More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3487 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0544  sensory box histidine kinase  80.47 
 
 		 717 aa  1233    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3163  sensory box histidine kinase  56.5 
 
 		 683 aa  768    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3766  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  76.36 
 
 		 717 aa  1155    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0542  multi-sensor signal transduction histidine kinase  90.4 
 
 		 719 aa  1365    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3330  multi-sensor signal transduction histidine kinase  77.2 
 
 		 717 aa  1149    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3822  multi-sensor signal transduction histidine kinase  76.64 
 
 		 717 aa  1157    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.834811  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3948  multi-sensor signal transduction histidine kinase  76.22 
 
 		 717 aa  1154    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  76.22 
 
 		 717 aa  1149    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0543  multi-sensor signal transduction histidine kinase  95.82 
 
 		 717 aa  1412    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3487  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 717 aa  1486    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3211  bacteriophytochrome-like protein  35.56 
 
 		 842 aa  303  8.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.880007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3605  ATP-binding region, ATPase-like protein  34.13 
 
 		 873 aa  281  3e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2962  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.55 
 
 		 869 aa  255  3e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4313  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.4 
 
 		 965 aa  254  5.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.86 
 
 		 869 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1289  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 		 662 aa  242  2e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2786  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 		 496 aa  240  8e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00094173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6177  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.47 
 
 		 422 aa  238  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5027  normal  0.54606 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1419  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 		 831 aa  233  9e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0202  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.18 
 
 		 1054 aa  233  1e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1007  sensory box histidine kinase  37.25 
 
 		 812 aa  233  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.572876  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5224  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.71 
 
 		 374 aa  229  9e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0174  sensory box histidine kinase  36.96 
 
 		 821 aa  229  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1434  sensory box histidine kinase  36.96 
 
 		 821 aa  229  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0908  sensory box histidine kinase  36.96 
 
 		 723 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0382  sensory box histidine kinase  36.96 
 
 		 723 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1844  sensory box histidine kinase  36.96 
 
 		 723 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1934  two-component sensor kinase protein  36.96 
 
 		 723 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0474  sensory box histidine kinase  36.96 
 
 		 821 aa  229  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3765  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 		 562 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.13531 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3299  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 		 757 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2377  hypothetical protein  35.57 
 
 		 425 aa  215  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0551  PAS  34.79 
 
 		 1026 aa  214  5.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.425664 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0484  multi-sensor histidine kinase  33.68 
 
 		 1255 aa  213  7e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.908962 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2524  hypothetical protein  35.28 
 
 		 425 aa  213  9e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1835  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.8 
 
 		 654 aa  213  1e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0773497  normal  0.315507 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5079  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 		 695 aa  211  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.929766 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1559  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  40.81 
 
 		 508 aa  210  9e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0906975 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.25 
 
 		 656 aa  208  3e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2460  histidine kinase  39.29 
 
 		 606 aa  207  4e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1985  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.98 
 
 		 639 aa  207  4e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.267533  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3323  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 445 aa  205  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2249  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  33.07 
 
 		 908 aa  202  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1143  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 		 502 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1851  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  31.93 
 
 		 1301 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0114339  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 		 1383 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3648  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.19 
 
 		 1237 aa  197  6e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1703  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 368 aa  196  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.301457  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3952  sensor histidine kinase  41.74 
 
 		 594 aa  196  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.173157  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1722  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 763 aa  196  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.418059 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4442  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 1267 aa  192  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2084  sensor histidine kinase  42.36 
 
 		 816 aa  191  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2074  sensor histidine kinase  42.36 
 
 		 816 aa  191  5.999999999999999e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0249  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 484 aa  189  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3250  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  30.42 
 
 		 1036 aa  187  7e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1867  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 		 763 aa  187  7e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1411  diguanylate cyclase  33.42 
 
 		 656 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2090  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 		 763 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163656  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2222  diguanylate cyclase  39.02 
 
 		 847 aa  186  1.0000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.162543  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1788  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 763 aa  184  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0316  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 		 713 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1141  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.61 
 
 		 520 aa  182  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0902  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.61 
 
 		 732 aa  182  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.16722  normal  0.0140597 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0285  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 		 713 aa  181  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3146  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 		 521 aa  179  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1756  PAS sensor signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 		 718 aa  178  3e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.977279  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4177  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 		 490 aa  177  5e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 		 1015 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6719  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  28.66 
 
 		 1037 aa  170  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.556524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1216  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 		 769 aa  168  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.328064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3546  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.65 
 
 		 518 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2607  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 		 1144 aa  160  5e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11543  sensory transduction histidine kinase  36.08 
 
 		 952 aa  159  2e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.166055  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3795  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 665 aa  156  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.15018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3794  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  28.2 
 
 		 915 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3975  GGDEF  28.66 
 
 		 523 aa  152  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.456822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5522  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  26.73 
 
 		 1076 aa  151  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.12 
 
 		 1560 aa  151  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3034  putative diguanylate cyclase (GGDEF)/ phosphodiesterase (EAL) with PAS/PAC and Chase sensors  26.19 
 
 		 929 aa  150  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124331  unclonable  0.00000356382 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1623  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 		 377 aa  150  8e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 384 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00811703  normal  0.288098 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2988  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 		 529 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.633654  normal  0.687189 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0300  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 887 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.328128  normal  0.0126688 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1810  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.75 
 
 		 488 aa  148  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.081179 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5080  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 		 677 aa  147  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 770 aa  146  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3028  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.7 
 
 		 1426 aa  146  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.514624  normal  0.437775 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0009  sensory box histidine kinase  30.4 
 
 		 499 aa  146  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2450  PAS sensor signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 		 499 aa  145  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5360  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 515 aa  145  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.183815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 		 712 aa  145  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0547872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0747  signal transduction histidine kinase-like protein  24.09 
 
 		 1287 aa  144  4e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1814  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.12 
 
 		 566 aa  144  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000267062 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2188  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 413 aa  144  6e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 		 704 aa  143  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.352611  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3269  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 		 529 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.481885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2531  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.75 
 
 		 880 aa  142  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5034  histidine kinase  34.58 
 
 		 498 aa  140  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2077  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein (sensor for arcA)  30.5 
 
 		 492 aa  140  7e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0651522  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5112  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 1252 aa  140  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.758591 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>