 aa  199  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0423  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.13 
 
 
510 aa  198  5.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 
1003 aa  198  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0038  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.79 
 
 
1043 aa  198  5.000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.11404 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1814  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.52 
 
 
566 aa  197  6e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000267062 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3017  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.54 
 
 
1669 aa  197  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0344  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.95 
 
 
730 aa  197  6e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0059666  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2281  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.38 
 
 
891 aa  197  7e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00177504  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1292  histidine kinase  46.09 
 
 
498 aa  197  9e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.0780099999999995e-22 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.94 
 
 
915 aa  196  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2790  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.48 
 
 
463 aa  196  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1036  sensor histidine kinase  45.6 
 
 
579 aa  196  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.696907  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2384  sensor histidine kinase  45.13 
 
 
614 aa  196  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>