More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3323 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3323  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 445 aa  915    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1419  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 		 831 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1559  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  35.97 
 
 		 508 aa  268  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0906975 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5079  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.78 
 
 		 695 aa  253  6e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.929766 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4442  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.85 
 
 		 1267 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 		 1383 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3765  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.56 
 
 		 562 aa  226  6e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.13531 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3605  ATP-binding region, ATPase-like protein  36.44 
 
 		 873 aa  220  3e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1289  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 		 662 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6177  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.72 
 
 		 422 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5027  normal  0.54606 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3163  sensory box histidine kinase  35.45 
 
 		 683 aa  213  7e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5224  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 		 374 aa  212  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0543  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 		 717 aa  207  3e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3330  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 		 717 aa  205  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3487  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 717 aa  205  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3948  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 		 717 aa  202  8e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2377  hypothetical protein  38.38 
 
 		 425 aa  202  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 		 717 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3766  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 		 717 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2524  hypothetical protein  38.38 
 
 		 425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3822  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.42 
 
 		 717 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.834811  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0542  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 		 719 aa  199  6e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0544  sensory box histidine kinase  33.51 
 
 		 717 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3299  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.42 
 
 		 757 aa  189  7e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2165  histidine kinase  44.44 
 
 		 489 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3546  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 518 aa  179  7e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1703  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 		 368 aa  172  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.301457  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1216  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 769 aa  169  7e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.328064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0316  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 		 713 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810499  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2084  sensor histidine kinase  37.73 
 
 		 816 aa  166  5.9999999999999996e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2074  sensor histidine kinase  37.73 
 
 		 816 aa  165  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1997  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.71 
 
 		 592 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.53 
 
 		 384 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00811703  normal  0.288098 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2042  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 		 547 aa  163  7e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0504248  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0285  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 		 713 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 		 793 aa  161  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3046  two-component sensor histidine kinase  35.71 
 
 		 515 aa  160  3e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3846  normal  0.30289 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1143  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 		 502 aa  159  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2336  PAS sensor protein  31.96 
 
 		 350 aa  159  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.870969  normal  0.135011 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5034  histidine kinase  38.24 
 
 		 498 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.82 
 
 		 817 aa  156  9e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2607  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 1144 aa  155  9e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1656  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.43 
 
 		 478 aa  155  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.999121 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.04 
 
 		 770 aa  154  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.46 
 
 		 749 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.541129  normal  0.358425 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2077  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein (sensor for arcA)  29.8 
 
 		 492 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0651522  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3012  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 		 556 aa  153  7e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0214699  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2280  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 		 821 aa  153  7e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3017  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 1669 aa  152  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5360  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 		 515 aa  152  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.183815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1934  two-component sensor kinase protein  29.78 
 
 		 723 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1844  sensory box histidine kinase  29.78 
 
 		 723 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0908  sensory box histidine kinase  29.78 
 
 		 723 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3852  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 		 765 aa  151  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0382  sensory box histidine kinase  29.78 
 
 		 723 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 		 604 aa  150  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0474  sensory box histidine kinase  29.7 
 
 		 821 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 380 aa  150  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1434  sensory box histidine kinase  29.7 
 
 		 821 aa  150  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0174  sensory box histidine kinase  29.7 
 
 		 821 aa  150  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2461  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 		 575 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3952  sensor histidine kinase  36.21 
 
 		 594 aa  149  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.173157  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1371  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.01 
 
 		 516 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768214  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11588  two-component sensor histidine kinase  36.36 
 
 		 403 aa  147  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.339726  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0291  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 		 543 aa  147  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.808463 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8461  Bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)-like protein  34.58 
 
 		 528 aa  146  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2179  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 710 aa  146  6e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.312055 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 		 767 aa  146  9e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2907  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 		 520 aa  145  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11543  sensory transduction histidine kinase  37.24 
 
 		 952 aa  145  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.166055  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2002  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 761 aa  145  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.897805  normal  0.398669 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1007  sensory box histidine kinase  34.13 
 
 		 812 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.572876  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6522  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 		 556 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0707299 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 		 1267 aa  145  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.142245  normal  0.539943 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0790  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 		 566 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3297  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.94 
 
 		 838 aa  144  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 1807 aa  144  3e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.869779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2845  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 545 aa  144  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000115656  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1862  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 869 aa  144  5e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.557725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 		 681 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0323  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 		 789 aa  142  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.179581  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3363  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 		 515 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0667  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 		 929 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1994  histidine kinase  36.36 
 
 		 387 aa  141  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.376445  hitchhiker  0.00440814 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 		 712 aa  140  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0547872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0678  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 		 721 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.146546  normal  0.0234435 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 		 704 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.352611  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0035  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 		 769 aa  140  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2818  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 		 769 aa  139  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0945314 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.39 
 
 		 760 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4111  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.39 
 
 		 760 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2827  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.85 
 
 		 1064 aa  138  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 		 960 aa  138  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 		 553 aa  137  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.199199  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1810  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 		 488 aa  137  4e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.081179 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 		 626 aa  137  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3211  bacteriophytochrome-like protein  27.76 
 
 		 842 aa  137  5e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.880007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3954  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 		 792 aa  137  6.0000000000000005e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4842  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 		 1339 aa  136  7.000000000000001e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2024  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.66 
 
 		 517 aa  136  8e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>