More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4479 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4479  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
502 aa  1016    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3744  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  57.43 
 
 
502 aa  591  1e-167  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3823  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.85 
 
 
498 aa  368  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177602  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1748  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 
550 aa  332  7.000000000000001e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1663  sensor for ctr capsule biosynthesis, histidine kinase acting on RcsB  34.94 
 
 
1093 aa  310  4e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.749752  normal  0.503363 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2084  sensor for ctr capsule biosynthesis; sensor histidine kinase  41.24 
 
 
660 aa  301  2e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0108  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.53 
 
 
827 aa  290  3e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4420  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 
922 aa  281  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0348998  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4322  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.02 
 
 
969 aa  267  2.9999999999999995e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3202  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.19 
 
 
896 aa  252  1e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3347  sensor histidine kinase  40.25 
 
 
1020 aa  249  9e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0428099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 
809 aa  242  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3820  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 
881 aa  239  9e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0338  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 
568 aa  236  7e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127973  decreased coverage  0.00024777 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 
626 aa  235  1.0000000000000001e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3713  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.06 
 
 
713 aa  234  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000481 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2684  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.18 
 
 
506 aa  233  9e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546822  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0323  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 
789 aa  226  1e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.179581  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.7 
 
 
571 aa  224  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0945672  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3730  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.84 
 
 
978 aa  224  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.208606  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1901  two-component sensor histidine kinase  33.41 
 
 
931 aa  216  9e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0313083  normal  0.0871787 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2410  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 
628 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3640  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  32.79 
 
 
1303 aa  207  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.581797 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1215  sensor for regulator EvgA  39.34 
 
 
553 aa  207  5e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0300686  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2316  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 
594 aa  201  3e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.574326  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7206  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  36.36 
 
 
1499 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2168  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.67 
 
 
828 aa  197  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.419482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.41 
 
 
1118 aa  196  7e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000390432  normal  0.0407868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2687  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.91 
 
 
1013 aa  196  8.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70216  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3917  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 
683 aa  196  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.465717 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4064  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 
639 aa  194  4e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.12518  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3360  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.81 
 
 
1068 aa  193  6e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3546  sensor protein (histidine protein kinase), acting on arcA  32.07 
 
 
586 aa  192  9e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00933538  normal  0.0548176 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3789  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.72 
 
 
828 aa  192  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.725659  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 
1140 aa  192  1e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4928  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.62 
 
 
659 aa  192  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0222332  normal  0.944106 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2002  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 
761 aa  190  5.999999999999999e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.897805  normal  0.398669 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3780  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.15 
 
 
779 aa  190  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.689927  normal  0.970382 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 
1807 aa  189  7e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.869779  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1881  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.31 
 
 
435 aa  189  7e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.652277 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 
883 aa  189  9e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0386  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.3 
 
 
674 aa  189  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.963585  normal  0.451057 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 
1195 aa  189  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3745  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 
1010 aa  189  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.412805  hitchhiker  0.00597184 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2827  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 
1064 aa  188  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4101  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 
786 aa  188  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0667  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 
929 aa  187  3e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2280  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 
821 aa  187  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1036  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 
527 aa  187  5e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1875  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 
501 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2512  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 
798 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.505413  normal  0.958019 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 
767 aa  184  4.0000000000000006e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0991  histidine kinase  39.11 
 
 
462 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
532 aa  183  7e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.030472 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1178  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.98 
 
 
1172 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3425  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 
775 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0531418  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2200  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.62 
 
 
678 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.541226  hitchhiker  0.00764394 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3338  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.76 
 
 
526 aa  181  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00782598 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2403  ATP-binding region, ATPase-like  37.7 
 
 
776 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0308443 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0795  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.46 
 
 
911 aa  181  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.403179  normal  0.168088 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4842  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 
1339 aa  180  4e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4329  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.02 
 
 
683 aa  180  4.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.213628  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2911  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 
642 aa  179  8e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3355  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.94 
 
 
405 aa  179  9e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3764  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.06 
 
 
538 aa  179  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180542  normal  0.0415669 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4451  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 
775 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6533  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.19 
 
 
636 aa  178  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.920736  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 
817 aa  178  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
799 aa  177  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721204  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4154  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.19 
 
 
493 aa  177  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 
793 aa  177  4e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2794  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.2 
 
 
767 aa  177  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.470571 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2215  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.02 
 
 
810 aa  177  4e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3150  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 
408 aa  177  4e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.6 
 
 
829 aa  177  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.254263  normal  0.520462 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0394  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 
531 aa  177  6e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22960  bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)  39 
 
 
552 aa  176  6e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.282071 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0435  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 
409 aa  176  9e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0101  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 
1060 aa  176  9e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4114  histidine kinase  33.72 
 
 
268 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0596823  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1447  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.21 
 
 
1028 aa  175  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.722583  unclonable  0.0000177894 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2837  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 
716 aa  175  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3954  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 
792 aa  175  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5232  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 
698 aa  174  3.9999999999999995e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0262  bacteriophytochrome-like protein  36.22 
 
 
505 aa  174  3.9999999999999995e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.268371 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1862  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 
869 aa  174  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.557725  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6522  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.74 
 
 
556 aa  173  5.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0707299 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3100  histidine kinase  33.99 
 
 
573 aa  173  6.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.11 
 
 
1359 aa  173  7.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01275  putative two-component sensor histidine kinase  36.98 
 
 
503 aa  173  7.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.590202  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1067  sensor histidine kinase  33.55 
 
 
666 aa  172  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0970  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 
729 aa  172  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2907  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 
520 aa  171  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5034  histidine kinase  36.89 
 
 
498 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4599  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 
1029 aa  171  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645634  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 
799 aa  171  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.190357  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1125  histidine kinase  37.55 
 
 
564 aa  171  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0291  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
543 aa  170  6e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.808463 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0668  histidine kinase  37.08 
 
 
700 aa  168  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0742794 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2733  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 
527 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.219338  normal  0.282473 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>