More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3133 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3133  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
543 aa  1120    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.863254  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1215  sensor for regulator EvgA  41.3 
 
 
553 aa  432  1e-120  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0300686  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3764  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 
538 aa  353  5e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180542  normal  0.0415669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1675  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 
558 aa  294  3e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0567929 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 
1118 aa  244  3e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000390432  normal  0.0407868 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1881  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 
435 aa  229  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.652277 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3360  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 
1068 aa  226  8e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3640  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  34.78 
 
 
1303 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.581797 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2512  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 
798 aa  220  6e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.505413  normal  0.958019 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3820  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 
881 aa  218  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2200  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 
678 aa  217  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.541226  hitchhiker  0.00764394 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7206  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.11 
 
 
1499 aa  217  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0338  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 
568 aa  216  9e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127973  decreased coverage  0.00024777 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2176  histidine kinase  42.86 
 
 
520 aa  214  4.9999999999999996e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.955283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
809 aa  211  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3347  sensor histidine kinase  32.55 
 
 
1020 aa  212  2e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0428099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3713  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.52 
 
 
713 aa  209  9e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000481 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0394  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.25 
 
 
531 aa  207  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1036  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.52 
 
 
527 aa  207  5e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.41 
 
 
829 aa  206  8e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.254263  normal  0.520462 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1237  chemotaxis response regulator (methyltransferase)  40.94 
 
 
1618 aa  206  1e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1901  two-component sensor histidine kinase  32.73 
 
 
931 aa  204  2e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0313083  normal  0.0871787 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3202  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 
896 aa  203  6e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3917  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.41 
 
 
683 aa  203  8e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.465717 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2168  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.85 
 
 
828 aa  202  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.419482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0108  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.6 
 
 
827 aa  202  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4338  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 
430 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.743404  decreased coverage  0.000431263 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0262  bacteriophytochrome-like protein  41.18 
 
 
505 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.268371 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1178  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.85 
 
 
1172 aa  201  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0331  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.68 
 
 
929 aa  200  5e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.590564 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3100  histidine kinase  38.71 
 
 
573 aa  200  6e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3730  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.15 
 
 
978 aa  200  6e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.208606  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.18 
 
 
571 aa  200  7e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0945672  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2687  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.68 
 
 
1013 aa  199  9e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70216  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
799 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.190357  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3745  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.51 
 
 
1010 aa  199  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.412805  hitchhiker  0.00597184 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4420  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 
922 aa  197  5.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0348998  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0795  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.14 
 
 
911 aa  197  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.403179  normal  0.168088 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2794  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 
767 aa  196  6e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.470571 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1663  sensor for ctr capsule biosynthesis, histidine kinase acting on RcsB  33.5 
 
 
1093 aa  197  6e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.749752  normal  0.503363 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0101  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.83 
 
 
1060 aa  196  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2410  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.37 
 
 
628 aa  195  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.38 
 
 
1807 aa  194  3e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.869779  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3546  sensor protein (histidine protein kinase), acting on arcA  40.07 
 
 
586 aa  193  5e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00933538  normal  0.0548176 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4322  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.59 
 
 
969 aa  193  5e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01275  putative two-component sensor histidine kinase  41.28 
 
 
503 aa  192  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.590202  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2064  histidine kinase  42.74 
 
 
602 aa  191  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246858  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1748  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.51 
 
 
550 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 
960 aa  191  2.9999999999999997e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4154  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.85 
 
 
493 aa  191  4e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4842  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.7 
 
 
1339 aa  190  5.999999999999999e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.93 
 
 
681 aa  189  8e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3017  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 
1669 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1067  sensor histidine kinase  40.16 
 
 
666 aa  188  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1676  histidine kinase  40.54 
 
 
881 aa  187  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3355  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.12 
 
 
405 aa  187  3e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0386  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.2 
 
 
674 aa  187  5e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.963585  normal  0.451057 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2684  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.42 
 
 
506 aa  186  9e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546822  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3185  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 
762 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.97115  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1703  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 
368 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.301457  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2837  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.37 
 
 
716 aa  185  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2316  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.36 
 
 
594 aa  184  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.574326  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1371  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 
516 aa  184  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768214  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2719  histidine kinase  39.53 
 
 
490 aa  184  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.369287 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 
1153 aa  184  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359014  hitchhiker  0.0000017622 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2827  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 
1064 aa  184  5.0000000000000004e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2911  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.72 
 
 
642 aa  182  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2280  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 
821 aa  182  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1725  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 
407 aa  182  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5080  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 
677 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4599  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.69 
 
 
1029 aa  181  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645634  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0324  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.57 
 
 
424 aa  181  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.046409  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.36 
 
 
1140 aa  181  4e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3789  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.55 
 
 
828 aa  179  9e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.725659  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2882  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.26 
 
 
528 aa  179  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3954  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.42 
 
 
792 aa  178  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4114  histidine kinase  38.02 
 
 
268 aa  178  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0596823  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0668  histidine kinase  39.13 
 
 
700 aa  177  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0742794 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0970  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.29 
 
 
729 aa  177  5e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 
767 aa  177  5e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 
551 aa  177  5e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 
553 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.199199  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 
770 aa  176  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1844  sensory box histidine kinase  36.53 
 
 
723 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0908  sensory box histidine kinase  36.53 
 
 
723 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0382  sensory box histidine kinase  36.53 
 
 
723 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4329  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.15 
 
 
683 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.213628  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4451  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.18 
 
 
775 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1434  sensory box histidine kinase  36.53 
 
 
821 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0991  histidine kinase  40.39 
 
 
462 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4928  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 
659 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0222332  normal  0.944106 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3150  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 
408 aa  175  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1447  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
1028 aa  175  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.722583  unclonable  0.0000177894 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1862  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.08 
 
 
869 aa  175  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.557725  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0474  sensory box histidine kinase  36.53 
 
 
821 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0174  sensory box histidine kinase  36.53 
 
 
821 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1934  two-component sensor kinase protein  36.53 
 
 
723 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3338  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 
526 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00782598 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 
361 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.121387  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2403  ATP-binding region, ATPase-like  39.26 
 
 
776 aa  174  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0308443 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>