More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6533 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_6533  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
636 aa  1292    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.920736  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0795  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.28 
 
 
911 aa  438  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.403179  normal  0.168088 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1676  histidine kinase  39.91 
 
 
881 aa  406  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2882  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.56 
 
 
528 aa  395  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1178  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 
1172 aa  391  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0101  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.98 
 
 
1060 aa  382  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4599  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 
1029 aa  359  8e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645634  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0386  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.99 
 
 
674 aa  277  4e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.963585  normal  0.451057 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2176  histidine kinase  41.95 
 
 
520 aa  275  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.955283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2064  histidine kinase  45.31 
 
 
602 aa  271  2.9999999999999997e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246858  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3100  histidine kinase  42.47 
 
 
573 aa  261  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2410  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.39 
 
 
628 aa  259  8e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1881  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50.58 
 
 
435 aa  240  5e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.652277 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.81 
 
 
829 aa  239  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.254263  normal  0.520462 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3820  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.22 
 
 
881 aa  238  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  54.32 
 
 
809 aa  235  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3730  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.8 
 
 
978 aa  236  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.208606  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.15 
 
 
1153 aa  234  4.0000000000000004e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359014  hitchhiker  0.0000017622 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2794  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.76 
 
 
767 aa  233  8.000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.470571 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3713  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.46 
 
 
713 aa  229  9e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000481 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.15 
 
 
1807 aa  223  6e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.869779  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2168  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.52 
 
 
828 aa  223  7e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.419482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3338  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.32 
 
 
526 aa  223  9e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00782598 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4322  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.42 
 
 
969 aa  223  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2200  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 
678 aa  220  7e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.541226  hitchhiker  0.00764394 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3917  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.57 
 
 
683 aa  216  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.465717 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7206  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  44.14 
 
 
1499 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1862  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 
869 aa  214  2.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.557725  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0899  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.66 
 
 
491 aa  209  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0517319 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01275  putative two-component sensor histidine kinase  43.85 
 
 
503 aa  209  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.590202  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2280  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 
821 aa  207  3e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 
817 aa  207  4e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4842  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
1339 aa  205  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 
1267 aa  205  3e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.142245  normal  0.539943 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3360  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 
1068 aa  204  3e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2512  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 
798 aa  204  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.505413  normal  0.958019 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1660  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.73 
 
 
781 aa  204  4e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3297  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 
838 aa  204  5e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1036  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 
527 aa  201  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2719  histidine kinase  44.35 
 
 
490 aa  201  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.369287 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 
674 aa  201  3e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3640  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  41.8 
 
 
1303 aa  201  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.581797 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2911  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 
642 aa  200  7.999999999999999e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1901  two-component sensor histidine kinase  33.25 
 
 
931 aa  199  9e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0313083  normal  0.0871787 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4928  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.38 
 
 
659 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0222332  normal  0.944106 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.64 
 
 
799 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.190357  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1748  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 
550 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4154  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.82 
 
 
493 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4338  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.68 
 
 
430 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.743404  decreased coverage  0.000431263 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0668  histidine kinase  43.87 
 
 
700 aa  197  4.0000000000000005e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0742794 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3789  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.23 
 
 
828 aa  197  5.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.725659  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0394  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 
531 aa  195  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1237  chemotaxis response regulator (methyltransferase)  34.91 
 
 
1618 aa  195  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2837  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.77 
 
 
716 aa  195  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4064  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.01 
 
 
639 aa  194  5e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.12518  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0108  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.62 
 
 
827 aa  192  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0338  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 
568 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127973  decreased coverage  0.00024777 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.08 
 
 
1118 aa  191  4e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000390432  normal  0.0407868 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2789  sensory box histidine kinase  27.67 
 
 
770 aa  190  7e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0991  histidine kinase  41.73 
 
 
462 aa  190  8e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3745  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.9 
 
 
1010 aa  189  9e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.412805  hitchhiker  0.00597184 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0262  bacteriophytochrome-like protein  41.02 
 
 
505 aa  190  9e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.268371 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.53 
 
 
571 aa  188  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0945672  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0324  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.47 
 
 
424 aa  188  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.046409  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3764  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.02 
 
 
538 aa  187  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180542  normal  0.0415669 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2827  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 
1064 aa  187  5e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1663  sensor for ctr capsule biosynthesis, histidine kinase acting on RcsB  40.07 
 
 
1093 aa  187  6e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.749752  normal  0.503363 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4479  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.55 
 
 
502 aa  186  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.34 
 
 
681 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1215  sensor for regulator EvgA  41.5 
 
 
553 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0300686  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.46 
 
 
793 aa  184  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4101  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 
786 aa  184  4.0000000000000006e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3546  sensor protein (histidine protein kinase), acting on arcA  38.43 
 
 
586 aa  184  6e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00933538  normal  0.0548176 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0780  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.64 
 
 
774 aa  182  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00413354  normal  0.0431838 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3017  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.59 
 
 
1669 aa  182  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2687  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.69 
 
 
1013 aa  182  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70216  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3425  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.93 
 
 
775 aa  182  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0531418  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0331  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.68 
 
 
929 aa  181  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.590564 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1447  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.18 
 
 
1028 aa  182  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.722583  unclonable  0.0000177894 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3202  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.52 
 
 
896 aa  181  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.64 
 
 
361 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.121387  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.84 
 
 
799 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721204  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.51 
 
 
767 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.23 
 
 
626 aa  181  4e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4451  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.15 
 
 
775 aa  181  4e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3185  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 
762 aa  180  5.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.97115  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3347  sensor histidine kinase  30.92 
 
 
1020 aa  180  5.999999999999999e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0428099 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1703  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  43.4 
 
 
368 aa  180  7e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.301457  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.62 
 
 
883 aa  180  8e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 
1195 aa  179  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4119  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.15 
 
 
380 aa  179  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 
1140 aa  178  3e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3133  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 
543 aa  177  4e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.863254  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3744  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 
502 aa  177  4e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.59 
 
 
960 aa  177  4e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3355  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.21 
 
 
405 aa  177  5e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5080  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.41 
 
 
677 aa  177  6e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3270  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.48 
 
 
796 aa  176  9e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.498059 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1656  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 
478 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.999121 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2084  sensor for ctr capsule biosynthesis; sensor histidine kinase  38.06 
 
 
660 aa  176  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>