More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1881 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1881  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
435 aa  899    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.652277 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  66.9 
 
 
829 aa  383  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.254263  normal  0.520462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4338  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.26 
 
 
430 aa  366  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.743404  decreased coverage  0.000431263 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4322  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  65 
 
 
969 aa  355  1e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  63.14 
 
 
1153 aa  343  2.9999999999999997e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359014  hitchhiker  0.0000017622 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2200  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  67.78 
 
 
678 aa  339  5e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.541226  hitchhiker  0.00764394 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3730  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  56.37 
 
 
978 aa  338  8e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.208606  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3917  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  63.98 
 
 
683 aa  338  9.999999999999999e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.465717 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3713  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  61.42 
 
 
713 aa  331  1e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000481 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3820  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  60.22 
 
 
881 aa  328  8e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2794  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  60.59 
 
 
767 aa  328  9e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.470571 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  67.49 
 
 
809 aa  326  4.0000000000000003e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2176  histidine kinase  64.23 
 
 
520 aa  317  2e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.955283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3100  histidine kinase  49.58 
 
 
573 aa  317  3e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1748  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  57.72 
 
 
550 aa  311  1e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2064  histidine kinase  59.07 
 
 
602 aa  311  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246858  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2168  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  57.36 
 
 
828 aa  304  2.0000000000000002e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.419482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0101  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  54.96 
 
 
1060 aa  293  4e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1178  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  55.95 
 
 
1172 aa  274  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0795  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  54.29 
 
 
911 aa  269  8.999999999999999e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.403179  normal  0.168088 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4011  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.13 
 
 
418 aa  263  4.999999999999999e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.139178  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1676  histidine kinase  52.23 
 
 
881 aa  263  6e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.71 
 
 
799 aa  257  3e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.190357  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0386  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.64 
 
 
674 aa  255  8e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.963585  normal  0.451057 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4599  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.22 
 
 
1029 aa  255  9e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645634  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2410  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.23 
 
 
628 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2882  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  52.33 
 
 
528 aa  251  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2719  histidine kinase  49.79 
 
 
490 aa  247  4e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.369287 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01275  putative two-component sensor histidine kinase  48.39 
 
 
503 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.590202  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0331  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45 
 
 
929 aa  244  3e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.590564 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.43 
 
 
1807 aa  238  1e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.869779  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4154  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.24 
 
 
493 aa  239  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7206  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  44.69 
 
 
1499 aa  237  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0338  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.9 
 
 
568 aa  236  7e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127973  decreased coverage  0.00024777 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6533  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.48 
 
 
636 aa  234  3e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.920736  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0262  bacteriophytochrome-like protein  43.32 
 
 
505 aa  233  4.0000000000000004e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.268371 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0668  histidine kinase  44.44 
 
 
700 aa  233  5e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0742794 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1703  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  42.72 
 
 
368 aa  233  6e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.301457  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3338  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.14 
 
 
526 aa  231  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00782598 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3764  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 
538 aa  230  5e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180542  normal  0.0415669 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2837  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.52 
 
 
716 aa  229  7e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4928  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.15 
 
 
659 aa  229  7e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0222332  normal  0.944106 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1725  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.33 
 
 
407 aa  228  1e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3133  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 
543 aa  229  1e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.863254  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1901  two-component sensor histidine kinase  44.4 
 
 
931 aa  228  2e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0313083  normal  0.0871787 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1215  sensor for regulator EvgA  42.14 
 
 
553 aa  225  1e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0300686  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3150  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.49 
 
 
408 aa  223  4e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1675  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.53 
 
 
558 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0567929 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.42 
 
 
1195 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2911  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.07 
 
 
642 aa  221  3e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0108  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.96 
 
 
827 aa  220  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0394  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 
531 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4842  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
1339 aa  219  7e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4451  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.94 
 
 
775 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4064  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.45 
 
 
639 aa  218  1e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.12518  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2179  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.75 
 
 
710 aa  219  1e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.312055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2687  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.54 
 
 
1013 aa  218  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70216  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1447  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.53 
 
 
1028 aa  216  4e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.722583  unclonable  0.0000177894 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.84 
 
 
532 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.030472 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0994  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 
640 aa  216  7e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.620121  normal  0.0418978 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2512  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.37 
 
 
798 aa  216  7e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.505413  normal  0.958019 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0899  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.28 
 
 
491 aa  216  8e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0517319 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1934  two-component sensor kinase protein  35.29 
 
 
723 aa  216  8e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3789  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.08 
 
 
828 aa  215  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.725659  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0908  sensory box histidine kinase  41.22 
 
 
723 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0382  sensory box histidine kinase  41.22 
 
 
723 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1844  sensory box histidine kinase  41.22 
 
 
723 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2403  ATP-binding region, ATPase-like  45.53 
 
 
776 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0308443 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0474  sensory box histidine kinase  41.22 
 
 
821 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0174  sensory box histidine kinase  41.22 
 
 
821 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.92 
 
 
361 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.121387  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3745  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.75 
 
 
1010 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.412805  hitchhiker  0.00597184 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.7 
 
 
1140 aa  214  1.9999999999999998e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1434  sensory box histidine kinase  41.22 
 
 
821 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1007  sensory box histidine kinase  35.03 
 
 
812 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.572876  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0780  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.9 
 
 
774 aa  213  3.9999999999999995e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00413354  normal  0.0431838 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0991  histidine kinase  45.64 
 
 
462 aa  212  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2280  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.22 
 
 
821 aa  210  4e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1036  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.07 
 
 
527 aa  210  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.95 
 
 
681 aa  210  5e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.39 
 
 
817 aa  209  6e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 
793 aa  209  6e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1862  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 
869 aa  209  8e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.557725  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3355  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.68 
 
 
405 aa  209  9e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0970  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.42 
 
 
729 aa  208  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.28 
 
 
883 aa  209  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2002  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.8 
 
 
761 aa  208  1e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.897805  normal  0.398669 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3546  sensor protein (histidine protein kinase), acting on arcA  41.16 
 
 
586 aa  209  1e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00933538  normal  0.0548176 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.16 
 
 
626 aa  208  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2049  histidine kinase  41.52 
 
 
494 aa  207  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2827  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.82 
 
 
1064 aa  208  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1663  sensor for ctr capsule biosynthesis, histidine kinase acting on RcsB  40.28 
 
 
1093 aa  208  2e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.749752  normal  0.503363 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.73 
 
 
674 aa  207  3e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1656  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 
478 aa  207  3e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.999121 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3424  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.16 
 
 
450 aa  207  3e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2215  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.99 
 
 
810 aa  207  4e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4119  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.89 
 
 
380 aa  207  4e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3360  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.94 
 
 
1068 aa  207  4e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3954  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.98 
 
 
792 aa  206  5e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2062  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 
951 aa  206  8e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.275424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>